Page 53 - 广西植物2024年1期
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１ 期 汪雨等: 两种珍稀白蝶兰属(兰科)叶绿体基因组比较分析 ４ ９
表 １ 叶绿体基因组的基本特征 表 ２ 龙头兰和景洪白蝶兰叶绿体基因组基因
Ｔａｂｌｅ １ Ｂａｓｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ Ｔａｂｌｅ ２ Ｇｅｎｅｓ ｉｎ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ
Ｐｅｃｔｅｉｌｉｓ ｓｕｓａｎｎａｅ ａｎｄ Ｐ. ｈａｗｋｅｓｉａｎａ
项目 龙头兰 景洪白蝶兰
Ｉｔｅｍ Ｐｅｃｔｅｉｌｉｓ ｓｕｓａｎｎａｅ Ｐ. ｈａｗｋｅｓｉａｎａ
基因类型 基因名称
基因组长度 Ｇｅｎｏｔｙｐｅ Ｇｅｎｅ ｎａｍｅ
１５４ ４０７ １５３ ８９１
Ｇｅｎｏｍｅ ｓｉｚｅ (ｂｐ)
光系统 Ｉ ｐｓａＡꎬ ｐｓａＢꎬ ｐｓａＣꎬ ｐｓａＩꎬ ｐｓａＪ
ＬＳＣ 区长度 Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ Ｉ
８４ ２０４ ８３ ７５６
ＬＳＣ ｓｉｚｅ (ｂｐ)
光系统 Ⅱ ｐｓｂＡꎬ ｐｓｂＢꎬ ｐｓｂＣꎬ ｐｓｂＤꎬ ｐｓｂＥꎬ
ＳＳＣ 区长度 Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ Ⅱ ｐｓｂＦꎬ ｐｓｂＨꎬ ｐｓｂＩꎬ ｐｓｂＪꎬ ｐｓｂＫꎬ
１７ １０３ １７ ０８９
ＳＳＣ ｓｉｚｅ (ｂｐ) ｐｓｂＬꎬ ｐｓｂＭꎬ ｐｓｂＴꎬ ｐｓｂＺ
ＩＲ 区长度 细胞色素复合物 ｐｅｔＡꎬ ｐｅｔＢ ꎬ ｐｅｔＤ ꎬ ｐｅｔＧꎬ
２６ ５５０ ２６ ５２３
ＩＲ ｓｉｚｅ (ｂｐ) Ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｂ / ｆ ｃｏｍｐｌｅｘ ｐｅｔＬꎬ ｐｅｔＮ
蛋白质编码基因数量 ＡＴＰ 合成酶 ａｔｐＡꎬ ａｔｐＢꎬ ａｔｐＥꎬ ａｔｐＦ ꎬ
７７ ７７
Ｎｏ. ｏｆ ｐｒｏｔｅｉｎ ｃｏｄｉｎｇ ｇｅｎｅｓ ＡＴＰ ｓｙｎｔｈａｓｅ ａｔｐＨꎬ ａｔｐＩ
ｒＲＮＡ 数量 ＮＡＤＨ 脱氢酶 ｎｄｈＡ ꎬ ｎｄｈＢ ( ×２)ꎬ ｎｄｈＣꎬ
４ ４
Ｎｏ. ｏｆ ｒＲＮＡ ＮＡＤＨ ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ ｎｄｈＤꎬ ｎｄｈＥꎬ ｎｄｈＦꎬ ｎｄｈＧꎬ
ｎｄｈＨꎬ ｎｄｈＩꎬ ｎｄｈＪꎬ ｎｄｈＫ
ｔＲＮＡ 数量
３０ ３０
Ｎｏ. ｏｆ ｔＲＮＡ 二磷酸核酮糖羧化酶大亚基 ｒｂｃＬ
ＲｕｂｉｓＣＯ ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ
总 ＧＣ 含量
３６.５ ３６.６
Ｔｏｔａｌ ＧＣ ｃｏｎｔｅｎｔ (％) 光系统组装 / 稳定因子 ｐａｆＩ ꎬ ｐａｆⅡ
Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ ａｓｓｅｍｂｌｙ / ｓｔａｂｉｌｉｔｙ
ＬＳＣ 区 ＧＣ 含量
３４.０ ３４.１ ｆａｃｔｏｒｓ
ＧＣ ｃｏｎｔｅｎｔ ｉｎ ＬＳＣ (％)
ＲＮＡ 聚合酶 ｒｐｏＡꎬ ｒｐｏＢꎬ ｒｐｏＣ１ ꎬ ｒｐｏＣ２
ＳＳＣ 区 ＧＣ 含量 ＲＮＡ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ
２８.９ ２８.９
ＧＣ ｃｏｎｔｅｎｔ ｉｎ ＳＳＣ (％)
核糖体蛋白小亚基 (ＳＳＵ) ｒｐｓ２ꎬ ｒｐｓ３ꎬ ｒｐｓ４ꎬ ｒｐｓ７ ( ×２)ꎬ
ＩＲ 区 ＧＣ 含量
４３.０ ４３.０ Ｓｍａｌｌ ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｒｐｓ８ꎬ ｒｐｓ１１ꎬ ｒｐｓ１２ ( ×２)ꎬ
