Page 167 - 《广西植物》2021年第9期

ँ 期 付春等᧥ 中华猕猴桃 ۩᧣ᣏ 转录因子的生物信息学分析 ϟ ጢ ᤃ ጢ
表 ϓই 中华猕猴桃 ۩᧣ᣏ 转录因子的蛋白成员信息
ఋᑕᤦ᤟ᔀ ϟজ ۪ʢᆍᡷᔀᔽႿ ቝᔀቝᤦᔀʢ ᔽႿ஦ᆍʢቝᑕᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ۩᧣ᣏ ᡷʢᑕႿ༁ዹʢᔽᡱᡷᔽᆍႿ ஦ᑕዹᡷᆍʢ ᔽႿ ዛዞᡙᔠႥᔠʐᔠᐹ ዞ၊ᔠႥᓣႥ໧ᔠ໧
拟南芥同源蛋白
蛋白名称 ̀ᆍቝᆍ᤟ᆍ੫ᆍࣼ༁ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ 氨基酸数 分子量 等电点 带负电荷 带正电荷 不稳定指数 脂肪指数 亚细胞定位
残基数
残基数
ᥘᆍ᤟ᔀዹࣼ᤟ᑕʢ
શࣼቝᤦᔀʢ ᆍ஦
۪ʢᆍᡷᔀᔽႿ Ⴟᑕቝᔀ ᆍ஦ ዛʗᐹᤇᔠʐᅳᡓ໧ᔠ໧ ᑕቝᔽႿᆍ ᑕዹᔽʛ༁ औᔀᔽ੫ၤᡷ ྉҴ᧕ɯ ᡱ᧧ ዶ༁ᡱ շ ᥈᤟ࣼ ዶʢ੫ շ ᓂᢃ༁ ᧧Ⴟ༁ᡷᑕᤦᔽ᤟ᔽᡷᢃ ዶ᤟ᔽᡱၤᑕᡷᔽዹ ୩ࣼᤦዹᔀ᤟᤟༁
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员ᖔ亮氨酸和苏氨酸各占 ϟԡ঎࿗ԡᠮଫᔀ 类中以苏氨酸 ዶዹၤႿϟሕϟᤃऐϟܦ ዶዹၤႿ԰ँँᤃᤃϟܦ ዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ԡϟ 这 ࿗ 个成
为主ᖔ只含 ዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ԡϟ 这 ϟ 个成员ᖔ苏氨酸占为 员的 保守结构域等长ᖔ 均为 ጢँᖔ 但位置各 异ଫ
ϟϟ঎ϟԡᠮྉ图 ϟɯᤥ ዶዹၤႿ԰ԡᎮ࿗ጢϟ 与 ዶዹၤႿԡጢሕ԰ँϟ 的保守结 构 域 等 长ᖔ
对中华猕猴桃 ۩᧣ᣏ 转录子进行氨基酸亲疏 均为 ᤃԡᖔ且位置吻合ଫዶዹၤႿሕᤃ԰ሕ࿗ϟ 与 ዶዹၤႿϟԡ࿗ጢሕϟ
水性 ۪ʢᆍᡷ༁ዹᆍ᤟ᔀ 预测发现中华猕猴桃的 ϟᤃ 个 ۼᨃᣮ 的保守结构域长度和位置均吻合ଫዶዹၤႿሕᤃ԰࿗ጢϟ 与
蛋白成员的 ᥈኏ዶ჆ɟ 值均为负ᖔ即这 ϟᤃ 个成员均 ዶዹၤႿϟ࿗ጢጢᤃϟ 中的 ̀ᆍቝᆍʛᆍቝᑕᔽႿ ༁ࣼᡱᔀʢ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃ 保守结
为亲水 蛋 白ᤥ 其 中 总平均亲水指数最大的为 构域等长ᖔ均为 ጢऐᖔ但位置不同ྉ表 ሕᖔ图 ሕɯᤥ
ዶዹၤႿԡጢሕ԰ँϟᖔ其值为 ͱ ԡ঎ँጢ࿗ᖔ该成员的第 ऐܦ第 ँܦ ୩ᔽ੫Ⴟᑕ᤟۪࿗঎ϟ ୩ᔀʢ׹ᔀʢ 信号肽预测分析结果显示除
第 ϟԡܦ第 ϟϟܦ第 ϟ԰ܦ第 ϟሕܦ第 ϟ࿗ 位氨基酸表现为最 ዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟ 外ᖔ其余 ϟጢ 个中华猕猴桃转录因子均
大亲水性ᖔ其值为ͱሕ঎ጢଫ第 ϟጢ԰ 位氨基酸表现为最 无信号肽ᤥ 因此ᖔ推测 ዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟ 为分泌蛋白ᖔ
大疏水性ᖔ其值为 ϟ঎ጢሕሕᤥ 总平均亲水指数最小的 其余均为非分泌蛋白ྉ图 ࿗ɯᤥ
是 ዶዹၤႿϟԡ࿗ጢሕϟᖔ其值为ͱԡ঎࿗ԡ԰ᖔ该成员的第 ऐ࿗ܦ第 ఋᥘ̀ᥘᥘ ୩ᔀ׹ᔀʢ׹঎԰঎ԡ 跨膜域分析结果显示ᖔ除
ऐጢܦ第 ऐᤃ 位氨基酸表现为最大亲水性ᖔ 其值为 ዶዹၤႿሕᤃ԰࿗ጢϟܦዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟ 有明显的跨膜结构域
ͱሕ঎ጢᤃᎮଫ第 ԰ጢԡ 位氨基酸表现为最大疏水性ᖔ其值 外ᖔ其余 ϟ࿗ 个 ۩᧣ᣏ 转录因子均无明显的跨膜结

