Page 146 - 《广西植物》2022年第10期
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表 1 构建系统发育树的 ITS 序列信息
Table 1 Informations of ITS sequences used to construct phylogenetic tree
GenBank 登录号 样本名称 标本号 标本来源地
GenBank accession No. Sample name Specimen No. Specimen location
JN053501 孔生胶瘤菌 Carcinomyces polyporina AM20 西班牙 Spain
MZ198241 孔生胶瘤菌 C. polyporina HKAS 115765 中国 China
JN053499 C. effibulatus AM6 西班牙 Spain
KY102550 C. arundinariae CBS: 9931 荷兰 Netherlands
MK659873 C. nordestinensis BRT-317 巴西 Brazil
AF444477 喜润楠考克娃酵母 Kockovaella machilophila CBS: 8607 美国 USA
AF444337 帚状费尔氏酵母 Fellomyces penicillatus CBS: 5492 美国 USA
AF444320 多形拟梗孢酵母 Sterigmatosporidium polymorphum CBS: 8088 美国 USA
KY103412 Fibulobasidium murrhardtense CBS: 9190 荷兰 Netherlands
注: 加粗字体者为本研究新提交序列ꎮ
Note: The bold letters mean the newly submitted.
大似然法 ML( maximum likelihood) 构建系统发育
树ꎬ碱基替代模型为 GTRGAMMAIꎬ其余参数设置
均 为 默 认 值 ( Stamatakisꎬ 2014 )ꎻ 使 用 MEGA
7.0.26 软件基于邻接法 NJ( neighbor joining) 进行
系统发育分析ꎻBootstrap 均重复 1 000 次以获得统
计学支持ꎮ
所选序列的物种名称、来源地及 GenBank 登
录号见表 1ꎮ
分支上从左到右分别为最大似然法(ML)和邻接法(NJ)经
1 000 次重复后的 Bootstrap 支持率ꎮ
2 结果与分析 The Bootstrap percentages (BP) of maximum likelihood (ML) and
neighbor joining (NJ) analyses from 1 000 replicates are shown
respectively from left to right on the major branches resolved.
基于 ITS 序列ꎬ采用最大似然法和邻接法构建
图 1 基于 ITS 序列采用最大似然法
系统发育树ꎬ二者的拓扑结构基本一致ꎬ仅支持率
构建的分子系统发育树
略有差异ꎬ最大似然法构建的系统发育树见图 1ꎬ Fig. 1 Molecular phylogenetic tree based on
ML 和 NJ 的支持率 BP(Bootstrap percentages) 分别 an ITS dataset using maximum likelihood
用 BP 和 BP 表示ꎮ 结果显示ꎬ本研究的序列与来
1
2
自西班牙的孔生胶瘤菌标本 AM20 序列聚在一起ꎬ 近球形ꎬ9.8~12.8 × 8.8 ~ 11.0 μmꎬ具纵向分隔ꎻ小
获得很高支持率( BP = 100ꎬ BP = 100)ꎬ且与包 梗 2 个或 4 个ꎬ长可达 8 μmꎻ担孢子球形至近球
1
2
括模式种 Carcinomyces effibulatus 在内的胶瘤菌属 形ꎬ无色ꎬ(4.8) 5.0 ~ 5.5 (6.0) × (4.5) 4.6 ~ 4.8
1 2 (5.1) μmꎬQ = 1.10 ± 0.01ꎬ可萌发后形成分生孢
物种以高支持率(BP = 99ꎬ BP = 98)聚为一支ꎮ
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基于标本 HKAS 115765 进行的 形 态 特 征 研 子(图 3)ꎮ 有锁状联合ꎮ
究ꎬ结果如下ꎮ 综合形态特征与分子系统学研究结果ꎬ确认
寄生于多孔菌的子实层上(图 2)ꎬ形成半透明 该标本为孔生胶瘤菌:
至透明的胶质状菌瘿ꎬ新鲜时稍具乳白色ꎬ干燥后 Carcinomyces polyporina ( D. A. Reid ) A. M.
变薄膜状ꎬ呈土褐色至黑褐色ꎮ 分生孢子梗与分 Yurkovꎬ 2015
生孢子常见ꎻ分生孢子梗短棒状ꎻ分生孢子长椭圆 = Tremella polyporina D. A. Reidꎬ Trans. Br.
至纺锤形ꎬ光滑ꎬ薄壁ꎬ无色ꎬ(3.5) 4.4 ~ 5.4 (8.0) × Mycol. 1970
(1.5) 2.5~3.0 (4.5) μmꎬQ = 1.80 ± 0.12ꎮ 担子 分布:英国(Reidꎬ 1970ꎻRobertsꎬ 2007)、北美
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