ＧＣ ｃｏｎｔｅｎｔ ｉｎ ＩＲ (％) ｐｒｏｔｅｉｎｓ (ＳＳＵ) ｒｐｓ１４ꎬ ｒｐｓ１５ꎬ ｒｐｓ１６ ꎬ ｒｐｓ１８ꎬ
ｒｐｓ１９ ( ×２)
凤花、Ｈ. ｃｈｅｊｕｅｎｓｉｓ、鹅毛玉凤花、景洪白蝶兰、龙头 核糖体蛋白大亚基 (ＬＳＵ) ｒｐｌ２ ( ×２)ꎬ ｒｐｌ１４ꎬ ｒｐｌ１６ ꎬ
Ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｒｐｌ２０ꎬ ｒｐｌ２３ ( ×２)ꎬ ｒｐｌ３２ꎬ
兰聚为一个单系分支ꎬ而落地金钱、狭叶白蝶兰、 ｐｒｏｔｅｉｎｓ (ＬＳＵ) ｒｐｌ３３ꎬ ｒｐｌ３６
Ｈ. ｃｒｕｃｉｆｏｒｍｉｓ、线叶十字兰聚为一个单系分支ꎮ 龙 其他基因 ｃｌｐＰ１ ꎬ ｍａｔＫꎬ ａｃｃＤꎬ ｃｃｓＡꎬ
Ｏｔｈｅｒ ｇｅｎｅｓ ｉｎｆＡꎬ ｃｅｍＡ
头兰、鹅毛玉凤花和景洪白蝶兰则聚为一个亚分
支ꎬ而后二者形成了姐妹群的关系ꎬ表明三者的亲 假定叶绿体开放性阅读框(ｙｃｆ) ｙｃｆ１ꎬ ｙｃｆ２ ( ×２)
Ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｒｅａｄｉｎｇ
缘关系较近ꎮ ２ 种白蝶兰属嵌入玉凤花属ꎬ表明这 ｆｒａｍｅｓ(ｙｃｆ)
２ 属从叶绿体基因 组 构 建 的 系 统 发 育 树 上 不 能 核糖体 ＲＮＡ ｒｒｎ４.５ ( ×２)ꎬ ｒｒｎ５ ( ×２)ꎬ
Ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ＲＮＡｓ ｒｒｎ１６ ( ×２)ꎬ ｒｒｎ２３ ( ×２)
分开ꎮ
转运 ＲＮＡ ｔｒｎＡ￣ＵＧＣ ( × ２ )ꎬ ｔｒｎＣ￣ＧＣＡꎬ
Ｔｒａｎｓｆｅｒ ＲＮＡｓ ｔｒｎＤ￣ＧＵＣꎬ ｔｒｎＥ￣ＵＵＣꎬ ｔｒｎＦ￣
３ 讨论与结论 ＧＡＡꎬ ｔｒｎｆＭ￣ＣＡＵꎬ ｔｒｎＧ￣ＧＣＣ ꎬ
ｔｒｎＧ￣ＵＣＣ ꎬ ｔｒｎＨ￣ＧＵＧ ( × ２)ꎬ
ｔｒｎＩ￣ＣＡＵ ( ×２)ꎬ ｔｒｎＩ￣ＧＡＵ ( ×
３.１ 基因组序列特征比较分析 ２)ꎬ ｔｒｎＫ￣ＵＵＵ ꎬ ｔｒｎＬ￣ＣＡＡ ( ×
２ )ꎬ ｔｒｎＬ￣ＵＡＡ ꎬ ｔｒｎＬ￣ＵＡＧꎬ
在兰科红门兰亚族中玉凤花属、舌唇兰属、鸟 ｔｒｎＭ￣ＣＡＵꎬ ｔｒｎＮ￣ＧＵＵ ( × ２ )ꎬ
ｔｒｎＰ￣ＵＧＧꎬ ｔｒｎＱ￣ＵＵＧꎬ ｔｒｎＲ￣
足兰属( Ｓａｔｙｒｉｕｍ)、无柱兰属( Ａｍｉｔｏｓｔｉｇｍａ)、手参 ＡＣＧ ( × ２ )ꎬ ｔｒｎＲ￣ＵＣＵꎬ ｔｒｎＳ￣
ＧＣＵꎬ ｔｒｎＳ￣ＧＧＡꎬ ｔｒｎＳ￣ＵＧＡꎬ
属(Ｇｙｍｎａｄｅｎｉａ)等属已有叶绿体基因组的报道ꎬ ｔｒｎＴ￣ＧＧＵꎬ ｔｒｎＴ￣ＵＧＵꎬ ｔｒｎＶ￣ＧＡＣ
基因组大小为 １４６ ７５４ ~ １５６ １２０ ｂｐ( Ｋｉｍ ｅｔ ａｌ.ꎬ ( × ２)ꎬ ｔｒｎＶ￣ＵＡＣ ꎬ ｔｒｎＷ￣ＣＣＡꎬ
ｔｒｎＹ￣ＧＵＡ
２０２０)ꎮ 本文首次报道并解析了红门亚兰族中白
蝶兰属 ２ 种的叶绿体基因组的序列特征ꎮ 龙头兰 注: 表示基因含 １ 个内含子ꎻ 表示基因含 ２ 个内含子ꎻ
( ×２)表示有 ２ 个拷贝的基因ꎮ
和景洪白蝶兰的叶绿体基因组结构与大多数被子
Ｎｏｔｅ: ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｓ ｇｅｎｅ ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ ｏｎｅ ｉｎｔｒｏｎꎻ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｓ
植物叶绿体基因组结构相似ꎬ 都为典型的环状四 ｇｅｎｅ ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ ｔｗｏ ｉｎｔｒｏｎｓꎻ ( ×２) ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｇｅｎｅ ｈａｓ ｔｗｏ ｃｏｐｉｅｓ.
