Page 111 - 《广西植物》2020年第6期
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6 期                蓝雨纯等: 小立碗藓扩展蛋白基因家族的鉴定与生物信息学分析                                           8 5 7


                             表 1  小立碗藓 Expansin 基因家族成员基本信息
                 Table 1  Identification of Expansin gene family members from Physcomitrella patens
                                                              氨基酸                    亚细胞定位
                                                               长度         mRNA    Subcellular localization
                                             分子量                    内含子
                      染色体位置                                    Length     长度
   基因名称     基因号                       等电点 Mocecular  E ̄value 值       数目
                      Chromosome                                of        mRNA    CELLO    Euk ̄mPLoc
   Gene name  Gene ID                   PI   weight   E ̄value        Intron
                      location                                 amino      length   预测        预测
                                             (kDa)                  number
                                                               acid       (bp)    CELLO    Euk ̄mPLoc
                                                               (aa)              prediction  prediction
   PpEXPA1  112285422  Chr8:8694013--  11.53  23.51  2.00E-122  269   1   1 496   细胞外       细胞外
                      8696181                                                    Extracellular  Extracellular
                                                                                  (3.123)
   PpEXPA2  112290281  Chr13:14311266--  8.36  26.29  1.00E-130  262  1   1 366   细胞外       细胞外
                      14313155                                                   Extracellular  Extracellular
                                                                                  (3.522)
   PpEXPA3  112289447  Chr12:3275318--  8.63  26.35  4.00E-133  255   2   1 272   细胞外       细胞外
                      3277508                                                    Extracellular  Extracellular
                                                                                  (3.998)
   PpEXPA4  112288396  Chr11:7792124--  8.1  26.74  8.00E-150   262   1   1 516   细胞外       细胞外
                      7794136                                                    Extracellular  Extracellular
                                                                                  (2.295)
   PpEXPA5  112273392  Chr20:3549449--  6.03  26.79  1.00E-132  286   3   1 768   细胞外       细胞外
                      3552027                                                    Extracellular  Extracellular
                                                                                  (3.334)
   PpEXPA6  112294930  Chr18:13986071--  10.05  27.14  5.00E-147  253  2  1 902   细胞外       细胞外
                      13988541                                                   Extracellular  Extracellular
                                                                                  (4.194)
   PpEXPA7  112276452  Chr24:10147408--  9.25  27.37  2.00E-133  272  3   1 738   细胞外       细胞外
                      10149750                                                   Extracellular  Extracellular
                                                                                  (3.342)
   PpEXPA8  112285449  Chr8:9701908--  6.7   27.39  8.00E-127   252   1   2 193   细胞外       细胞外
                      9704893                                                    Extracellular  Extracellular
                                                                                  (3.221)
   PpEXPA9  112290417  Chr13:5618875--  7.49  27.43     0       263   2   2 442   细胞外       细胞外
                      5622902                                                    Extracellular  Extracellular
                                                                                  (2.979)
   PpEXPA10  112291187  Chr14:11969561--  7.49  27.43  8.00E-158  261  0  1 337  细胞周质       细胞外
                      11970412                                                   Periplasm  Extracellular
                                                                                  (2.396)
   PpEXPA11  112274102  Chr21:1212542--  9.16  27.58  5.00E-167  253  2   1 697   细胞外       细胞外
                      1214849                                                    Extracellular  Extracellular
                                                                                  (4.075)
   PpEXPA12  112285508  Chr8:678047--  8.1   27.71  4.00E-133   257   2   1 325   细胞外       细胞外
                      680168                                                     Extracellular  Extracellular
                                                                                  (3.057)
   PpEXPA13  112284709  Chr7:8846261--  9.01  27.82     0       274   0   1 598  细胞周质       细胞外
                      8849088                                                    Periplasm  Extracellular
                                                                                  (2.983)
   PpEXPA14  112274755  Chr22:566463--  9.83  28.21     0       268   2   2 032   细胞外       细胞外
                      569299                                                     Extracellular  Extracellular
                                                                                  (3.565)
   PpEXPA15  112285508  Chr8:678029--  9.83  28.21  4.00E-133   257   2   1 325   细胞外       细胞外
                      680162                                                     Extracellular  Extracellular
                                                                                  (3.057)
   PpEXPA16  112285133  Chr7:8674342--  9.83  28.22  3.00E-114  275   2   1 096  细胞周质       细胞外
                      8676137                                                    Periplasm  Extracellular
                                                                                 ( 1.761)
   PpEXPA17  112294922  Chr18:13965591--  8.8  28.32  1.00E-167  256  2   1 665   细胞外       细胞外
                      13968229                                                   Extracellular  Extracellular
                                                                                  (3.050)
   PpEXPA18  11229436  Chr14:12352288--  9.8  28.36     0       261   0   2 689   细胞外       细胞外
                      12353576                                                   Extracellular  Extracellular
                                                                                  (2.716)
   PpEXPA19  112274474  Chr21:1250662--  9.47  28.42    0       251   2   1 928   细胞外       细胞外
                      1254179                                                    Extracellular  Extracellular
                                                                                  (3.816)
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