Page 113 - 《广西植物》2020年第6期
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６ 期 蓝雨纯等: 小立碗藓扩展蛋白基因家族的鉴定与生物信息学分析 ８ ５ ９
Ａ. Ｅｘｐａｎｓｉｎ 基因的保守基序(ｍｏｔｉｆ)分布ꎮ １０ 个 ｍｏｔｉｆ 用不同颜色的方框表示(详见表 ２)ꎮ Ｂ. Ｅｘｐａｎｓｉｎ 基因内含子、外显子分
布ꎮ 绿色方框表示外显子ꎬ黑色线条表示内含子ꎮ 黄色方框表示的是 Ｅｘｐａｎｓｉｎ 基因的上游 / 下游区域ꎮ 外显子的长度可以通过
底部的比例尺推断出来ꎮ
Ａ. Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｓ ｏｆ ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ ｍｏｔｉｆｓ ｉｎ Ｅｘｐａｎｓｉｎ ｇｅｎｅｓ. Ｔｅｎ ｐｕｔａｔｉｖｅ ｍｏｔｉｆｓ ａｒｅ ｉｎｄｉｃａｔｅｄ ｉｎ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｃｏｌｏｒｅｄ ｂｏｘｅｓ ( Ｓｅｅ Ｔａｂｌｅ ２ ｆｏｒ
ｄｅｔａｉｌｓ.). Ｂ. Ｅｘｏｎ/ ｉｎｔｒｏｎ ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ Ｅｘｐａｎｓｉｎ ｇｅｎｅｓ. Ｇｒｅｅｎ ｂｏｘｅｓ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔ ｅｘｏｎｓ ａｎｄ ｂｌａｃｋ ｌｉｎｅｓ ｗｉｔｈ ｓａｍｅ ｌｅｎｇｔｈ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔ ｉｎｔｒｏｎｓ. Ｔｈｅ
ｕｐｓｔｒｅａｍ/ ｄｏｗｎｓｔｒｅａｍ ｒｅｇｉｏｎ ｏｆ Ｅｘｐａｎｓｉｎ ｇｅｎｅｓ ａｒｅ ｉｎｄｉｃａｔｅｄ ｉｎ ｙｅｌｌｏｗ ｂｏｘｅｓ. Ｔｈｅ ｌｅｎｇｔｈ ｏｆ ｅｘｏｎｓ ｃａｎ ｂｅ ｉｎｆｅｒｒｅｄ ｂｙ ｔｈｅ ｓｃａｌｅ ａｔ ｔｈｅ ｂｏｔｔｏｍ.
图 １ 小立碗藓 Ｅｘｐａｎｓｉｎ 基因保守基序及基因结构分析
Ｆｉｇ. １ Ｇｅｎｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ ｍｏｔｉｆ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｅｘｐａｎｓｉｎ ｇｅｎｅ ｉｎ Ｐｈｙｓｃｏｍｉｔｒｅｌｌａ ｐａｔｅｎｓ
源蛋白间的 Ｂｏｏｔｓｔｒａｐ 值为 ９９ꎬ而物种内的旁系同 因家族染色体定位信息ꎬ将小立碗藓中 ３８ 个扩展
源蛋白数目为 １ꎮ 蛋白定位在 １５ 条染色体上ꎬ图 ４ 显示小立碗藓第
２.４ 小立碗藓 ＥＸＰ 基因家族的染色体位置 ８ 条、第 １４ 条染色体上均定位了 ６ 个 ＥＸＰ 基因ꎮ
通过 Ｐｈｙｔｏｚｏｍｅ 数据库获得小立碗藓 ＥＸＰ 基 根据基因簇的定义可发现小立碗藓 ＥＸＰ 基因家族
