Page 89 - 《广西植物》2020年第12期
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জজ 番茄ྉᅳᤀᐹႥࣩቂ ᤀᡥዞᅳᡓᓣʗᔠዞࣩቂɯ 果实营养丰富ܦ风 全面的生物信息学分析ᖔ有助于理解病毒如何成
味独特ܦ富含维生素等ᖔ能有效降低消化道癌ܦ前列 功感染宿主ᖔ同时可通过分子手段抑制该基因的
腺癌等多种疾病发生的几率ᖔ是深受人们喜爱的蔬 表达ᖔ从而为以后番茄在防治黄化曲叶病以及抵
菜ᖔ在全世界种植广泛ྉ曹玉鑫等ᖔԡϟऐɯᤥ 随着种 制抗病方面提供参考价值ᤥ
植面积ܦ复种指数不断增加ᖔ各种病害也接踵而至ᤥ
番茄黄化曲叶病作为蔬菜作物生产中最具毁 ϟজ 材料与方法
灭性的病害ᖔ其致病因子是黄化曲叶病病毒ᤥ 属
于双生病毒科ᖔ是一个大型的单 链 ᧕શዶ 病毒家 ϓॹϓ 序列来源
族ᖔ它在重要的经济作物上感染并造成毁灭性疾 利用 શऊା᧧ 数据库获取不同物种病毒基因
病 ྉ ୩ࣼႿ੫ ᪲ ऊᆍࣼᡷᡷ༁ᖔ ϟँँᤃ ɯᤥ 该病菌由烟 粉 虱 ዛࣷ 编码的 ఋʢዶ۪ 氨基酸序列及其他信息ᤥ
ྉାᑕቝᔀ༁ᔽᑕᡷᑕᤦᑕ༁ᔽɯ 传播ᖔ 其病毒可以是单链 ᧕શዶ ϓॹԣ 蛋白质结构分析预测
ྉ༁༁᧕શዶɯɯ或二份Џྉ两个相等ɯ༁༁᧕શዶ 称为 ᧕શዶ ዶ ϟϟ 一级结构জ 通过 ጶᡱᑕ༁ᢃ 平台ᖔ根据 ᔀᑕᡷᔽᔀ
和 ା ྉ ԻᔀʢᤦᔽႿᔽ ᔀᡷ ᑕᖔ ԡϟᎮɯᤥ ᧕શዶ ዶ 编码互补的 ቝࣼᡷᑕᤦᔽᔽᡷᢃ 参数ܦԻᔽቝቝᔀʢቝᑕႿ 方案ܦ ̀ᆍᡱᡱ ᪲ ۼᆍᆍʛ༁
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ዛࣷሕ ᣑࣷሕᖔዛࣷ࿗ ᣑࣷ࿗ 和 ዛࣷጢ ᣑࣷጢɯ 和两个病毒感染的 方案预测蛋白的相对突变性ܦ极性ܦ亲水性ܦ松散
ᨃèྉዛႬϟ ᣑႬϟᖔዛႬ ᣑႬɯ参与反式激活ᖔ复制和反应 性ܦ柔韧性ܦ可及性理化性质等一级结构ᤥ
的方向封装ྉ̀ᑕႿᔀᢃ ᔀᡷ ᑕᖔ ԡϟሕɯᤥ 它们被细分为 ϟ 二级结构জ 通过法国里昂 ऊશ୩ 的 ୩ᨃ۪ᥘዶ
九个属ᖔ该病毒属的成员编码称为 ዛࣷ ᣑࣷ 的致病 软件 ྉ ၤᡷᡷᡱ༁᧥ ᣰ ᣰ Ⴟᡱ༁ᑕ ͱ ᡱʢᑕᤦᔽ ᔽᤦዹᡱ ʢ ᣰ ዹ੫ᔽ ͱ ᤦᔽႿ ᣰ Ⴟᡱ༁ᑕ ᡸ
蛋白ᖔ该 类 转 录 激 活蛋白是能与启动子中特定 ᑕࣼᡷᆍቝᑕᡷ ᡱᥳ ᡱᑕ੫ᔀ ᢉ Ⴟᡱ༁ᑕᡸ༁ᆍᡱቝᑕၤᡷቝɯɯ 预测该基
᧕શዶ 序列结合并激活基因转录反应的蛋白质分 因编码蛋白的二级结构ଫ 利用 ऊା୩ 系统中
