Page 141 - 《广西植物》2021年第11期
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ϟϟ 期 李江莹等᧥ 印度血桐与中平树基因组调查及 ୩୩ 分子标记分析 ϟ ँ ԡ ሕ
表 ጇই 印度血桐与中平树中单ܓ双ܓ三ܓ四ܓ五ܓ六核苷酸重复模体部分统计结果
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印度血桐的重复类型 数目 中平树的重复类型 数目
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单核苷酸重复模体 单核苷酸重复模体
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双核苷酸重复模体 双核苷酸重复模体
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三核苷酸重复模体 三核苷酸重复模体
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四核苷酸重复模体 四核苷酸重复模体
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五核苷酸重复模体 五核苷酸重复模体
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六核苷酸重复模体 六核苷酸重复模体
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ዶऊዶఋዶఋ ᣰ ዶఋዶఋ᥈ఋ ሕऐ ዶዶऊዶዶఋ ᣰ ዶఋఋ᥈ఋఋ ऐጢጢ
此ᖔ使用 ۼ᥈୩ 策略对印度血桐与中平树的基因组 种材料的 ୩୩ 分子标记具有显著的碱基偏好性ᖔ
分析有一定的风险和难度ᖔ建议后续的研究采用 其单核苷酸重复模体中 ዶᣰ ఋ 含量均高于 ऊᣰ ᥈ 含
二代测序ྉ ᧧ࣼቝᔽႿᑕɯ 和三代测序ྉ۪ᑕዹାᔽᆍɯ 技术相 量ଫ两种材料中双核苷酸重复模体中含量最高均
结合的策略ᖔ对印度血桐与中平树基因组进行测 为 ዶఋ ᣰ ዶఋᖔ含量最低为 ऊ᥈ ᣰ ऊ᥈ᖔ这可能是甲基化的
序和组装ᖔ此外ᖔ利用 ̀ᔽ᥋ऊ 技术达到染色体水平 ऊ 残基变为 ఋᖔ使得两种核苷酸重复的差异较大
的组装ᖔ多种方法互补ᖔ以期获得两种材料的高质 ྉ周佳煜等ᖔԡϟᎮɯᤥ 有研究认为基因组中低级重
量全基因组图谱ᤥ 复单元较多则表示该物种进化水平较高ᖔ而高级
୩୩ 分子标记具有易操作ܦ多态性高ܦ成本低ܦ 重复单元比例高的物种其进化时间短或变异频率
数量丰富等优点ᤥ 本研究基于印度血桐与中平树 低ྉ于福来等ᖔԡϟँɯᤥ 因此ᖔ在基因组调查测序的
基因组调查数据进行 ୩୩ 分析发现ᖔ印度血桐中 基础上规模化开发与筛选 ୩୩ 分子标记ᖔ为进一
步运用 ୩୩ 标记在物种遗传图谱的构建和遗传多
平均 ጢϟ ᤦᡱ 出现 ϟ 个 ୩୩ᖔ中平树中平均 ሕ࿗ऐ
ᤦᡱ 出现 ϟ 个 ୩୩ᖔ含丰富的重复类型ᖔ结果显示两 样性分析以及 ͐ఋᓂ 定位等方面的研究提供参考ᤥ