Page 137 - 《广西植物》2021年第6期

ᤃ 期 高梅等᧥ 小立碗藓 ᓂᢃ༁ᥘ 型类受体激酶基因家族生物信息学分析 ँ ऐ ጢ

不同颜色方框表示不同的 ʛᆍቝᑕᔽႿ༁ᖔ各蛋白长度可通过底部比例尺推断ᤥ
᧕ᔽ஦஦ᔀʢᔀႿᡷ ዹᆍ᤟ᆍʢ ᤦᆍ଴ᔀ༁ ᔽႿʛᔽዹᑕᡷᔀ ʛᔽ஦஦ᔀʢᔀႿᡷ ʛᆍቝᑕᔽႿ༁ᖔ ᑕႿʛ ᡷၤᔀ ᤟ᔀႿ੫ᡷၤ ᆍ஦ ᔀᑕዹၤ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ዹᑕႿ ᤦᔀ ᔽႿ஦ᔀʢʢᔀʛ ᤦᢃ ᡷၤᔀ ᤦᆍᡷᡷᆍቝ ༁ዹᑕ᤟ᔀ঎
图 ԰জ 小立碗藓 ᓂɟ᣽ 蛋白保守结构域ྉʛᆍቝᑕᔽႿɯ分析
èᔽ੫঎ ԰জ ऊᆍႿ༁ᔀʢ׹ᑕᡷᔽ׹ᔀ ʛᆍቝᑕᔽႿ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ᓂɟ᣽ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ᔽႿ ۗ၊ᡥ໧ዞᅳቂᔠᡙʗᓣᤀᤀᐹ ᡓᐹᡙᓣႥ໧

为了进一步将小立碗藓 ᒦɔᣞ 基因家族成员分 碗藓 ᓂɟ᣽ 家族成员也存在两个分支ᖔ同源性在 ँԡᠮ
类并研究其与其他植物 ᒦɔᣞ 基因间的进化关系ᖔ分 以上ᖔ可能为直系同源基因ᤥ
别选取 ϟԡ 个水稻ྉ 单子叶模式植物ɯܦጢ 个拟南芥 ԣॹ྽ 小立碗藓 ᒦɔᣞ 基因家族的染色体定位
ྉ双子叶模式植物ɯ 和 ԰ሕ 个蒺藜苜蓿ྉ豆科模式植 通过 ጶႿ༁ᔀቝᤦ᤟ ۪᤟ᑕႿᡷ༁ 数据库获得小立碗藓 ᓂɟ᣽
物ɯ 中已鉴定出的所有 ᒦᡥ໧᤹᤬ቴᒦᣞ 基因的氨基酸序 染色体定位信息ᖔ将小立碗藓 ԰ϟ 个 ᒦɔᣞ 基因定位
列ᖔ与小立碗藓 ᒦᡥ໧᤹᤬ቴᒦᣞ 共同构建系统进化树ᖔ结 在 ࿗ 条染色体上ᖔ结果如图 ࿗ 所示ᤥ 小立碗藓第 Ꭾ
果如图 ሕ 所示ᤥ࿗ 种植物中的 ᓂɟ᣽ 蛋白存在于 ࿗ 个 条染色体上定位了 ँ 个基因ᖔ为定位 ᒦɔᣞ 基因数目
亚族ྉᓂɟ᣽᥋᧧ܦᓂɟ᣽᥋֒ܦᓂɟ኏᥋᧧ܦᓂɟ኏᥋֒ɯ 中ᖔ而小立碗 最多的一条染色体ଫ第 ϟ 条ܦ第 ँ 条ܦ第 ϟϟ 条染色体

藓 ᓂɟ᣽ 蛋白仅存在于 ԰ 个亚家族᧥ᓂɟ᣽᥋֒和 ᓂɟ኏᥋᧧ᤥ 上分别定位了 ሕܦጢܦ࿗ 个基因ᖔ可见小立碗藓 ԰ϟ 个
ᓂɟ᣽᥋֒亚族中有 ऐ 个小 立 碗 藓 ᓂɟ᣽ 家族成员 ᒦɔᣞ 基因在染色体分布上是相对集中的ᤥ 从图 ࿗ 中

ྉ۪ᡱᓂɟ᣽ँͱ۪ᡱᓂɟ᣽ϟᤃɯᖔ另外 ϟሕ 个成员属于 ᓂɟ኏᥋᧧ 可明显看到在 ࿗ 条染色体上均出现小型基因簇ᖔ根
亚族ᤥᓂɟ᣽᥋֒亚族中的小立碗藓 ᓂɟ᣽ 家族成员有 据基因簇的定义ᖔ基因簇成员在结构和功能上可能
两个分支ᖔ同源性在 ँԡᠮ以上ଫᓂɟ኏᥋᧧ 亚族中的小立 具有明显的相似性ᤥ 其中ᖔ࿗ 条染色体上均出现位