Page 140 - 《广西植物》2020年第6期
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表 2 PvGGPPS 蛋白的氨基酸组成
Table 2 Amino acid composition of PvGGPPS protein
含量 含量 含量
氨基酸名称 氨基酸名称 氨基酸名称
Content Content Content
Amino acid name Amino acid name Amino acid name
(%) (%) (%)
丙氨酸 13.8 天冬酰胺 3.9 半胱氨酸 1.4
Alanine Asparagine Cysteine
谷氨酸 6.6 组氨酸 2.2 亮氨酸 10.7
Glutamate Histidine Leucine
精氨酸 4.4 天冬氨酸 5.5 谷氨酰胺 2.8
Arginine Aspartic acid Glutamine
甘氨酸 7.2 异亮氨酸 4.1 赖氨酸 5.8
Glycine Isoleucine Lysine
蛋氨酸 4.1 苯丙氨酸 0.3 丝氨酸 1.4
Methionine Phenylalanine Serine
苏氨酸 9.9
Threonine
表 3 PvGGPPS 蛋白亚细胞定位预测
Table 3 Prediction of subcellular localization of PvGGPPS protein
基因名称 亚细胞定位 定位类型
Gene name Subcellular localization Location type
PvGGPPS 基因 叶绿体 胞内>细胞器>叶绿体
PvGGPPS gene Chloroplast Intracellular>Organelle>Chloroplast
图 2 PvGGPPS 功能结构域预测
Fig. 2 Prediction of functional domains of PvGGPPS
致性达 87.03%ꎬ序列中存在异戊烯基焦磷酸合酶
家族的两个富含天冬氨酸的特征性序列:DDxxxxD
和 DDxxD(王中等ꎬ2018)ꎬ分别为位于第 157 到第 图 3 PvGGPPS 蛋白疏水性预测
164 位 的 “ DDLPCMD” 和 第 296 到 第 300 位 的 Fig. 3 Prediction of hydrophobicity of PvGGPPS protein
“DDILD”ꎬ起到底物结合与碳链延伸的功能ꎻ且含
有 1 个 CxxxC 基序(D 为天冬氨酸残基ꎬC 为半胱 果穗、叶和茎中的表达量ꎬ以果穗为参照ꎮ 结果显
氨酸ꎬx 为任意氨基酸残基)(图 7)ꎮ 示 PvGGPPS 基因在 3 个样本中均有不同程度的表
2.3 夏枯草 GGPPS 基因表达分析 达量ꎻ在叶中高表达ꎬ其次是茎ꎬ在果穗中的表达
利用 qPCR 方法检测 PvGGPPS 基因在夏枯草 量最少ꎮ PvGGPPS 基因在叶中的相对表达量是在