Page 107 - 《广西植物》2023年第10期
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Guihaia Oct. 2023ꎬ 43(10): 1861-1875
DOI: 10.11931/ guihaia.gxzw202208050
王玉凤ꎬ 孟缘ꎬ 于海航ꎬ 等ꎬ 2023. 欧耧斗菜 AP2 / ERF 基因家族鉴定及盐胁迫下表达分析 [J]. 广西植物ꎬ 43(10):
1861-1875.
WANG YFꎬ MENG Yꎬ YU HHꎬ et al.ꎬ 2023. Identification of AP2/ ERF gene family in Aquilegia vulgaris and expression
analysis under salt stress [J]. Guihaiaꎬ 43(10): 1861-1875.
欧耧斗菜 AP2 / ERF 基因家族鉴定及盐胁迫下表达分析
王玉凤ꎬ 孟 缘ꎬ 于海航ꎬ 崔丁元ꎬ 白 云 ∗
( 吉林农业大学 林学与草学学院ꎬ 长春 130118 )
摘 要: AP2 / ERF 转录因子在植物生长发育和响应非生物胁迫中发挥着重要作用ꎮ 为探究欧耧斗菜
(Aquilegia vulgaris)中 AP2 / ERF 对盐胁迫的响应ꎬ该研究基于前期试验获得的盐胁迫下转录组数据ꎬ通过生
物信息学方法筛选欧耧斗菜 AP2 / ERF 家族基因ꎬ分析其生化特征、保守基序、系统进化等ꎬ并对其在盐胁迫
处理下不同时间的根与叶中的表达量变化进行分析ꎬ利用 qRT ̄PCR 技术对候选基因表达量进行验证ꎮ 结
果表明:( 1) 筛选出 86 个 AvAP2 / ERF 基因ꎬ其 编 码 的 氨 基 数 目 为 132 ~ 722 个ꎬ分 子 量 为 14 763. 30 ~
79 069.47 Daꎬ等电点介于 4.49~ 9.68 之间ꎬ偏酸性蛋白较多ꎬ均为亲水性蛋白ꎻ对 AvAP2 / ERF 蛋白进行亚
细胞定位预测ꎬ大多数定位于细胞核ꎮ (2)二级结构以无规则卷曲和 α ̄螺旋为主ꎬ均具有 AP2 保守结构域ꎬ
有两个高度保守的基序 Motif 1 和 Motif 2ꎮ (3)在盐胁迫下ꎬ71 个 AvAP2 / ERF 基因表达量发生变化ꎬ其中叶
片中差异表达基因 18 个、根中 19 个ꎻ欧耧斗菜与拟南芥 AP2 / ERF 基因聚类为 5 个亚家族、15 个亚组ꎬ通过
表达分析及同源关系ꎬ确定 3 个响应盐胁迫的基因 AvAP2 / ERF ̄56、AvAP2 / ERF ̄61 与 AvAP2 / ERF ̄80ꎬ其
qRT ̄PCR 结果与转录组数据一致ꎮ 该研究结果为深入探究欧耧斗菜 AP2 / ERF 基因的功能及逆境响应机制
奠定了基础ꎮ
关键词: 欧耧斗菜ꎬ AP2 / ERFꎬ 生物信息学ꎬ 盐胁迫转录组ꎬ 表达分析
中图分类号: Q943 文献标识码: A 文章编号: 1000 ̄3142(2023)10 ̄1861 ̄15
Identification of AP2/ ERF gene family in Aquilegia vulgaris
and expression analysis under salt stress
∗
WANG Yufengꎬ MENG Yuanꎬ YU Haihangꎬ CUI Dingyuanꎬ BAI Yun
( College of Forestry and Grasslandꎬ Jilin Agricultural Universityꎬ Changchun 130118ꎬ China )
Abstract: AP2/ ERF transcription factors play important roles in plant growthꎬ development and response to abiotic
stress. In order to explore the response of AvAP2/ ERF genes in Aquilegia vulgaris to salt stressꎬ based on the
transcriptome data obtained under salt stress in previous experimentsꎬ the AP2/ ERF gene family in A. vulgaris were
收稿日期: 2022-11-14
基金项目: 国家自然科学基金(32101586)ꎻ 吉林省自然科学基金(YDZJ202201ZYTS452)ꎮ
第一作者: 王玉凤(1998-)ꎬ硕士研究生ꎬ研究方向为园林植物资源与种质创新ꎬ(E ̄mail)2447383563@ qq.comꎮ
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通信作者: 白云ꎬ博士ꎬ讲师ꎬ研究方向为观赏植物种质资源及分子育种ꎬ(E ̄mail)yunb@ jlau.edu.cnꎮ