Page 148 - 《广西植物》2020年第6期

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图 ２ 烟草 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因的结构
Ｆｉｇ. ２ Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｏｆ ＴＩＲ￣ＮＢＳ ｇｅｎｅ ｉｎ Ｎｉｃｏｔｉａｎａ ａｔｔｅｎｕａｔａ

要的顺式作用元件进行探讨ꎮ 次 是 １、 １０、 １１、 ｓｃａｆｆｏｌｄ００５７７、 ｓｃａｆｆｏｌｄ０１４３５、 ｓｃａｆ￣
ｆｏｌｄ０２０６０ 号染色体分别有 ２ 条 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因ꎻ其
２ 结果与分析 余染色体仅有 １ 条 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因ꎮ
２.３ ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因的结构组成

２.１ ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因家族成员 利用在线网站工具 ＧＳＤＳ 对 ３０ 条烟草 ＴＩＲ￣ＮＢＳ
根据 Ｐｆａｍ 数据库中 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因家族主要 基因家族成员进行基因结构分析ꎬ图 ２ 结果显示ꎬ
含有 ＮＢ￣ＡＲＣ、ＴＩＲ￣ＮＢ￣ＡＲＣ￣ＬＲＲ、ＴＩＲ￣ＮＢ￣ＡＲＣ 功 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因家族外显子数量主要分布在 ３ ~ ８ 之

能域的特征ꎬ通过构建隐马尔可夫模型ꎬ设置 Ｅ￣ 间ꎮ 利用 ｍｅｍｅ 对 ３０ 条烟草 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 蛋白序列进
￣２０
ｖａｌｕｅ 为 １× １０ ꎬ共鉴定到 ２１７ 条基因ꎬ去掉不含 行分析(图 ３)ꎬ发现 ＯＩＴ３９３６０ 所含基序最少ꎬ仅 ６
有 ＴＩＲ￣ＮＢ￣ＡＲＣ 结构的基因ꎬ最终获得 ３０ 条烟草 个基序ꎬ其余所含基序都较多ꎬ最多为 １０ 个ꎮ 说明

ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因ꎮ 该基因家族成员间在功能上可能存在差异ꎮ
２.２ ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因家族的染色体分布 ２.４ ＴＩＲ￣ＮＢＳ 蛋白结构特点、细胞位置和信号肽
对 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因染色体定位分析ꎬ图 １ 结果 对 ３０ 条烟草 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 蛋白的二级结构的预
显示ꎬ３０ 条 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因不均匀地分布在 ２１ 条染 测结果表明ꎬＴＩＲ￣ＮＢＳ 蛋白由 α￣螺旋、延伸链、β￣
色 体 上ꎮ 其 中ꎬ 有 ４ 条 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基 因 在 ｓｃａｆ￣ 转角、无规则卷曲组成ꎮ 其中ꎬＴＩＲ￣ＮＢＳ 蛋白的 α￣
ｆｏｌｄ０１８６６ 上ꎬ数量最多且以串联重复形式出现ꎻ其 螺旋比例最高ꎬ其次是无规则卷曲ꎮ 根据亚细胞定