Page 144 - 《广西植物》2023年第2期
P. 144
3 3 8 广 西 植 物 43 卷
胁迫下的表达模式ꎮ 本研究旨在探讨以下问题: 整齐地摆放在水培盘中ꎬ待 2 片子叶展开后开始浇
(1)RcMsc2 蛋白理化性质、结构及物种间的进化 灌 1 / 4 Hoagland 溶液ꎬ每日补充 200 mLꎮ 当幼苗长
关系ꎻ(2) 蓖麻 RcMsc2 基因的组织表达模式及非 至 4 叶龄时ꎬ剪取幼苗的组织(根、茎、子叶和真叶)
生物胁迫下的表达模式ꎻ(3) 蓖麻 RcMsc2 在冷胁 以检测 RcMsc2 基因的组织表达量ꎻ然后分别对其进
迫过程中的潜在功能ꎮ 本研究可为蓖麻的抗低温 行 4 ℃、150 mmolL NaCl、10% PEG 6000 和 100
 ̄1
育种提供潜在的基因资源ꎬ同时也可为解析蓖麻 μmolL ABA 胁迫ꎬ经时间梯度(0、2、4、8、12、24、
 ̄1
RcMsc2 基因在应对冷胁迫方面的调控机制奠定 30、48 h) 处理后采集幼苗的真叶并迅速存于液氮
基础ꎮ 中ꎬ冷冻 24 h 后转移至-70 ℃冰箱备用ꎮ
1.3 RcMsc2 基因的克隆
1 材料与方法 1.3.1 总 RNA 提取和第一链 cDNA 的合成 参照
TM Reagent 试剂盒的说明书操作步骤ꎬ提取
Monzol
1.1 试验材料 4 ℃ 处理 12 h 的蓖麻组织的总 RNAꎬ并检测纯度ꎮ
TM
‘通篦 5 号’ 由通辽市农牧科学研究所提供ꎮ 以提取的 RNA 作为模板ꎬ参照 MonScript RTIII
TM Reagent)、反转 All ̄in ̄One Mix with dsDNas 试剂盒说明书反转录合
植物总 RNA 提取试剂盒( Monzol
TM
录试 剂 盒 ( MonScript RTIII All ̄in ̄One Mix with 成第一链 cDNAꎬ作为克隆 RcMsc2 基因的模板ꎮ
TM 1.3.2 RcMsc2 基因的克隆及测序 根据 NCBI 数据
dsDNas) 购自莫纳生物公司ꎮ T ̄载体 ( pMD 18 ̄T
vector)、限制性内切酶(Bsa I) 和 DNA 连接试剂盒 库公布的 RcMsc2 基因( XP _002521704.1) 的 CDS
(DNA Ligation Kit) 购自宝日医生物公司ꎮ 高保真 区设计引物 RcMsc2 ̄F | RcMsc2 ̄R( 表 1)ꎮ 以蓖麻
PCR 酶(KOD Master Mix)、PCR 产物回收和纯化试 cDNA 为模板ꎬ使用高保真酶( KOD Master Mix) 扩
剂盒购自天根生化科技有限公司ꎮ Maxima Reverse 增 RcMsc2 基因的 CDS 序列ꎬPCR 扩增反应程序:
Transcriptase 和 2X SG Fast qPCR Master Mix 购自赛 94 ℃ 预变性 4 minꎻ 94 ℃ 变性 30 sꎬ 58 ℃ 退火 45
默飞世 尔 科 技 ( 上 海) 公 司ꎮ 大 肠 杆 菌 感 受 态 sꎬ 72 ℃ 延伸 90 sꎬ 35 个循环ꎻ 最后延伸 10 minꎮ
(DH5α)、保真酶(2×Taq Master Mix)、引物合成和 经电泳检测后将符合大小的片段回收ꎬ在 3′端加
测序由生工生物工程(上海)股份有限公司完成ꎮ A 碱基后利用 DNA 纯化试剂盒纯化产物后连接至
1.2 材料处理 T 载体ꎬ将 pMD 18 ̄T ̄RcMsc2 热击转化 DH5αꎬ在
TM
将健康的蓖麻种子消毒后置入适量的无菌水 Kan 培养基上筛选出阳性克隆送至生工生物工程
+
中ꎬ于 30 ℃催芽 3 dꎮ 出芽后将其平均分成 4 份ꎬ并 (上海)股份有限公司测序ꎮ
表 1 本研究所用引物
Table 1 Primers used in this study
引物名称 引物序列(5′ ̄3′) 用途
Primer name Primer sequence(5′ ̄3′) Application
RcMsc2 ̄F TTGACTGGCTTATTGAGGTG 基因克隆
Gene cloning
RcMsc2 ̄R CAACCAACCCCACCAACTGA
RcMsc2 ̄Fx CGAGCACTAATGGGTTTGGA 实时荧光定量分析
RcMsc2 ̄Rx CCATCAATATCCACAATAGGCTC qRT ̄PCR
Actin ̄F TTCCCAGGCATTGCTGATAG
Actin ̄R ACATCTGCTGGAAGGTGCTG
RcMsc2 ̄GFP ̄Fx CAGTGGTCTCACAACATGAATGTATCTGATGAGAA 亚细胞定位
Subcellular localization
RcMsc2 ̄GFP ̄Rx CAGTGGTCTCATACATGACTGAGTCTCTAATAGAA
注: 下划线是 Bsa I 酶切位点ꎬ左侧是保护碱基ꎬ右侧是荧光表达载体的末端同源序列ꎮ
Note: Bottom line is the Bsa I cleavage siteꎬ the left is the protective baseꎬ and the right is the end homologous sequence of the fluorescent
expression vector.
1.4 RcMsc2 蛋白质的生物信息学分析 白序列ꎮ 在 NCBI(https:/ / www.ncbi.nlm.nih.gov)下
借 助 ExPASy ( https: / / web. expasy. org / 载蓖麻的全基因组、蛋白组和注释文件ꎬ将 RcMsc2
translate / )工具将 RcMsc2 基因的编码序列翻译成蛋 蛋白作为靶序列进行本地 BLASTpꎬ以明确 RcMsc2