Page 55 - 广西植物2024年1期

１ 期 汪雨等: 两种珍稀白蝶兰属(兰科)叶绿体基因组比较分析 ５ １

表 ３ 龙头兰和景洪白蝶兰叶绿体基因组的点突变、插入缺失和突变率
Ｔａｂｌｅ ３ Ｍｕｔａｔｉｏｎｓꎬ ＩｎＤｅｌｓꎬ ａｎｄ ｍｕｔａｔｉｏｎ ｒａｔｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ Ｐｅｃｔｅｉｌｉｓ ｓｕｓａｎｎａｅ ａｎｄ Ｐ. ｈａｗｋｅｓｉａｎａ

区域 点突变 插入缺失 总长度 每 １００ ｂｐ 点突变 每 １００ ｂｐ 插入缺失
Ｒｅｇｉｏｎ Ｍｕｔａｔｉｏｎｓ ＩｎＤｅｌｓ Ｔｏｔａｌ ｌｅｎｇｔｈ Ｍｕｔａｔｉｏｎｓ ｐｅｒ １００ ｂｐ ＩｎＤｅｌｓ ｐｅｒ １００ ｂｐ
ＣＤＳ ２１０ １１ ７８ ９１５ ０.２６６ １１ ０.０１３ ９４
ＩＧＳ ３８１ １０８ ３７ ８６５ １.００６ ２１ ０.２８５ ２２
Ｉｎｔｒｏｎ １３６ ３８ ２ １８０ ６.２３８ ５３ １.７４３ １２
ＩＲ ４８ ８ ２６ ５７５ ０.１８０ ６２ ０.０３０ １０
ＬＳＣ ５１７ １３１ ８４ ５８６ ０.６１１ ２１ ０.１５４ ８７
ＳＳＣ １４１ １３ １７ １４３ ０.８２２ ４９ ０.０７５ ８３

Ａ. 基因间隔区的核苷酸多样性值ꎻ Ｂ. 编码基因的核苷酸多样性值ꎮ
Ａ. Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｖａｌｕｅｓ ｏｆ ｉｎｔｅｒｇｅｎｉｃ ｓｐａｃｅｒꎻ Ｂ. Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｖａｌｕｅｓ ｏｆ ｃｏｄｉｎｇ ｇｅｎｅｓ.
图 ５ 龙头兰和景洪白蝶兰叶绿体基因组间的核苷酸多样性(Ｐｉ)值比较分析
Ｆｉｇ. ５ Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ (Ｐｉ) ｖａｌｕｅｓ ａｍｏｎｇ
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ｐｅｃｔｅｉｌｉｓ ｓｕｓａｎｎａｅ ａｎｄ Ｐ. ｈａｗｋｅｓｉａｎａ

主线上方或下方的方框表示与边界相邻的基因ꎮ
Ｂｏｘｅｓ ａｂｏｖｅ ｏｒ ｂｅｌｏｗ ｔｈｅ ｍａｉｎ ｌｉｎｅ ｉｎｄｉｃａｔｅ ｇｅｎｅｓ ａｄｊａｃｅｎｔ ｔｏ ｂｏｒｄｅｒｓ.
图 ６ ３ 种白蝶兰属和 ３ 种玉凤花属叶绿体基因组中 ＬＳＣ、ＳＳＣ 和 ＩＲ 区相邻边界的比较
Ｆｉｇ. ６ Ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｂｏｒｄｅｒｓ ｂｅｔｗｅｅｎ ｎｅｉｇｈｂｏｒｉｎｇ ｇｅｎｅｓ ａｎｄ ｊｕｎｃｔｉｏｎｓ ｏｆ ＬＳＣꎬ ＳＳＣ ａｎｄ ＩＲ ｒｅｇｉｏｎｓ
ｉｎ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｉｎ ｔｈｒｅｅ Ｐｅｃｔｅｉｌｉｓ ｓｐｅｃｉｅｓ ａｎｄ ｔｈｒｅｅ Ｈａｂｅｎａｒｉａ ｓｐｅｃｉｅｓ