Page 145 - 《广西植物》2020年第6期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｊｕｎ. ２０２０ꎬ ４０(６): ８９１－９００
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０１９０９０４５
董亚萍ꎬ 杨仕梅ꎬ 赵德刚ꎬ 等. 烟草 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因家族的生物信息学分析 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ２０２０ꎬ ４０(６): ８９１－９００.
ＤＯＮＧ ＹＰꎬ ＹＡＮＧ ＳＭꎬ ＺＨＡＯ ＤＧꎬ ｅｔ ａｌ. Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｏｂａｃｃｏ ＴＩＲ￣ＮＢＳ ｇｅｎｅ ｆａｍｉｌｙ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ２０２０ꎬ ４０(６): ８９１－９００.
烟草 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因家族的生物信息学分析
董亚萍 ꎬ 杨仕梅 ꎬ 赵德刚 １ꎬ２ ꎬ 宋 莉 １∗
１
１
( １. 贵州大学 生命科学学院 / 农业生物工程研究院ꎬ 山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室ꎬ
贵州省农业生物工程重点实验室ꎬ 贵阳 ５５００２５ꎻ ２. 贵州省农业科学院ꎬ 贵阳 ５５０００６ )
摘 要: ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因是一类与植物抗病调节和生长发育密切相关的基因ꎬ其特征解析有助于对植物免疫
和发育调节的认识ꎮ 该研究通过生物信息学分析方法ꎬ从基因鉴定、染色体分布、基因结构、蛋白性质和结
构、信号肽、亚细胞定位和顺式作用元件等方面ꎬ对烟草 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因家族进行了鉴定和分子特性分析ꎮ 结
果表明:烟草 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因家族含有 ３０ 条成员ꎬ分布在 ２１ 条染色体上ꎬ含有 ３ ~ ８ 个保守基序ꎻ编码蛋白均
为不稳定蛋白ꎬ无信号肽ꎬ主要分布于细胞核、细胞质和叶绿体中ꎬ二级结构以 α￣螺旋和无规则卷曲为主要
构成元件ꎻ进化时主要受纯化选择作用ꎬ与番茄的 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因亲缘关系最近ꎻ顺式作用元件分析表明其可
能受光照、温度以及生长素、茉莉酸甲酯、脱落酸、水杨酸、赤霉素等激素调控ꎮ 该研究结果为进一步探究
ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因的生物学功能及提高植物产量和品质提供了依据ꎮ
关键词: 烟草ꎬ 抗病调节ꎬ 生长发育ꎬ 植物免疫ꎬ ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因家族ꎬ 生物信息学分析
中图分类号: Ｑ９４３ 文献标识码: Ａ
文章编号: １０００￣３１４２(２０２０)０６￣０８９１￣１０ 开放科学(资源服务)标识码(ＯＳＩＤ):
Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｏｂａｃｃｏ ＴＩＲ￣ＮＢＳ ｇｅｎｅ ｆａｍｉｌｙ
１ １ １ꎬ２ １∗
ＤＯＮＧ Ｙａｐｉｎｇ ꎬ ＹＡＮＧ Ｓｈｉｍｅｉ ꎬ ＺＨＡＯ Ｄｅｇａｎｇ ꎬ ＳＯＮＧ Ｌｉ
( １. Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ ａｎｄ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ａｇｒｏ￣Ｂｉｏｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇꎬ Ｇｕｉｚｈｏｕ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ/ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｐｌａｎｔ Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ Ｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎ
ａｎｄ Ｇｅｒｍｐｌａｓｍ Ｉｎｎｏｖａｔｉｏｎ ｉｎ Ｍｏｕｎｔａｉｎｏｕｓ Ｒｅｇｉｏｎ (Ｍｉｎｉｓｔｒｙ ｏｆ Ｅｄｕｃａｔｉｏｎ) / Ｇｕｉｚｈｏｕ Ｋｅｙ Ｌａｂ ｏｆ Ａｇｒｏ￣Ｂｉｏｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇꎬ
Ｇｕｉｙａｎｇ ５５００２５ꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ２. Ｇｕｉｚｈｏｕ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｇｕｉｙａｎｇ ５５０００６ꎬ Ｃｈｉｎａ )
Ａｂｓｔｒａｃｔ: ＴＩＲ￣ＮＢＳ ｇｅｎｅ ｉｓ ａ ｃｌａｓｓ ｏｆ ｇｅｎｅ ｃｌｏｓｅｌｙ ｒｅｌａｔｅｄ ｔｏ ｐｌａｎｔ ｄｉｓｅａｓｅ ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ａｎｄ ｇｒｏｗｔｈ ａｎｄ ｄｅｖｅｌｏｐ￣
ｍｅｎｔꎬ ａｎｄ ｉｔｓ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ｃｏｎｔｒｉｂｕｔｅｓ ｔｏ ｔｈｅ ｕｎｄｅｒｓｔａｎｄｉｎｇ ｏｆ ｐｌａｎｔ ｉｍｍｕｎｉｔｙ ａｎｄ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ.
