Page 25 - 《广西植物》2025年第1期

１ 期 王其刚等: 中甸刺玫的叶绿体基因组特征及种内变异 ２ １

表 ３ 中甸刺玫叶绿体基因组的基因构成
Ｔａｂｌｅ ３ Ｇｅｎｅ ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎ ｏｆ Ｒｏｓｅ ｐｒａｅｌｕｃｅｎｓ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ
功能 基因分组 基因
Ｆｕｎｃｔｉｏｎ Ｇｒｏｕｐ ｏｆ ｇｅｎｅ Ｇｅｎｅ
光合作用 ＡＴＰ 合成酶 ａｔｐＡꎬ ａｔｐＢꎬ ａｔｐＥꎬ ａｔｐＦꎬ ａｔｐＨꎬ ａｔｐＩ
Ｐｈｏｔｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ＡＴＰ ｓｙｎｔｈａｓｅ
细胞色素复合体 ｐｅｔＡꎬ ｐｅｔＢ∗ꎬ ｐｅｔＤ∗ꎬ ｐｅｔＧꎬ ｐｅｔＬꎬ ｐｅｔＮ
Ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｂ / ｆ ｃｏｍｐｌｅｘ
ＮＡＤＨ 合成酶 ｎｄｈＡ∗ꎬ ｎｄｈＢ ∗ꎬ ｎｄｈＣꎬ ｎｄｈＤꎬ ｎｄｈＥꎬ ｎｄｈＦꎬ ｎｄｈＧꎬ ｎｄｈＨꎬ
※
ＮＡＤＨ ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ ｎｄｈＩꎬ ｎｄｈＪꎬ ｎｄｈＫ
光系统 Ｉ ｐｓａＡꎬ ｐｓａＢꎬ ｐｓａＣꎬ ｐｓａＩꎬ ｐｓａＪ
Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ Ｉ
光系统Ⅱ ｐｓｂＢꎬ ｐｓｂＴꎬ ｐｓｂＨꎬ ｐｓｂＮꎬ ｐｓｂＪꎬ ｐｓｂＬꎬ ｐｓｂＦꎬ ｐｓｂＥꎬ ｐｓｂＺꎬ ｐｓｂＣꎬ
Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ Ⅱ ｐｓｂＤꎬ ｐｓｂＭꎬ ｐｓｂＩꎬ ｐｓｂＫꎬ ｐｓｂＡ
二磷酸核酮糖氧化酶大亚基 ｒｂｃＬ
ＲｕｂｉｓＣＯ ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ
自我复制 核糖体蛋白小亚基 ｒｐｓ２ꎬ ｒｐｓ３ꎬ ｒｐｓ４ꎬ ｒｐｓ７ ꎬ ｒｐｓ８ꎬ ｒｐｓ１１ꎬ ｒｐｓ１２ ＃ ※ ꎬ ｒｐｓ１４ꎬ ｒｐｓ１５ꎬ
※
Ｓｅｌｆ￣ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ Ｓｍａｌｌ ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ (ＳＳＵ) ｒｐｓ１６∗ꎬ ｒｐｓ１８ꎬ ｒｐｓ１９
核糖体蛋白大亚基 ｒｐｌ２ ∗ ꎬ ｒｐｌ１４ꎬ ｒｐｌ１６ ∗ꎬ ｒｐｌ２０ꎬ ｒｐｌ２２ꎬ ｒｐｌ２３ ꎬ ｒｐｌ３２ꎬ
※
※
Ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ (ＬＳＵ) ｒｐｌ３３ꎬ ｒｐｌ３６
ＲＮＡ 聚合酶 ｒｐｏＡꎬ ｒｐｏＢꎬ ｒｐｏＣ１∗ꎬ ｒｐｏＣ２
ＲＮＡ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ
※
转运 ＲＮＡ ｔｒｎＡ￣ＵＧＣ ∗ ꎬ ｔｒｎＣ￣ＧＣＡꎬ ｔｒｎＤ￣ＧＵＣꎬ ｔｒｎＥ￣ＵＵＣꎬ ｔｒｎＦ￣ＧＡＡꎬ
※
※
Ｔｒａｎｓｆｅｒ ＲＮＡｓ ｔｒｎＧ￣ＵＣＣꎬ ｔｒｎＧ￣ＧＣＣ∗ꎬ ｔｒｎＨ￣ＧＵＧꎬ ｔｒｎＩ￣ＣＡＵ ꎬ ｔｒｎＩ￣ＧＡＵ∗ ꎬ
※
ｔｒｎＫ￣ＵＵＵ∗ꎬ ｔｒｎＳ￣ＧＣＵꎬ ｔｒｎＬ￣ＣＡＡ ꎬ ｔｒｎＬ￣ＵＡＡ∗ꎬ ｔｒｎＬ￣ＵＡＧꎬ
※
ｔｒｎＭ￣ＣＡＵꎬ ｔｒｎＮ￣ＧＵＵ ꎬ ｔｒｎＰ￣ＵＧＧꎬ ｔｒｎＱ￣ＵＵＧꎬ ｔｒｎＲ￣ＵＣＵꎬ
※
ｔｒｎＳ￣ＧＧＡꎬ ｔｒｎＳ￣ＵＧＡꎬ ｔｒｎＲ￣ＡＣＧ ꎬ ｔｒｎＴ￣ＵＧＵꎬ ｔｒｎＴ￣ＧＧＵꎬ ｔｒｎＶ￣
ＵＡＣ∗ꎬ ｔｒｎＷ￣ＣＣＡꎬ ｔｒｎＶ￣ＧＡＣ ※
※
※
※
核糖体 ＲＮＡ ｒｒｎ１６ ꎬ ｒｒｎ２３ ꎬ ｒｒｎ４.５ ꎬ ｒｒｎ５ ※
Ｒｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｒＲＮＡｓ
※
其他 Ｏｔｈｅｒｓ 假定叶绿体阅读框 ｙｃｆ１ ꎬ ｙｃｆ２ ꎬ ｙｃｆ３∗∗ꎬ ｙｃｆ４
Ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｒｅａｄｉｎｇ ｆｒａｍｅｓ (ｙｃｆ)
乙酰￣ＣｏＡ￣羧化酶亚基 ａｃｃＤ
Ａｃｅｔｙｌ￣ＣｏＡ￣ｃａｒｂｏｘｙｌａｓｅ ｓｕｂｕｎｉｔ
蛋白酶基因 ｃｌｐＰ∗∗
ｃｌｐＰ
包膜蛋白 ｃｅｍＡ
Ｅｎｖｅｌｏｐｅ ｐｒｏｔｅｉｎ
ｃ 型细胞色素合成 ｃｃｓＡ
Ｔｙｐｅ ｃ ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ
成熟酶基因 ｍａｔＫ
ｍａｔＫ
转录起始因子 ｉｎｆＡ
Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｉｎｉｔｉａｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ

