Page 109 - 《广西植物》2020年第7期
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7 期 刘换换等: 北美鹅掌楸 CPP 转录因子家族 LtTCX2 基因的克隆与分析 1 0 0 5
A. 二级结构ꎻ B. 三级结构ꎮ
A. Tertiary structureꎻ B. Secondary structure.
图 5 LtTCX2 蛋白二级、三级结构预测
Fig. 5 Secondary and tertiary structure predictions of LtTCX2 protein
表 2 通过 TargetP1.1 预测 LtTCX2 蛋白亚细胞定位 性 分 析 的 15 个 蛋 白ꎬ 还 包 括 胡 杨 ( XP _
Table 2 Subcellular localization prediction of
011026909.1ꎻXP _011039720.1ꎻXP _011019786.1)、
LtTCX2 protein by TargetP1.1 Server
银白杨(TKR83702.1)、拟南芥( NP_001328549.1ꎻ
可信度 NP_001328548.1ꎻNP_193213.5ꎻAEE83496.1ꎻNP_
蛋白名称 亚细胞结构
Credibility
Protein name Subcellular structure 566717.1)、月季(Rosa chinensisꎬXP_024179390.1)、白
(%)
梨(Pyrus bretschneideriꎬXP_009345300.1)、绒毛状
LtTCX2 叶绿体膜 cTP 56.9
烟草(Nicotiana tomentosiformisꎬXP_009591884.1)、
线粒体膜 mTP 2.8
芜菁 ( Brassica rapaꎬ XP _ 009135825. 1 )、 野 草 莓
分泌通路信号肽 SP 0.6
(Fragaria vesca subsp. vescaꎬXP_011459206.1)ꎬ共
其他 Other 71.6
27 个具有 Tesmin / TSO1 ̄like CXC 2 结构域的蛋白
表 3 通过 WoLF PSORT 预测 LtTCX2 蛋白亚细胞定位
Table 3 Subcellular localization prediction of LtTCX2 protein by WoLF PSORT
内质网
蛋白名称 细胞核 叶绿体 高尔基体 线粒体基质 液泡
Endoplasmic
Protein name Nuclear Chloroplast Golgi apparatus Mitochonodrial matrix Vacuole
reticulum
LtTCX2 14 - - - - -
序列进行进化树构建( 图 8)ꎮ 通过 MEGA7 软件 2.4 北美鹅掌楸 LtTCX2 基因的组织特异性表达分析
采用邻接法( Neighbor ̄joiningꎬNJ) 法ꎬ设置参数自 将北美鹅掌楸花芽、根、叶、茎、萼片、花瓣、雄
展值(Bootstrap 值) 为1 000次进行进化分析ꎬ结果 蕊、雌蕊共 8 个组织的总 RNA 参照说明书进行反
显示ꎬ北美鹅掌楸与莲、胡杨的 TCX2 蛋白明显聚 转录以获得 cDNAꎬ以鹅掌楸的 LcActin97 为内参
成一个分支ꎬ说明三者进化关系较近ꎮ 基因ꎬ采用相对定量的方法进行 RT ̄qPCRꎮ 检测