Ｔｈｒｏｕｇｈ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ｍｅｔｈｏｄꎬ ｔｈｅ ＴＩＲ￣ＮＢＳ ｇｅｎｅ ｆａｍｉｌｙ ｏｆ ｔｏｂａｃｃｏ ｗａｓ ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ ａｎｄ ｍｏｌｅｃｕｌａｒｌｙ ａｎａｌｙｚｅｄ ｆｒｏｍ
ｔｈｅ ａｓｐｅｃｔｓ ｏｆ ｇｅｎｅ ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎꎬ ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎꎬ ｇｅｎｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅꎬ ｐｒｏｔｅｉｎ ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ ａｎｄ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅꎬ ｓｉｇｎａｌ ｐｅｐｔｉｄｅꎬ
ｓｕｂｃｅｌｌｕｌａｒ ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ ａｎｄ ｃｉｓ￣ａｃｔｉｎｇ ｅｌｅｍｅｎｔｓ. Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ ｗｅｒｅ ａｓ ｆｏｌｌｏｗｓ: Ｔｈｅ ＴＩＲ￣ＮＢＳ ｇｅｎｅ ｆａｍｉｌｙ ｃｏｎｔａｉｎｅｄ ３０ ｍｅｍ￣
收稿日期: ２０１９－１２－２７
基金项目: 国家转基因生物新品种培育科技重大专项项目(２０１６ＺＸ０８０１０００３)ꎻ贵州省科技计划项目( 黔科合基础 [２０１７]１０４４
号ꎬ黔科合平台人才 [２０１７]５７８８ 号) [Ｓｕｐｐｏｒｔｅｄ ｂｙ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｍａｊｏｒ Ｐｒｏｇｒａｍ ｏｆ Ｇｅｎｅｔｉｃａｌｌｙ Ｍｏｄｉｆｉｅｄ Ｏｒｇａｎｉｓｍｓ Ｂｒｅｅｄｉｎｇ ｏｆ Ｃｈｉｎａ
(２０１６ＺＸ０８０１０００３)ꎻ Ｇｕｉｚｈｏｕ Ｐｒｏｖｉｎｃｉａｌ Ｐｒｏｇｒａｍ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ([２０１７]１０４４ꎬ[２０１７]５７８８)]ꎮ
作者简介: 董亚萍(１９９３－)ꎬ女( 黎族)ꎬ贵州兴仁县人ꎬ研究生ꎬ主要从事植物发育分子生物学研究ꎬ( Ｅ￣ｍａｉｌ) １１３４３１６７１０＠
ｑｑ.ｃｏｍꎮ
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通信作者: 宋莉ꎬ博士ꎬ教授ꎬ主要从事植物基因工程研究ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｌｐｓｓｓｌ＠ １２６.ｃｏｍꎮ