子ᖔ其相互作用使许多植物蛋白失活并通过 ऊ᥋末 ୩ᔽ੫Ⴟᑕ۪ጢԡ ༁ᔀʢᔀʢ 平台ྉၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ औऔऔ ዹᤦ༁ ʛᡷࣼ ʛҴ ᣰ
端反式激活结构域反式激活许多宿主基因ྉାᑕᤦࣼ ༁ᔀʢᔽዹᔀ༁ᣰ ୩ᔽ੫Ⴟᑕ۪ ᣰ ɯ 预测沙特番茄黄化曲 叶 病 毒
ᔀᡷ ᑕᖔ ԡϟऐɯᤥ 同时 ఋʢዶ۪ 激活叶肉细胞和原生质 ఋʢዶ۪ 蛋白 信号肽序列 ྉ 李玩生 等ᖔ ԡϟԡɯଫ 利用
体中病毒外壳蛋白ྉऊ۪ɯ 和 ାϟ 运动基因启动子 ୩ዹʢᑕᡷዹၤ ۪ʢᔀʛᔽዹᡷ ۪ʢᆍᡷᔀᔽႿ 在线软件ྉ徐庆刚等ᖔԡϟԡɯ
的表达ᖔ并起到抑制植物组织中 ऊ۪ 启动子的作用 对该基因编码产物进行二硫键结合的预测与分
ྉᑕᢼᔀ༁औᑕʢᑕႿ ᔀᡷ ᑕᖔ ԡԡᎮɯᤥ 谢迎秋等ྉԡԡϟɯ 对棉 析ଫ利用 ऊା୩ 系统中 ఋᥘ̀ᥘᥘ ୩ᔀʢᔀʢ ԡ 平台
花曲叶病病毒 ዛࣷ 功能进行了初步探究ᖔ揭示了 ྉ ၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ औऔऔዹᤦ༁ʛᡷࣼʛҴ ᣰ ༁ᔀʢᔽዹᔀ༁ᣰ ఋᥘ̀ᥘᥘ ᣰ ɯ 进行
ዛࣷ 基因编码的蛋白在寄主植物中反式激活病毒 蛋白跨膜区域的预测ྉ୩ᆍႿႿၤᑕቝቝᔀʢ ᔀᡷ ᑕᖔ ϟँँऐɯᤥ
链基因启动子的奇异现象ᖔ其为研究病毒与植物 ϟሕ 磷酸化位点和糖基化位点预测জ 利用 ऊା୩
间的相互作用的分子机理提供了新依据ᤥ 系统中 શᔀᡷ۪ၤᆍ༁ ሕ ϟ 平台ྉၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ औऔऔዹᤦ༁ʛᡷࣼʛҴ ᣰ
目前国内在番茄抗黄化曲叶病方面ᖔ主要集 ༁ᔀʢᔽዹᔀ༁ᣰ શᔀᡷ۪ၤᆍ༁ɯ以及 શᔀᡷᨃ᥈ᢃዹ ࿗ ԡ 进行蛋白磷
中于抗病基因的研究ᖔ对入侵病毒本身基因方面 酸位点与糖基位点的预测ᤥ
研究较少ᖔ尤其对病毒 ዛࣷ 基因的研究还鲜有报 ϟ࿗ 结构域预测জ શऊା᧧ 中的 ऊ᧕᧕ 数据库ྉၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ
道ᖔ而当今控制番茄黄化曲叶病病毒迫在眉睫ᤥ औऔऔႿዹᤦᔽႿቝႿᔽၤ੫ᆍᣰ ୩ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀᣰ ዹʛʛᣰ औʢᡱ༁ᤦዹ੫ᔽɯ 预测
因此ᖔ完成对 ዛࣷ 基因编码的转录激活蛋白进行 蛋白质功能结构域ᤥ