＃ ※
注: ∗表示有 １ 个内含子ꎻ∗∗表示有 ２ 个内含子ꎻ 表示反式剪接ꎻ 表示在 ＩＲ 区有两个反向重复拷贝ꎮ
＃ ※
Ｎｏｔｅ: ∗ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｇｅｎｅｓ ｗｉｔｈ ｏｎｅ ｉｎｔｒｏｎꎻ ∗∗ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｇｅｎｅｓ ｗｉｔｈ ｔｗｏ ｉｎｔｒｏｎｓꎻ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｔｒａｎｓ￣ｓｐｌｉｃｅｄ ｇｅｎｅꎻ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｇｅｎｅｓ ｗｉｔｈ ｔｗｏ
ｃｏｐｉｅｓ ｉｎ ｔｈｅ ＩＲ ｒｅｇｉｏｎ.
２.４ 中甸刺玫叶绿体基因组的重复序列 序列ꎬ这些重复序列长度大多为 ２０ ~ ３０ ｂｐ(表 ５)ꎮ
重复序列分析结果表明ꎬ中甸刺玫的叶绿体 最长的重复序列分别位于 ｒｐｓ１２￣ｔｒｎＶ( ＧＡＣ) 基因
基因组中共有 ３３ 个正向重复序列和 ３ 个反向重复 间隔区和 ｎｄｈＡ 基因的含子区域ꎮ 大多数重复序