Page 51 - 《广西植物》2023年第10期
P. 51
http:/ / www.guihaia-journal.com
Guihaia Oct. 2023ꎬ 43(10): 1805-1813
DOI: 10.11931/ guihaia.gxzw202203077
王雪芹ꎬ 宋卫武ꎬ 马飞龙ꎬ 等ꎬ 2023. 基于质体基因组学方法研究广义玄参科的系统发育 [J]. 广西植物ꎬ 43(10):
1805-1813.
WANG XQꎬ SONG WWꎬ MA FLꎬ et al.ꎬ 2023. Phylogeny of Scrophulariaceae sensu lato based on plastid genome [J]. Guihaiaꎬ
43(10): 1805-1813.
基于质体基因组学方法研究广义玄参科的系统发育
王雪芹 ꎬ 宋卫武 ꎬ 马飞龙 ꎬ 高文静 ꎬ 赵 妍 1
3
1
2∗
1
( 1. 周口师范学院 生命科学与农学学院ꎬ 河南 周口 466001ꎻ 2. 周口师范学院 化学化工学院ꎬ 河南 周口 466001ꎻ
3. 周口师范学院 植物遗传与分子育种重点实验室ꎬ 河南 周口 466001 )
摘 要: 该研究利用 GenBank 数据库已公开发表的玄参科及相关类群的 107 属 129 个物种的质体基因组数
据对广义玄参科的系统发育关系进行了分析ꎮ 该文利用蛋白质编码基因构建了矩阵ꎬ并采用最大似然法及
贝叶斯推断重建系统发育树ꎮ 基于两种分析方法获得的系统发育树的拓扑结构完全一致且分辨率及支持
率较高ꎮ 在 ML 树中ꎬ总分支数为 129 个ꎬ其中支持率≥70%的分支数目为 123 个ꎮ 结果表明:(1)广义玄参
科不是一个单系类群ꎬ隶属于广义玄参科的 51 个物种(37 属)分散于列当科、泡桐科、美丽桐科、通泉草科、
母草科、狭 义 玄 参 科 和 车 前 科ꎮ ( 2) 狭 义 玄 参 科 为 单 系 类 群ꎬ 除 原 隶 属 于 广 义 玄 参 科 的 Bontia、
Calamphoreus、Diocirea、Eremophila、Glycocystis、Leucophyllum、玄参属和毛蕊花属外ꎬ还包括了原隶属于马钱科
的醉鱼草属和原隶属于苦槛蓝科的苦槛蓝属ꎮ (3)唇形目为一个单系ꎬ目下共形成了 14 个支持率高的单系
分支ꎬ对应于 14 个科(其中美丽桐科和胡麻科仅包括一个物种ꎬ不包括在内)ꎬ科间关系得到较好的解决ꎬ木
犀科为最早分化出来的类群ꎬ其余的类群共同组成核心唇形目ꎮ 在核心唇形目中ꎬ类群分化的次序依次为
苦苣苔科、车前科、玄参科和母草科ꎬ其余的科聚成两个大的分支ꎮ 其中ꎬ一个大分支包括 5 个科ꎬ紫葳科、
马鞭草科和胡麻科形成中等支持率的一个亚支ꎬ其中紫葳科、马鞭草科为姐妹群ꎻ爵床科和狸藻科亦形成中
等支持率的一个亚支ꎻ另一个大分支包括了 6 个科ꎬ类群分化的次序依次为唇形科、通泉草科、美丽桐科+透
骨草科ꎬ泡桐科和列当科为姐妹群ꎬ为较进化的类群ꎮ 该研究结果表明ꎬ传统意义上的玄参科不是一个自然
类群ꎬ包括的种属分散于唇形目ꎻ质体基因组适用于解决广义玄参科的系统发育关系ꎬ有待于扩大样本进一
步研究ꎮ
关键词: 广义玄参科ꎬ 系统发育基因组ꎬ 质体基因组ꎬ 唇形目
中图分类号: Q949 文献标识码: A 文章编号: 1000 ̄3142(2023)10 ̄1805 ̄09
Phylogeny of Scrophulariaceae sensu
lato based on plastid genome
1 2∗ 3 1 1
WANG Xueqin ꎬ SONG Weiwu ꎬ MA Feilong ꎬ GAO Wenjing ꎬ ZHAO Yan
收稿日期: 2022-06-04
基金项目: 国 家 自 然 科 学 基 金 ( 81803388)ꎻ 河 南 省 重 点 研 发 与 推 广 专 项 项 目 ( 182102310617)ꎻ 河 南 省 科 技 攻 关 项 目
(212102110142)ꎮ
第一作者: 王雪芹(1986-)ꎬ博士ꎬ讲师ꎬ主要从事植物系统进化研究ꎬ(E ̄mail)wangxueqin0218@163.comꎮ
∗
通信作者: 宋卫武ꎬ博士ꎬ讲师ꎬ研究方向为植物化学ꎬ(E ̄mail)wwsong@zknu.edu.cnꎮ