Page 140 - 《广西植物》2023年第2期
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理研究中开发的 14 对枫香 SSR 引物ꎬ其观测等位 综上所述ꎬ本研究基于转录组测序技术获得
基因数平均值为 3.258 0ꎬ有效等位基因数平均值 了较为全面的枫香 SSR 位点信息ꎬ成功开发出 18
为 1.848 0ꎻ顾辛韵(2016)在千岛湖地区开展的片 对枫香 EST ̄SSR 引物ꎬ对枫香中高度多态性 SSR
断化生境对枫香遗传多样性影响的研究中开发的 引物的数量提供了必要的补充ꎬ为解决当前枫香
10 对 SSR 引物ꎬ观测等位基因数均值为 4.6ꎬ有效 中高多态性 SSR 引物数量和种类不足以支撑更深
等位基因数平均值为 2.130 0ꎮ 本研究所开发 18 入地进行枫香遗传多样性研究的问题提供了帮
对 SSR 引物在环江群体中检测到的观测等位基因 助ꎬ为枫香群体遗传学、分子辅助育种等研究提供
数平均值为 2.333 3ꎬ低于前两者ꎬ其原因是观测等 了更多、更好的研究工具ꎮ
位基因数在很大程度上依赖于抽取的样本大小ꎬ
本研究采样范围及数量较前两者偏小ꎻ有效等位
基因数平均值(1.957 4)ꎬ与前两者研究相近ꎬ而有 参考文献:
效等位基因数比杂合体频率和纯合体频率更好地
BI ZXꎬ JIN ZXꎬ LI JMꎬ et al.ꎬ 2010. Genetic diversity in the
度量群体遗传变异地增加ꎬ说明该环江群体遗传 natural populations of Liquidambar formosana revealed by
多样性较为丰富ꎮ 上述讨论说明本研究所开发的 ISSR molecular markers [J]. Bull Bot Resꎬ 30(1): 120-
SSR 引物同样能够很好地反映出枫香群体遗传变 125. [毕则鑫ꎬ 金则新ꎬ 李钧敏ꎬ 等ꎬ 2010. 枫香自然种群
遗传 多 样 性 的 ISSR 分 析 [ J]. 植 物 研 究ꎬ 30 ( 1):
异情况ꎬ可适用于枫香遗传多样性研究ꎮ
120-125.]
引物开发的目的是得到 多 态 信 息 含 量 高 的 BOTSTEIN Dꎬ WHITE RLꎬ SKOLNICK Mꎬ et al.ꎬ 1980.
SSR 分子标记ꎮ 由于前人研究中采用常规 SSR 分 Construction of a genetic linkage map in man using restriction
子标记开发技术获得的枫香序列有限ꎬ因此开发 fragment length polymorphisms [ J]. Am J Hum Genetꎬ
32(3): 314-331.
的枫香 SSR 引物数量较少、多态信息含量不高ꎮ
FAN SBꎬ SU JYꎬ FANG Tꎬ et al.ꎬ 2022. Pathogen of
本研究首次通过转录组测序技术对枫香 SSR 位点
Liquidambar formosana leaf spot [J]. Mycosystemaꎬ 41(3):
信息进行了较为全面的发掘ꎬ可高效地获得枫香 420-434. [范绍斌ꎬ 苏济钰ꎬ 方甜ꎬ 等ꎬ 2021. 枫香叶斑病
某一发育时期细胞全部转录本信息ꎬ并克服了步 病原菌 [J]. 菌物学报ꎬ 41(3): 420-434.]
骤繁琐、时间和人力成本高的问题ꎮ 因此ꎬ自主设 GU XYꎬ 2016. Impacts of habitat fragmentation on genetic
diversity and differentiation of Liquidambar formosana
计枫香 EST ̄SSR 引物ꎬ并对其有效性及多态性进
populations [D]. Shanghai: East China Normal University:
行验证ꎬ得到了 18 对尚未开发的多态信息含量较 6-7. [顾辛韵ꎬ 2016. 生境片断化对枫香 (Liquidambar
高的枫香 EST ̄SSR 引物ꎬ有效性评价结果显示这 formosana)种群遗传多样性及遗传分化的影响 [D]. 上
18 对枫香 SSR 引物均可用于后续枫香的遗传多样 海: 华东师范大学: 6-7.]
HARTL DLꎬ CLARK AGꎬ 1989. Principles of population
性分析和种质资源保护的研究中ꎬ在前人研究基
genetics [ M]. 2nd ed. Sunderland: Sinauer Associatesꎬ
础上拓展了当前枫香 SSR 引物的数量和种类ꎮ 由 Inc. Publishers: 128-129.
群体验证结果可知ꎬ不同的 EST ̄SSR 分子标记在 HUANG Mꎬ HUANG XPꎬ LI BQꎬ et al.ꎬ 2021. Optimization of
群体表达上存在一定的差异ꎬ说明不同位点所在 Liquidambar formosana ISSR-PCR reaction system and primer
selection [ J/ OL]. Mol Plant Breed: 1 - 12. https:/ / kns.
基因的进化速率存在差异ꎬ多态性较低的 SSR 位
cnki.net/ kcms/ detail/ 46.1068.s.20210429.1428.010.html. [黄
点多位于保守基因上( 刘佳奇等ꎬ2020)ꎮ 通过转 敏ꎬ 黄旭萍ꎬ 李斌奇ꎬ 等ꎬ 2021. 枫香 ISSR ̄PCR 反应体系的
录组测序技术开发的枫香 EST ̄SSR 引物除用于遗 优化及引物筛选 [J/ OL]. 分子植物育种: 1-12. https:/ /
传多样性分析外ꎬ一方面可通过其位点特征回溯 kns.cnki.net/ kcms/ detail/ 46.1068.s.20210429.1428.010.html.]
LAI JXꎬ 2020. Comparative analysis reveals different
所在基因的固定或进化情况ꎬ以探究群体遗传分
mechanisms of leaf color changes in Liquidambar formosana
化问题ꎻ另一方面结合转录组信息可开展位点所
Hance. during different seasons and among different varieties
在序列基因功能性研究ꎮ 既可用于构建优良表型 [D]. Beijing: Chinese Academy of Forestry: 12-13. [赖玖
关联的特异 SSR 标记ꎬ又可为后续深入开展枫香 鑫ꎬ 2020. 枫香(Liquidambar formosana Hance.) 叶色季节
性变化及常彩叶机理研究 [D]. 北京: 中国林业科学研
叶色变化分子机理、枫香药用活性成分的合成等
究院: 12-13.]
研究提供一定的帮助ꎬ对枫香种质资源的开发、保 LI FFꎬ 2015. Analysis on the genetic diversity of Liquidambar
存和利用具有重要的指导意义ꎮ formosana of Zhengjiang Province [D]. Zhengzhou: Henan