Page 168 - 《广西植物》2024年第7期
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表 2 苦荞 TCP 转录因子家族理化性质
Table 2 Physicochemical properties of TCP transcription factor family in tartary buckwheat
氨基酸长度 分子量
基因名称 基因 ID Length of 等电点 脂肪指数 亚细胞定位
MW
Gene name Gene ID amino acid pI Aliphatic index Subcellular localization
(kD)
(aa)
FtTCP1 FtPinG0005197300.01.T01 84 9.50 5.12 97.50 细胞质 Cytoplasm
FtTCP2 FtPinG0004048100.01.T01 151 16.50 7.84 81.99 细胞质 Cytoplasm
FtTCP3 FtPinG0003903800.01.T01 176 19.17 5.87 73.30 细胞核 Nucleus
FtTCP4 FtPinG0001006600.01.T01 190 20.30 6.80 57.00 细胞核 Nucleus
FtTCP5 FtPinG0008237800.01.T01 187 20.87 8.56 76.79 细胞核 Nucleus
FtTCP6 FtPinG0001355700.01.T01 195 21.80 5.98 81.54 细胞核 Nucleus
FtTCP7 FtPinG0001829800.01.T01 205 23.79 9.49 73.80 细胞核 Nucleus
FtTCP8 FtPinG0000186600.01.T01 233 24.09 6.36 64.16 细胞核 Nucleus
FtTCP9 FtPinG0000362000.01.T01 208 24.20 8.92 70.82 细胞核 Nucleus
FtTCP10 FtPinG0001494600.01.T01 228 25.08 6.18 58.64 细胞核 Nucleus
FtTCP11 FtPinG0005430300.01.T01 232 25.39 8.80 73.15 细胞核 Nucleus
FtTCP12 FtPinG0005269500.01.T01 236 25.99 6.53 62.54 细胞核 Nucleus
FtTCP13 FtPinG0006627500.01.T01 252 26.96 8.84 57.38 细胞核 Nucleus
FtTCP14 FtPinG0006063400.01.T01 255 27.17 6.87 67.45 细胞核 Nucleus
FtTCP15 FtPinG0009810500.01.T01 255 27.17 6.87 67.45 细胞核 Nucleus
FtTCP16 FtPinG0004364900.01.T01 270 27.81 9.71 63.52 细胞核 Nucleus
FtTCP17 FtPinG0006862400.01.T01 263 28.23 6.29 64.68 细胞核 Nucleus
FtTCP18 FtPinG0003304100.01.T01 280 31.32 6.04 53.29 细胞核 Nucleus
FtTCP19 FtPinG0004965900.01.T01 326 34.26 6.31 69.17 细胞核 Nucleus
FtTCP20 FtPinG0008196900.01.T01 327 34.91 4.93 68.65 细胞核 Nucleus
FtTCP21 FtPinG0004598500.01.T01 302 34.98 6.91 55.23 细胞核 Nucleus
FtTCP22 FtPinG0002358700.01.T01 341 37.95 5.83 65.81 细胞核 Nucleus
FtTCP23 FtPinG0005336100.01.T01 369 39.67 6.52 55.01 细胞核 Nucleus
FtTCP24 FtPinG0009279400.01.T01 370 39.77 7.24 58.03 细胞核 Nucleus
FtTCP25 FtPinG0002336500.01.T01 422 44.89 6.98 57.25 细胞核 Nucleus
FtTCP26 FtPinG0006025100.01.T01 438 47.08 6.88 59.27 细胞核 Nucleus
FtTCP27 FtPinG0004982400.01.T01 443 47.24 6.70 57.18 细胞核 Nucleus
FtTCP28 FtPinG0000836000.01.T01 475 51.04 7.00 58.59 细胞核 Nucleus
光照响应元件 G ̄box 和 box 4 存在 于 24 个 苦 荞 2.5 染色体定位和共线性分析
TCP 基因中ꎻ厌氧响应元件 ARE 存在于 5 个苦荞 由图 4 可知ꎬ28 个苦荞 TCP 基因被定位到苦
TCP 基因中ꎻ光照响应元件 Gap ̄box、CAG ̄motif 和 荞的 8 条 染 色 体 上ꎬ 其 中ꎬ Ft8 上 分 布 的 基 因 最
GTGGC ̄motif 分别只在 FtTCP19、FtTCP2、FtTCP20 多ꎬ有 7 个ꎬ占总基因数的 25%ꎬ说明 Ft8 染色体
中存在ꎬ生长素响应元件 TGA ̄box 仅在 FtTCP6 中 在苦荞 TCP 基 因 组 的 进 化 中 起 到 了 重 要 作 用ꎻ
分布ꎮ 其中ꎬ非生物胁迫响应元件如 MBS、LAR、 Ft1、Ft5、Ft7 染 色 体 上 分 布 的 基 因 最 少ꎬ均 只 有
GC ̄motif、ARE 在大部分的 TCP 基因中都有分布ꎬ 2 个ꎮ
其中 ARE 只在 FtTCP6、FtTCP13 和 FtTCP17 基因 为了分析 TCP 基因在物种内的进化关系ꎬ在
中没有分布ꎮ 因此推测苦荞 TCP 基因在苦荞的光 苦荞全基因组内进行共线性分析( 图 5)ꎬ发现共
周期、激素调节和逆境胁迫中发挥重要作用ꎮ 有 5 个苦荞 TCP 基因的 4 对片段复制基因对ꎬ占