Page 114 - 《广西植物》2020年第6期
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表 2 Expansin 蛋白的预测 motif 列表
Table 2 List of the putative motifs of Expansin proteins
基序 E ̄value 值 长度
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Motif E ̄value Width
motif 1 2.2e ̄911 41
motif 2 2.8e-1148 50
motif 3 6.3e-610 34
motif 4 1.1e-521 29
motif 5 6.30E-298 15
motif 6 2.9e-399 21
motif 7 8.40E-146 50
motif 8 2.60E-133 21
motif 9 1.10E-121 49
motif 10 9.20E-107 50
在第 14 条染色体上出现了小规模的基因簇(Bai et EXLA 亚家族均含有 motif 2ꎻEXLA 亚家族基因均
al.ꎬ 2002)ꎮ 另 7 条染色体上均只含 1 个基因ꎬ3 含有 motif 2 ̄motif 9 ̄motif 7 ̄motif 10 ̄motif 6 的稳定
条染色体含有 2 个基因ꎬ可见小立碗藓 38 个 Ex ̄ 结构ꎬ比 EXPA 亚家族更具有保守性ꎮ 同一亚家
pansin 基因在染色体上分布是不均匀的ꎮ 族内的 EXP 基因含有保守的内含子与外显子结构
和 motif 特征ꎬ而不同亚家族之间 motif 的多样化也
3 讨论 表明了小立碗藓 EXP 基因在一定程度上参与细胞
内的多种代谢途径ꎮ 通过染色体定位发现ꎬ在小
扩展蛋白是植物细胞壁的重要组分ꎬ主要参 立碗藓 Expansin 基因随机分布 15 条染色体上ꎬ除
与细胞扩张以及一系列发生细胞壁修饰的发育过 14 号染色体外ꎬ基本不形成基因簇ꎮ
程以及植物抗病的重要生理过程ꎮ 研究鉴定小立 EXP 基因在植物体的生长发育及逆境胁迫中
碗藓 中 含 有 38 个 扩 展 蛋 白ꎬ 可 进 一 步 分 类 为 具有重要的生理意义ꎬ已成为植物体基因功能研
EXPA 亚家族及 EXLA 亚家族ꎮ 小立碗藓 EXP 基 究热点之一ꎬ但其在小立碗藓中的基因功能尚不
因的两个亚家族之间在基因内含子外显子分布、 明确ꎮ 本研究通过对已有数据库数据的分析ꎬ使
motif 结构等方面具有一定的保守性ꎬ代表了亚家 用生物学信息的方法手段ꎬ筛选得到 38 个小立碗
族的重要特征ꎬ 研究发现 EXPA 亚家族中约 70% 藓扩展蛋白基因家族成员ꎬ分析其蛋白特征、进化
的基因含有 1 ~ 2 个内含子ꎬ另有约 22%的 EXPA 关系、基因结构及染色体定位等ꎮ 从基因水平上
亚家族基因不含内含子ꎻ而 EXLA 亚家族几乎仅 展示小立碗藓种属的特征ꎬ为后续研究扩展蛋白
含 1 个内含子ꎮ 基序分析表明ꎬEXPA 亚家族及 基因功能提供了理论依据ꎮ