Page 168 - 《广西植物》2024年第7期
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1 3 6 8                                广  西  植  物                                         44 卷
                                           表 2  苦荞 TCP 转录因子家族理化性质
                       Table 2  Physicochemical properties of TCP transcription factor family in tartary buckwheat
                                               氨基酸长度       分子量
               基因名称             基因 ID           Length of            等电点       脂肪指数           亚细胞定位
                                                            MW
              Gene name         Gene ID         amino acid             pI    Aliphatic index  Subcellular localization
                                                            (kD)
                                                  (aa)
               FtTCP1     FtPinG0005197300.01.T01  84       9.50      5.12      97.50       细胞质 Cytoplasm
               FtTCP2     FtPinG0004048100.01.T01  151      16.50     7.84      81.99       细胞质 Cytoplasm
               FtTCP3     FtPinG0003903800.01.T01  176      19.17     5.87      73.30        细胞核 Nucleus
               FtTCP4     FtPinG0001006600.01.T01  190      20.30     6.80      57.00        细胞核 Nucleus
               FtTCP5     FtPinG0008237800.01.T01  187      20.87     8.56      76.79        细胞核 Nucleus
               FtTCP6     FtPinG0001355700.01.T01  195      21.80     5.98      81.54        细胞核 Nucleus
               FtTCP7     FtPinG0001829800.01.T01  205      23.79     9.49      73.80        细胞核 Nucleus
               FtTCP8     FtPinG0000186600.01.T01  233      24.09     6.36      64.16        细胞核 Nucleus
               FtTCP9     FtPinG0000362000.01.T01  208      24.20     8.92      70.82        细胞核 Nucleus
               FtTCP10    FtPinG0001494600.01.T01  228      25.08     6.18      58.64        细胞核 Nucleus
               FtTCP11    FtPinG0005430300.01.T01  232      25.39     8.80      73.15        细胞核 Nucleus
               FtTCP12    FtPinG0005269500.01.T01  236      25.99     6.53      62.54        细胞核 Nucleus
               FtTCP13    FtPinG0006627500.01.T01  252      26.96     8.84      57.38        细胞核 Nucleus
               FtTCP14    FtPinG0006063400.01.T01  255      27.17     6.87      67.45        细胞核 Nucleus
               FtTCP15    FtPinG0009810500.01.T01  255      27.17     6.87      67.45        细胞核 Nucleus
               FtTCP16    FtPinG0004364900.01.T01  270      27.81     9.71      63.52        细胞核 Nucleus
               FtTCP17    FtPinG0006862400.01.T01  263      28.23     6.29      64.68        细胞核 Nucleus
               FtTCP18    FtPinG0003304100.01.T01  280      31.32     6.04      53.29        细胞核 Nucleus
               FtTCP19    FtPinG0004965900.01.T01  326      34.26     6.31      69.17        细胞核 Nucleus
               FtTCP20    FtPinG0008196900.01.T01  327      34.91     4.93      68.65        细胞核 Nucleus
               FtTCP21    FtPinG0004598500.01.T01  302      34.98     6.91      55.23        细胞核 Nucleus
               FtTCP22    FtPinG0002358700.01.T01  341      37.95     5.83      65.81        细胞核 Nucleus
               FtTCP23    FtPinG0005336100.01.T01  369      39.67     6.52      55.01        细胞核 Nucleus
               FtTCP24    FtPinG0009279400.01.T01  370      39.77     7.24      58.03        细胞核 Nucleus
               FtTCP25    FtPinG0002336500.01.T01  422      44.89     6.98      57.25        细胞核 Nucleus
               FtTCP26    FtPinG0006025100.01.T01  438      47.08     6.88      59.27        细胞核 Nucleus
               FtTCP27    FtPinG0004982400.01.T01  443      47.24     6.70      57.18        细胞核 Nucleus
               FtTCP28    FtPinG0000836000.01.T01  475      51.04     7.00      58.59        细胞核 Nucleus


            光照响应元件 G ̄box 和 box 4 存在 于 24 个 苦 荞                 2.5 染色体定位和共线性分析
            TCP 基因中ꎻ厌氧响应元件 ARE 存在于 5 个苦荞                           由图 4 可知ꎬ28 个苦荞 TCP 基因被定位到苦
            TCP 基因中ꎻ光照响应元件 Gap ̄box、CAG ̄motif 和                 荞的 8 条 染 色 体 上ꎬ 其 中ꎬ Ft8 上 分 布 的 基 因 最
            GTGGC ̄motif 分别只在 FtTCP19、FtTCP2、FtTCP20            多ꎬ有 7 个ꎬ占总基因数的 25%ꎬ说明 Ft8 染色体
            中存在ꎬ生长素响应元件 TGA ̄box 仅在 FtTCP6 中                    在苦荞 TCP 基 因 组 的 进 化 中 起 到 了 重 要 作 用ꎻ
            分布ꎮ 其中ꎬ非生物胁迫响应元件如 MBS、LAR、                         Ft1、Ft5、Ft7 染 色 体 上 分 布 的 基 因 最 少ꎬ均 只 有
            GC ̄motif、ARE 在大部分的 TCP 基因中都有分布ꎬ                    2 个ꎮ
            其中 ARE 只在 FtTCP6、FtTCP13 和 FtTCP17 基因                  为了分析 TCP 基因在物种内的进化关系ꎬ在
            中没有分布ꎮ 因此推测苦荞 TCP 基因在苦荞的光                          苦荞全基因组内进行共线性分析( 图 5)ꎬ发现共
            周期、激素调节和逆境胁迫中发挥重要作用ꎮ                               有 5 个苦荞 TCP 基因的 4 对片段复制基因对ꎬ占
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