Page 175 - 《广西植物》2021年第9期
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ँ 期 付春等᧥ 中华猕猴桃 ۩᧣ᣏ 转录因子的生物信息学分析 ϟ ጢ Ꭾ ሕ
图 ϟজ 中华猕猴桃与其他物种的 ۩᧣ᣏ 转录因子的系统进化树
èᔽ੫ ϟজ ۪ၤᢃᆍ੫ᔀႿᔀᡷᔽዹ ᡷʢᔀᔀ༁ ᆍ ۩᧣ᣏ ᡷʢᑕႿ༁ዹʢᔽᡱᡷᔽᆍႿ ᑕዹᡷᆍʢ༁ ᤦᔀᡷऔᔀᔀႿ ዛዞᡙᔠႥᔠʐᔠᐹ ዞ၊ᔠႥᓣႥᔠ ᑕႿʛ ᆍᡷၤᔀʢ ༁ᡱᔀዹᔽᔀ༁
ԡϟँɯܦ星油藤ྉ 郭亚静等ᖔԡԡɯ 中 ۼᨃᣮ 蛋白成 区和 信 号 肽ᖔ 仅 ዶዹၤႿሕᤃ࿗ጢϟ 是分泌蛋白ᖔ 且仅
员以酸性蛋白为主ᖔ在番茄的 ۼᨃᣮ 蛋白成员中酸 ዶዹၤႿሕᤃ࿗ጢϟ 和 ዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟ 具有跨膜 区ᖔ 为跨膜
性蛋白和碱性蛋白各占一半ᤥ 棉花 ۩᧣ᣏ 转录因 蛋白ᤥ 而在陆地棉花ྉ吕有军等ᖔԡϟᎮɯ 中ᖔ所有的
子的亚细胞预测结果显示ᖔ棉花中的 ۼᨃᣮ 蛋白成 ۼᨃᣮ 都不 含 跨 膜区和信号肽ᤥ 故推测大多数
员大部分定位于细胞质和微体ᖔ少部分定位于细 ۼᨃᣮ 蛋白成员为非跨膜蛋白或非分泌蛋白ᤥ
胞核ᤥ 中华猕猴桃的 ۼᨃᣮ 蛋白成员大多为定位 中华猕猴桃大多数 ۼᨃᣮ 蛋白二级结构主要
于细胞核的碱性蛋白ᖔ极少数为定位于细胞核的 以无规则卷曲为主ᖔ其次为 ም᥋螺旋和延伸链ᖔᏇ᥋转
酸性蛋白ᤥ 此结果与乌拉尔图小麦ܦ玉米鹰嘴豆ܦ 角含量最少ᤥ 此结果与陆地棉中 ۩᧣ᣏ 转录因子
簸箕柳ܦ谷子中 ۼᨃᣮ 蛋白成员的分析结果有相似 的二级结构含量预测结果相似ྉ 吕有军等ᖔԡϟᎮଫ
之处ᖔ但由于缺少具体实验数据的支撑ᖔ暂不能得 ̀ᑕᆍ ᔀᡷ ᑕᖔ ԡϟँɯᤥ 保守基序分析结果显示ᖔ中华
出 ۼᨃᣮ 蛋白成员中亚细胞定位与酸碱性的关系 猕猴桃中所有的 ۼᨃᣮ 蛋白成员均含有 ቝᆍᡷᔽϟᤥ 李
结论ᖔ但可以推测不同的物种中 ۼᨃᣮ 蛋白成员由 晓旭等ྉԡϟᤃɯ 对番茄的 ۩᧣ᣏ 基因家族研究中发
于发挥的功能不同造成其 ۼᨃᣮ 蛋白成员的亚细 现所有成员都含有 ቝᆍᡷᔽϟᖔ并指出 ቝᆍᡷᔽϟ 是由 ᤃԡ
胞定位和酸碱性也会有所差异ᤥ 由氨基酸组成来 个氨 基 酸 残基组成的保守的同源异型结构域
看ᖔ中华猕猴桃中 ϟᤃ 个 ۼᨃᣮ 蛋白成员主要以丝 ၤᆍቝᔀᆍʛᆍቝᑕᔽႿᤥ 王鹏飞等ྉԡϟऐɯ 在葡萄的 ۩᧣ᣏ 基
氨酸为主ᖔ其次为亮氨酸ܦ苏氨酸和谷氨酰胺ᖔ而 因家族研究中发现所有 ۼᨃᣮ 蛋 白 成员均含有
在其他物种中对 ۼᨃᣮ 蛋白成员的氨基酸组成分 ቝᆍᡷᔽϟ 和 ቝᆍᡷᔽᖔ并进一步分析指出这两个结构域
析尚未见报道ᤥ 序列是 包 含 ۼᨃᣮ 蛋白的 ၤᆍቝᔀᆍᤦᆍ 结构域的序
保守结构域分析表明ᖔ中华猕猴桃的 ϟᤃ 个 列ᤥ 王楚堃等ྉԡϟँɯ 在苹果 ۩᧣ᣏ 基因家族研究
۩᧣ᣏ 转录因子均属于 ̀ᆍቝᆍʛᆍቝᑕᔽႿ ༁ࣼᡱᔀʢᑕቝᔽᢃᖔ此 中发 现ᖔ 其 ۼᨃᣮ 所有蛋白成员均含 ቝᆍᡷᔽϟᖔ 且
结果 与玉米 ྉ 郑玲等ᖔ ԡϟँɯܦ 番茄 ྉ 李晓旭等ᖔ ቝᆍᡷᔽϟ 结构域包含 ۼᨃᣮ 家族 ၤᆍቝᔀᆍᤦᆍ 的结构域
ԡϟᤃɯܦ葡萄ྉ王鹏飞等ᖔԡϟऐɯ等研究结果一致ᖔ在 序列ᤥ 李晨曦等ྉԡϟᤃɯ 在毛竹 ۩᧣ᣏ 基因家族研
玉米ྉ郑玲等ᖔԡϟँɯܦ番茄ྉ 李晓旭等ᖔԡϟᤃɯܦ葡 究中发现ᖔ所有 ۼᨃᣮ 蛋白成员都含有 ቝᆍᡷᔽϟ 和
萄ྉ王鹏飞等ᖔԡϟऐɯ 等研究中ᖔ所有的 ۼᨃᣮ 蛋白 ቝᆍᡷᔽሕᖔ 且指出 ቝᆍᡷᔽϟ 和 ቝᆍᡷᔽሕ 共同组成了
成员都含有 ၤᆍቝᔀᆍᤦᆍ 这一结构域ᤥ 信号肽和跨膜 ၤᆍቝᔀᆍʛᑕቝᔽႿᤥ 本研究的中华猕猴桃 ۼᨃᣮ 蛋白基
结构域显示ᖔ在中华猕猴桃中ᖔ大多数成员无跨膜 序分析结果与以上这些植物基因组中 ۼᨃᣮ 蛋白
