Page 47 - 《广西植物》2024年第12期
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12 期 李小琴等: 单氰胺破除葡萄休眠生理生化响应及相关基因克隆与表达分析 2 2 0 5
具有一致性和相似性的氨基酸分别用深蓝色和浅蓝色表示ꎻ 红色方框为 PEBP 家族蛋白和 FT 蛋白保守结构域ꎻ Y 为 FT 蛋白
关键保守氨基酸位点 Tyr84ꎻ Q 为 FT 蛋白关键保守氨基酸位点 Gln139ꎮ A. VvFT1 保守结构域预测结果ꎻ B. VvFT2 保守结构域
预测结果ꎻ C. VvFT1 和 VvFT2 氨基酸序列与其他植物同源序列间多重比较ꎮ
The identity and similarity amino acid sequences are marked by dark blue and light blueꎬ respectivelyꎻ the red boxes are conservative domains
of PEBP family protein and FT proteinꎻ Y is key conservative amino acid site Tyr84 of FT proteinꎻ Q is key conservative amino acid site Gln139
of FT protein. A. Conservative domain prediction results of VvFT1 proteinꎻ B. Conservative domain prediction results of VvFT2 proteinꎻ
C. Multiple homology comparisons of VvFT1 and VvFT2 proteins amino acid sequence with other plants.
图 5 VvFT1 和 VvFT2 蛋白保守结构域预测结果和同源氨基酸序列比对
Fig. 5 Conservative domain prediction results and homologous amino acid sequence alignments of VvFT1 and VvFT2 proteins
2.4 VvCBF 氨基酸序列的理化性质、蛋白结构预 分子式为 C H N O S ꎬ分子质量为 26.60
1158 1839 335 354 15
测、进化树及其氨基酸保守结构域分析 kDaꎬ pI 为 8. 31ꎬ含 3 701 个 原 子ꎮ 用 GOR4 对
2.4.1 VvCBF 氨基酸序列的理化性质和蛋白结构 VvCBF 基因编码的蛋白二级结构进行预测ꎬ图 7:
预测分析 用 ProtParam tool 在线工具对 VvCBF A 结 果 显 示 在 组 成 VvCBF 蛋 白 中 α ̄螺 旋 占
基因的多肽链氨基酸数目、分子式、等电点、相对 32.91%、折叠 延 伸 链 占 22. 36%、 无 规 则 卷 曲 占
分子量等进行预测ꎮ VvCBF 基因共编码 237 aaꎬ 44.73%ꎮ 用 SWISS ̄MODEL 在 线 工 具 进 行 预 测