Page 149 - 《广西植物》2020年第6期

６ 期 董亚萍等: 烟草 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因家族的生物信息学分析 ８ ９ ５

图 ３ 烟草 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 蛋白保守基序的分布
Ｆｉｇ. ３ Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｏｆ ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ ｍｏｔｉｆｓ ｏｆ ＴＩＲ￣ＮＢＳ ｐｒｏｔｅｉｎ ｉｎ Ｎｉｃｏｔｉａｎａ ａｔｔｅｎｕａｔａ

位分析ꎬ表 １ 结果显示烟草 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因家族主要 Ｄａꎮ 分析表明ꎬＴＩＲ￣ＮＢＳ 蛋白为不稳定蛋白ꎬ其中
定位在细胞核、细胞质、叶绿体ꎮ 信号肽分析结果 ＯＩＴ３５７４５ 的不稳定系数最小ꎬ为 ３３.９８ꎮ ＴＩＲ￣ＮＢＳ

表明ꎬＴＩＲ￣ＮＢＳ 基因家族成员均不含有信号肽ꎮ 蛋白脂溶指数为 ９０.０９ ~ １０４.２３ꎬ总平均亲水性为
２.５ ＴＩＲ￣ＮＢＳ 蛋白的理化性质 －０.４４５ ~ －０.１１５ꎬ均为亲水性蛋白ꎮ

对烟草 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 家族蛋白的特征进行分析ꎬ ２.６ ＴＩＲ－ＮＢＳ 基因的进化选择
表 ２ 结 果 表 明 烟 草 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 蛋 白 长 度 范 围 在 非同义替换(Ｋａ)和同义替换(Ｋｓ) 比值 Ｋａ / Ｋｓ
５０５ ~ １ ５０８ ａａ 之 间ꎬ 相 对 分 子 质 量 大 小 范 围 为 可反映生物进化的过程中所受到的选择压力ꎮ 对
４６ ７３３.２３ ~ １７２ ５２８.７１ Ｄａꎬ 理 论 等 电 点 范 围 在 来源于 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 亚家族间亲缘关系最近的 １０ 条
５.７８ ~ ９. ４０ 之 间ꎬ 编 码 氨 基 酸 序 列 最 长 的 是 基因成员进行 Ｋａ / Ｋｓ 分析ꎬ表 ３ 结果显示该基因
ＯＩＴ３４９３２ꎬ其相对分子质量也最大ꎬ为 １７２ ５２８.７１ 对间的 Ｋａ / Ｋｓ 比值均小于 １ꎬ表明烟草 ＴＩＲ￣ＮＢＳ 基
ＤａꎻＯＩＴ３９３６０ 相 对 分 子 质 量 最 小ꎬ 为 ４６ ７３３. ２３ 因在进化时主要受纯化选择作用ꎮ