Page 144 - 《广西植物》2021年第6期
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ँ ँ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷
图 জ ᓂዹ୩ዶ᧧ 蛋白二级结构预测分析
èᔽ੫ জ ۪ʢᔀʛᔽዹᡷᔽᆍႿ ᑕႿᑕᢃ༁ᔽ༁ ᆍ ᓂዹ୩ዶ᧧ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ༁ᔀዹᆍႿʛᑕʢᢃ ༁ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀ
ԣॹԣ ᒦዞዛᧇ 蛋白信号肽预测和跨膜结构分析 磷酸化位点中有 ሕԡ 个丝氨酸ྉ୩ᔀʢɯܦᤃ 个苏氨酸
信号肽大多位于氨基酸序列的 શ 端的短肽 ྉఋၤʢɯܦϟԡ 个酪氨酸ྉఋᢃʢɯᤥ
链ᖔ一般长度为 ጢጲሕԡ 个氨基酸ᤥ 利用在线分析工 利用 શऊା᧧ ऊᨃશ୩ጶጶ᧕ ᧕ᆍቝᑕᔽႿ ዶʢዹၤᔽᡷᔀዹᡷࣼʢᔀ
具 ୩ᔽ੫Ⴟᑕ᧧۪ ࿗ϟ ୩ᔀʢᔀʢ 的 ᔀࣼҴ ႿᔀᡷऔᆍʢҴ 算法对 ᓂዹ୩ዶ᧧ ᔀᡷʢᔽᔀᑕ ఋᆍᆍ 工具对 ᓂዹ୩ዶ᧧ 的保守结构域进行分
蛋白是否含有信号肽进行预测ྉ 图 ሕɯᖔ显示 ᓂዹ୩ዶ᧧ 析ྉ图 ᤃɯᖔ结果表明该蛋白包含两个保守结构域ᖔ
蛋白 没有信号肽ᖔ 属 于 非 分泌蛋白ᖔ 由此推测 位于 શ᥋端的 ۪ᑕቝ ᧕ВèሕሕጢᎮ 结构域ྉϟሕ ጲ ϟϟᎮɯ 和
ᓂዹ୩ዶ᧧ 蛋白在细胞质中合成ᖔ没有蛋白转运功能ᤥ ᥈ᢃዹᆍᡸሕ 结构域ྉϟጢ ጲ ጢँሕɯᖔ属于糖基水解酶基
跨膜区即蛋白质序列中跨越细胞膜的区域ᖔ 因家族 ሕ 超家族ᤥ
通常为 ም᥋螺旋结构ᖔ约 ԡ ጲ ጢ 个氨基酸残基ᖔ构 ԣॹ ᒦዞዛᧇ 系统进化关系分析
成跨膜区蛋白的氨基酸大部分是疏水性氨基酸ᤥ 通过 શऊା᧧ ᤦᑕ༁ᡷ 比对分析发现ᖔጸ妃子笑ᆥᓂዹ୩ዶ᧧
利用 ఋᥘ̀ᥘᥘ 在线软件对 ᓂዹ୩ዶ᧧ 蛋白进行跨膜结 与龙眼ྉዶȮᎮԡँᎮऐɯܦ漆树ྉዶ̀ାሕሕँϟɯܦ柑橘ྉᣮ۪ ᡸ
构分析ᖔ结果表明ᖔᓂዹ୩ዶ᧧ 在 ࿗ሕ ጲ ᤃሕ 氨基酸范围产 ԡ࿗ԡ࿗ᤃᎮᤃሕɯܦ巴西橡胶树 ྉ ᣮ۪ ᡸ ԡϟᤃऐᎮԡँ࿗ɯܦ 木薯
生 ϟ 个跨膜区ྉ图 ࿗ɯᤥ ྉዶè̀ᎮᎮँጢᤃ ɯܦ 桃 ྉ ᣮ۪ ᡸ ԡԡᎮϟऐऐጢ࿗ ɯܦ 可可 ྉᣮ۪ ᡸ
ԣॹᇺ ᒦዞዛᧇ 蛋白磷酸化位点和保守结构域分析 ԡϟᎮँᎮँϟँɯܦ苹果ྉዶèВጢᤃऐऐɯܦ沙梨ྉାዶ᥈ሕԡँϟँɯܦ
利用 શᔀᡷ۪ၤᆍ༁ ሕϟ ୩ᔀʢᔀʢ 在线软件分析 ᓂዹ୩ዶ᧧ 葡萄ྉᣮ۪ᡸԡԡᤃጢጢሕ࿗ɯ ୩ዶ᧧ 氨基酸序列的同源性分
磷酸化位点ᖔ结果如图 ጢ 所示ᤥ 可能的蛋白激酶 别为 ँጢ ϟऐᠮܦ Ꭾँ ጢሕᠮܦ ᎮᎮ ऐϟᠮܦ ᎮᎮ ऐᠮܦ ᎮᎮ ࿗ऐᠮܦ
