Page 132 - 《广西植物》2021年第6期

ँ ऐ ԡ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷
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ᓂɟ᣽᥋֒ᖔ ᓂɟ኏᥋᧧ ᑕႿʛ ᓂɟ኏᥋֒ɯ঎ ఋၤᔀ ੫ᔀႿᔀᡷᔽዹ ༁ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀ ᑕႿʛ ዹᆍႿ༁ᔀʢ׹ᔀʛ ʛᆍቝᑕᔽႿ ዹၤᑕʢᑕዹᡷᔀʢᔽ༁ᡷᔽዹ༁ ᆍ஦ ᡷၤᔀ ቝᔀቝᤦᔀʢ༁ ᔽႿ ᔀᑕዹၤ
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জজ 植物类受体蛋白激酶是植物中一类重要的蛋 而小立碗藓中 ᒦᡥ໧᤹᤬ቴᒦᣞ 家族基因功能很少有报
白激酶ᖔ这些蛋白激酶与动物中受体蛋白激酶的 道ᤥ 小立碗藓ྉ ۗ၊ᡥ໧ዞᅳቂᔠᡙʗᓣᤀᤀᐹ ᡓᐹᡙᓣႥ໧ɯ 是非维管束
分子结构类似ᖔ 由于与其特异结合的胞外信号分 植物中的模式植物ᖔ也是早期登陆陆生植物代表ᤥ
子或配体尚未被鉴定ᖔ因此被称为类受体蛋白激 小立碗藓基因组大小为 ጢϟϟ ᥘᤦᖔ共含 ԰Ꭾ 条染色体
酶ྉʢᔀዹᔀᡱᡷᆍʢ᥋᤟ᔽҴᔀ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ҴᔽႿᑕ༁ᔀᖔ኏ᓂ᣽ɯᤥ 典型的 ኏ᓂ᣽ 且全基因组测序已完成 ྉ ኏ᔀႿ༁ᔽႿ੫ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡ԰ɯᤥ
由胞外结构域ܦ跨膜结构域和胞内激酶域三部分 基于此ᖔ本文采用生物信息学手段ᖔ在基因组范围
构成ᖔ其中ᖔ胞外结构域含特异性结构基元ᖔ能够 内鉴定小立碗藓 ᒦɔᣞ໧ 基因家族成员ᖔ并对其进行
特异性识别细胞信号分子ྉᓂᔀၤᡷᔽ᥋୩ၤᔽࣼ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡँଫ 蛋白序列分析ܦ结构域预测ܦ染色体定位及进化分
田丽梅ᖔ԰ԡϟᤃɯᤥ 植物 ᓂᢃ༁ᥘ 型类受体激酶 ྉ᤟ᢃ༁ᔽႿ 析等ᖔ旨在为后续研究该基因家族成员的生理生
ቝᆍᡷᔽ஦ ʢᔀዹᔀᡱᡷᆍʢ᥋᤟ᔽҴᔀ ҴᔽႿᑕ༁ᔀᖔᓂɟ᣽༁ɯ是植物中发现的一 化功能提供参考ᤥ
类重要的类受体蛋白激酶ᤥᓂᢃ༁ᥘ 型类受体蛋白激
酶ྉ᤟ᢃ༁ᥘ ʢᔀዹᔀᡱᡷᆍʢ᥋᤟ᔽҴᔀ ҴᔽႿᑕ༁ᔀᖔᓂɟ᣽༁ɯ 的典型特征是 ϟজ 研究对象与研究方法
其胞外结构域中含有 ϟጲሕ 个 ᓂᢃ༁ᥘ 结构基元ྉዶ஦झᑕ᤟
ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡऐɯᤥ ϓॹϓ 研究对象
不同植物中 ᓂɟ᣽༁ 家族成员数存在差异ᖔ拟南 本研究以模式植物小立碗藓为研究对象ᖔ小
芥和 水稻中分别含有 ጢ 个和 ϟԡ 个 ᓂᢃ༁ᥘ᥋኏ᓂ᣽༁ 立碗藓基因组注释序列下载于 ጶႿ༁ᔀቝᤦ᤟ ۪᤟ᑕႿᡷ༁ 数
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植物中 ᓂɟ᣽༁ 胞外含有的 ᓂᢃ༁ᥘ 结构基元数也有所 ྉ᣽ᔀʢ༁ᔀᢃ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟऐɯᖔ拟南芥基因组注释序列从
不同ᤥ 除古细菌外ᖔ大多数生物中 ᓂᢃ༁ᥘ 蛋白结构 ఋዶ᧧኏ 数据库 ྉ ၤᡷᡷᡱ༁᧥ ᣰ ᣰ औऔऔ঎ ᑕʢᑕᤦᔽʛᆍᡱ༁ᔽ༁঎ ᆍʢ੫ ᣰ ɯ 下载
域长度约为 ࿗ԡ ᑕᑕᤥ 植物中 ᓂɟ᣽༁ 家族成员根据其 ྉ۪ᆍᆍ᤟ᔀᖔ ԰ԡԡᎮɯᤥ 水稻基因组注释序列下载于国家
激酶结构域的不同ᖔ可以划分为两种主要类型᧥ 水稻数据中心ྉ ၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ औऔऔ঎ʢᔽዹᔀʛᑕᡷᑕ঎ዹႿ ᣰ ੫ᔀႿᔀ ᣰ ɯ ྉ 樊
ᓂɟ᣽ྉᓂᢃ༁ᥘ᥋᧧ɯ和 ᓂɟ኏ྉ ᓂᢃ༁ᥘ᥋֒ɯᖔ其中 ᓂɟ᣽ 亚家族 颖伦ᖔ ԰ԡԡँ ɯᖔ 蒺藜苜蓿基因组注释序列从

