Page 103 - 《广西植物》2021年第2期

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沈宗芳ᖔ 陆添权ᖔ 张志荣ᖔ 等঎ 槲蕨属叶绿体基因组密码子偏好性分析 ЏȮ૒঎ 广西植物ᖔ԰ԡ԰ϟᖔ࿗ϟྉ԰ɯ᧥԰ᤃᤃͱ԰Ꭾሕ঎
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槲蕨属叶绿体基因组密码子偏好性分析

沈宗芳 ϟᕷሕ ᕷ 陆添权 ᕷ 张志荣 ᕷ 蔡传涛 ᕷ 田জ 波 ϟ᥍
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ྉϟ঎ 中国科学院西双版纳热带植物园 热带植物资源可持续利用重点实验室ᖔ 昆明 ᤃጢԡ԰԰ሕଫ
԰঎ 中国科学院昆明植物研究所 中国西南野生生物种质资源库ᖔ 昆明 ᤃጢԡ԰ԡϟଫ ሕ঎ 中国科学院大学ᖔ 北京 ϟԡϟ࿗ԡऐ ɯ
摘জ 要ᧅ 叶绿体基因组密码子偏好性使用模式往往影响基因表达效率ᖔ为促进药用植物叶绿体基因工程的
发展ᖔ提高槲蕨药用品质ᖔ该研究以川滇槲蕨ܦ栎叶槲蕨和槲蕨三个近缘药用植物为材料ᖔ使用 ऊᆍʛᆍႿۼܦ
ऊВ୩۪ 和 ୩۪୩୩ 等软件分析其叶绿体基因组编码基因密码子使用偏好性ᖔ筛选出三个物种的最优密码子ᤥ 结

果表明᧥川滇槲蕨ܦ栎叶槲蕨和槲蕨叶绿体基因组的有效密码子数ྉጶશऊɯ 范围分别为 ࿗ԡ঎ϟԡ ጲ ᤃϟܦ࿗ԡ঎ሕሕ ጲ ᤃϟ
和 ࿗ԡ঎ϟጢጲ ᤃϟᖔ其密码子偏好性较弱ଫႥʐ၊ጛܦʗᡓᤀ԰԰ܦʗᡓᤀϟ࿗ܦʗᡓᤀ԰ԡܦዞዞ໧ዛܦʗᡓ໧࿗ 和 ʗᡓᤀϟᤃ 编码基因的 ጶશऊ 值差异较大ᖔ
表明近缘物种中ᖔ部分基因的密码子偏好性存在一定差异ଫ三个物种编码基因的 ጶશऊ 频数集中于ͱԡ঎ϟ ጲ ԡ঎ϟ
之间ᖔ说明槲蕨属基因密码子偏好性主要受到突变的影响ᤥ 川滇槲蕨 ϟ԰ 个最优密码子有 ᤃ 个和栎叶槲蕨
相同ᖔ分别是 ВऊВܦዶऊВܦ᥈ऊВܦऊዶዶܦዶዶዶ 和 ᥈ዶВଫ栎叶槲蕨 ϟԡ 个最优密码子有 ԰ 个和槲蕨相同ᖔ分别是
ВВዶ 和 ዶВВᖔ而川滇槲蕨与槲蕨无相同的最优密码子ᤥ 该研究结果可为槲蕨属药用植物基因工程中外源

基因的改良及其表达奠定基础ᤥ
关键词ᧅ 川滇槲蕨ᖔ 栎叶槲蕨ᖔ 槲蕨ᖔ 叶绿体基因组ᖔ 密码子偏好性

中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ሕ঎԰জ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗԰ྉ԰ԡ԰ϟɯԡ԰᥋ԡ԰ᤃᤃ᥋ԡऐ

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收稿日期ᧅ ԰ԡϟँͱϟϟͱԡऐ
基金项目ᧅ 国家战略性热带植物资源收集利用的理论与实践项目ྉ԰ԡϟᎮᣮఋା᥈᥋èԡጢɯ Џ୩ࣼᡱᡱᆍʢᡷᔀʛ ᤦᢃ ऊᆍႿ༁ᔀʢ׹ᑕᡷᔽᆍႿ ᑕႿʛ ዶᡱᡱ᤟ᔽዹᑕᡷᔽᆍႿ ᆍ஦
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作者简介ᧅ 沈宗芳ྉϟँँሕͱɯᖔ硕士研究生ᖔ主要从事药用植物研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽ᤟ɯ༁ၤᔀႿझᆍႿ੫஦ᑕႿ੫݀ ଴ᡷᤦ੫঎ᑕዹ঎ዹႿᤥ
᥍
通信作者ᧅ 田波ᖔ博士ᖔ副研究员ᖔ主要从事资源植物种质资源评价与分子育种研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽ᤟ɯᡷᔽᑕႿᤦᆍ݀ ଴ᡷᤦ੫঎ᑕዹ঎ዹႿᤥ