Page 111 - 《广西植物》2020年第6期
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6 期 蓝雨纯等: 小立碗藓扩展蛋白基因家族的鉴定与生物信息学分析 8 5 7
表 1 小立碗藓 Expansin 基因家族成员基本信息
Table 1 Identification of Expansin gene family members from Physcomitrella patens
氨基酸 亚细胞定位
长度 mRNA Subcellular localization
分子量 内含子
染色体位置 Length 长度
基因名称 基因号 等电点 Mocecular E ̄value 值 数目
Chromosome of mRNA CELLO Euk ̄mPLoc
Gene name Gene ID PI weight E ̄value Intron
location amino length 预测 预测
(kDa) number
acid (bp) CELLO Euk ̄mPLoc
(aa) prediction prediction
PpEXPA1 112285422 Chr8:8694013-- 11.53 23.51 2.00E-122 269 1 1 496 细胞外 细胞外
8696181 Extracellular Extracellular
(3.123)
PpEXPA2 112290281 Chr13:14311266-- 8.36 26.29 1.00E-130 262 1 1 366 细胞外 细胞外
14313155 Extracellular Extracellular
(3.522)
PpEXPA3 112289447 Chr12:3275318-- 8.63 26.35 4.00E-133 255 2 1 272 细胞外 细胞外
3277508 Extracellular Extracellular
(3.998)
PpEXPA4 112288396 Chr11:7792124-- 8.1 26.74 8.00E-150 262 1 1 516 细胞外 细胞外
7794136 Extracellular Extracellular
(2.295)
PpEXPA5 112273392 Chr20:3549449-- 6.03 26.79 1.00E-132 286 3 1 768 细胞外 细胞外
3552027 Extracellular Extracellular
(3.334)
PpEXPA6 112294930 Chr18:13986071-- 10.05 27.14 5.00E-147 253 2 1 902 细胞外 细胞外
13988541 Extracellular Extracellular
(4.194)
PpEXPA7 112276452 Chr24:10147408-- 9.25 27.37 2.00E-133 272 3 1 738 细胞外 细胞外
10149750 Extracellular Extracellular
(3.342)
PpEXPA8 112285449 Chr8:9701908-- 6.7 27.39 8.00E-127 252 1 2 193 细胞外 细胞外
9704893 Extracellular Extracellular
(3.221)
PpEXPA9 112290417 Chr13:5618875-- 7.49 27.43 0 263 2 2 442 细胞外 细胞外
5622902 Extracellular Extracellular
(2.979)
PpEXPA10 112291187 Chr14:11969561-- 7.49 27.43 8.00E-158 261 0 1 337 细胞周质 细胞外
11970412 Periplasm Extracellular
(2.396)
PpEXPA11 112274102 Chr21:1212542-- 9.16 27.58 5.00E-167 253 2 1 697 细胞外 细胞外
1214849 Extracellular Extracellular
(4.075)
PpEXPA12 112285508 Chr8:678047-- 8.1 27.71 4.00E-133 257 2 1 325 细胞外 细胞外
680168 Extracellular Extracellular
(3.057)
PpEXPA13 112284709 Chr7:8846261-- 9.01 27.82 0 274 0 1 598 细胞周质 细胞外
8849088 Periplasm Extracellular
(2.983)
PpEXPA14 112274755 Chr22:566463-- 9.83 28.21 0 268 2 2 032 细胞外 细胞外
569299 Extracellular Extracellular
(3.565)
PpEXPA15 112285508 Chr8:678029-- 9.83 28.21 4.00E-133 257 2 1 325 细胞外 细胞外
680162 Extracellular Extracellular
(3.057)
PpEXPA16 112285133 Chr7:8674342-- 9.83 28.22 3.00E-114 275 2 1 096 细胞周质 细胞外
8676137 Periplasm Extracellular
( 1.761)
PpEXPA17 112294922 Chr18:13965591-- 8.8 28.32 1.00E-167 256 2 1 665 细胞外 细胞外
13968229 Extracellular Extracellular
(3.050)
PpEXPA18 11229436 Chr14:12352288-- 9.8 28.36 0 261 0 2 689 细胞外 细胞外
12353576 Extracellular Extracellular
(2.716)
PpEXPA19 112274474 Chr21:1250662-- 9.47 28.42 0 251 2 1 928 细胞外 细胞外
1254179 Extracellular Extracellular
(3.816)