为 ԰঎ጢྉ表 ԰ᖔ图 ԰ɯᤥ 构域ᤥ 因此ᖔ推测 ዶዹၤႿሕᤃ԰࿗ጢϟܦዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟ 为跨
ԣॹԣ 保守结构域预测ܓ信号肽的分析及跨膜域的预 膜蛋白ྉ图 ጢɯᤥ
测分析 ԣॹᇺ 磷酸化位点的预测分析
中华猕猴桃的 ϟᤃ 个 ۩᧣ᣏ 转录因子的保守结 શᔀᡷ۪ၤᆍ༁ ሕ঎ϟ 磷酸化位点分析表明 ϟᤃ 个 ۼᨃᣮ
构域预测分析表明中华猕猴桃的 ϟᤃ 个 ۩᧣ᣏ 转录 蛋白 成 员 中ᖔ ዶዹၤႿϟᎮ԰ሕऐϟܦዶዹၤႿሕሕᤃጢँϟܦዶዹၤႿ԰ऐጢᎮऐϟܦ
因子中ᖔ仅 ዶዹၤႿϟ࿗ጢጢᤃϟ 有 ̀ᆍቝᆍʛᆍቝᑕᔽႿ ༁ࣼᡱᔀʢ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃ ዶዹၤႿ԰ԡᎮ࿗ጢϟܦዶዹၤႿԡጢሕ԰ँϟ 等 ϟሕ 个 ۼᨃᣮ 蛋白成员中
和 ۪᧧᥈᥋̀ ༁ࣼᡱᔀʢ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃ 两个保守结构域ᖔ其余 ϟጢ 个 磷酸化位点的总数᧥ 丝氨酸 ᢦ 苏氨酸 ᢦ 酪氨酸ଫ
ۼᨃᣮ 蛋白成员只含 ̀ᆍቝᆍʛᆍቝᑕᔽႿ ༁ࣼᡱᔀʢ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃ 这一 ዶዹၤႿϟሕϟᤃऐϟ 和 ዶዹၤႿ԰ँँᤃᤃϟ 中磷酸化 位 点 总 数᧥
个保守结构域ᤥ 中华猕猴桃 ۼᨃᣮ 蛋白成员的保 苏氨酸ᢦ丝氨酸ᢦ酪氨酸ଫዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ԡϟ 中磷酸化位

守 结 构域长度为 ሕऐ ጲ ᤃϟᖔ 其中ᖔ ዶዹၤႿϟᎮ԰ሕऐϟܦ 点总数᧥ 丝氨酸 ᢉ 苏氨酸ᢦ酪氨酸ᤥ 就单个成员而