又可分为 ᓂɟ᣽᥋᧧ 和 ᓂɟ᣽᥋ ֒ଫᓂɟ኏ 亚家族分为 ᓂɟ኏᥋᧧ ۪ၤᢃᡷᆍझᆍቝᔀ ׹ϟ԰঎ ϟ 数据库 ྉ ၤᡷᡷᡱ༁᧥ ᣰ ᣰ ᡱၤᢃᡷᆍझᆍቝᔀ঎ ᢼ੫ᔽ঎
和 ᓂɟ኏᥋֒ ྉ ᓂᔽቝᡱᔀႿ༁ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡሕଫ ዶʢʢᔽ੫ၤᔽ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ʛᆍᔀ঎੫ᆍ׹ ᣰ ᡱझᣰ ᡱᆍʢᡷᑕ᤟঎ၤᡷቝ᤟ɯ下载ᤥ
԰ԡԡᤃɯᤥ 目前ᖔ大多数 ᓂᢃ༁ᥘ᥋኏ᓂ᣽ 能够感知病原菌 ϓॹԣ 研究方法
分子或参与植物᥋微生物间的相互作用ᖔ包括建立 ϟ঎԰঎ϟ 小立碗藓 ᒦɔᣞ 基因家族成员的鉴定জ 利用

防御反 应 或根内共生体 ྉ ኏ᑕʛࣼᡷᆍᔽࣼ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡሕଫ ఋዶ᧧኏ 数据库 中 拟南芥 ᒦɔᣞ 基因家族成员 ྉ 共 ጢ
ۼᑕႿ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡऐɯᤥ 个ɯ蛋白序列作为参考序列集合ᖔ在小立碗藓基因
植物 ᓂᢃ༁ᥘ 型类受体蛋白激酶在植物防御反 组序 列 ྉ ၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ ᑕ༁ᔽᑕ঎ ᔀႿ༁ᔀቝᤦ᤟঎ ᆍʢ੫ ᣰ ᔽႿʛᔀ଴঎ ၤᡷቝ᤟ɯ 中进

应及与微生物共生过程中的重要作用已被证实ᖔ 行同源搜索ᖔ查找小立碗藓中 ᒦɔᣞ 基因家族成员ᖔ