Page 103 - 《广西植物》2023年第2期
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2 期 牛苏燕等: 马铃薯低氮肥胁迫响应 TCP 转录因子的鉴定与分析 2 9 7
表 2 马铃薯 TCP 家族蛋白的理化性质
Table 2 Physicochemical properties of TCP family proteins in Solanum tuberosum
相对分子质量 pI 值 平均疏水性 α 螺旋 延伸链 β 转角 无规卷曲
基因号
Relative molecular pI Average Alpha helix Extended strand Beta turn Random coil
Gene ID
mass (Da) value hydrophobicity (%) (%) (%) (%)
PGSC0003DMG400000597 44 261.60 7.06 -0.713 24.62 10.63 4.35 60.39
PGSC0003DMG400000823 40 647.28 8.68 -0.981 24.86 13.56 5.08 56.50
PGSC0003DMG400001362 31 700.15 6.53 -0.755 13.07 18.73 3.53 64.66
PGSC0003DMG400003382 41 177.75 6.59 -0.995 21.83 10.24 4.85 63.07
PGSC0003DMG400009276 41 394.59 8.02 -0.737 17.22 12.34 3.34 67.10
PGSC0003DMG400009406 35 162.67 6.39 -0.889 19.94 9.65 2.89 67.52
PGSC0003DMG400012396 43 555.86 6.17 -0.680 15.00 12.25 3.00 69.75
PGSC0003DMG400015377 45 806.76 6.76 -0.595 17.34 14.25 5.23 63.18
PGSC0003DMG400016363 49 071.20 9.08 -0.188 21.88 22.54 7.59 47.99
PGSC0003DMG400020247 25 079.06 6.65 -0.586 26.72 7.76 3.45 62.07
PGSC0003DMG400021568 21 143.87 8.52 -0.283 11.44 19.90 6.47 62.19
PGSC0003DMG400022738 40 247.19 7.83 -0.520 11.50 11.50 3.48 73.53
PGSC0003DMG400022964 38 062.86 5.82 -0.907 22.46 15.27 3.89 58.38
PGSC0003DMG400024254 38 626.04 5.22 -0.355 15.03 10.66 3.01 71.31
PGSC0003DMG400024928 57 554.24 6.88 -0.838 18.91 10.30 2.25 68.54
PGSC0003DMG400026105 35 025.56 7.20 -0.793 17.74 16.51 3.67 62.08
PGSC0003DMG400026568 24 635.71 7.98 -0.633 16.06 20.64 5.50 57.80
PGSC0003DMG400033078 44 476.60 6.74 -0.781 22.20 9.51 5.12 63.17
PGSC0003DMG400040232 30 001.52 8.91 -0.606 17.56 10.39 5.38 66.67
PGSC0003DMG400004054 31 121.52 9.47 -1.015 33.33 13.62 2.51 50.54
PGSC0003DMG400004082 34 005.46 8.63 -0.814 11.15 14.10 2.62 72.13
PGSC0003DMG400005705 42 882.44 9.35 -0.595 37.30 11.38 3.97 47.35
PGSC0003DMG400024632 39 060.43 5.58 -1.005 9.01 11.05 2.62 77.33
PGSC0003DMG400045197 29 948.42 10.08 -0.308 14.64 14.29 4.29 66.79
表 3 马铃薯 TCP 转录因子的保守基序长度及氨基酸序列
Table 3 Length and amino acid sequences of motifs of TCP transcription factors in Solanum tuberosum
基序 氨基酸序列长度 氨基酸序列
Motif Length of amino acid sequence (aa) Amino acid sequence
Motif 1 60 KDRHTKVGGRGRRIRLPALCAARVFQLTDELGHKSDGETIEWLLQQAEPAIIAATGTGTI
Motif 2 21 PANFSSLNISLRSSGSSVSAP
Motif 3 6 GRKDRH
Motif 4 17 FGQDPDENYMKKRYRED
Motif 5 9 DTIKSFFPM
Motif 6 6 MLGFHH
2 个 基 因 ( 基 因 号 PGSC0003DMG400000823 和 TCP 转录因子ꎬ其中 3 个 TCP 转录因子显著性差
PGSC0003DMG400022738)的差异表达水平最大ꎬ 异 表 达 ( 基 因 号 PGSC0003DMG400000597 和
分别上调了 1.81 倍和 1.58 倍ꎮ 在 2 个根转录文 PGSC0003DMG400024254 下 调 表 达、 基 因 号
库中ꎬ共获得 19 个 TCP 转录因子ꎬ包括 11 个被抑 PGSC0003DMG400015377 上 调 表 达)ꎬ 2 个 TCP
制表 达 的 TCP 转 录 因 子 和 8 个 被 诱 导 表 达 的 转录 因 子 ( 基 因 号 PGSC0003DMG400022964 和