Page 111 - 《广西植物》2021年第2期

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王艳ᖔ 赵懿琛ᖔ 赵德刚঎ 杜仲基因密码子使用模式分析 ЏȮ૒঎ 广西植物ᖔ ԰ԡ԰ϟᖔ ࿗ϟྉ԰ɯ᧥ ԰Ꭾ࿗ͱ԰ऐ԰঎
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杜仲基因密码子使用模式分析

王জ 艳 ᕷ 赵懿琛 ᕷ 赵德刚 ϟᕷ԰
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ྉϟ঎ 贵州大学 生命科学学院 茶学院ᖔ 山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室ᖔ
贵阳 ጢጢԡԡԡԡଫ ԰঎ 贵州省农业科学研究院ᖔ 贵阳 ጢጢԡԡԡԡ ɯ

摘জ 要ᧅ 为了解杜仲基因密码子使用模式ᖔ该文以杜仲基因组密码子为研究对象ᖔ运用 ऊᆍʛᆍႿۼ 软件对杜仲
的 ሕ԰ԡ 个蛋白编码基因进行同义密码子相对使用频率ྉ኏୩ऊВɯ分析ܦጶશऊ᥋᥈ऊሕ༁ 关联分析编码基因的密码子
ጶશऊ 值ܦ۪኏԰᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 偏倚分析编码基因的密码子碱基使用频率ᖔ并运用 ऊВ୩۪ 软件与 ऊᆍʛᆍႿ В༁ᑕ੫ᔀ ᧕ᑕᡷᑕᤦᑕ༁ᔀ 软
件对杜仲基因密码子的 ᥈ऊ 含量ܦ使用频率与代表性物种烟草ܦ拟南芥ܦ大肠杆菌和酿酒酵母的密码子 ᥈ऊ
含量和使用频率进行比较ᤥ 结果表明᧥杜仲基因密码子的 ኏୩ऊВᢦϟ 的密码子有 ሕԡ 个ᖔ其中 ϟऐ 个以 ᥈ᣰ ऊ 结
尾ܦϟ԰ 个以 ዶᣰ В 结尾ᖔ说明杜仲基因密码子偏好以 ᥈ᣰ ऊ 结尾ᖔ且偏好性较强ଫ有效密码子数ྉጶશऊɯ 范围为
ሕԡጲ ᤃԡᖔ该范围内的密码子距离标准曲线较远ᖔ其 ጶશऊ 值小ᖔ偏好性较强ଫ۪኏԰᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 偏倚分析碱基使用频率
显示ᖔ᥈ᢦऊܦВᢦዶଫ杜仲与代表性物种的 ᥈ऊ 含量分析显示ᖔ杜仲的 ᥈ऊϟ԰ܦ᥈ऊሕ 以及平均 ᥈ऊ 含量均高于代表
性物种ଫ杜仲与代表性物种的密码子使用频率分析显示ᖔ杜仲与烟草ܦ酿酒酵母的密码子偏好较为接近ᖔ杜
仲与拟南芥ܦ大肠杆菌的密码子偏好差距较大ᤥ 杜仲是我国特有的珍贵中药材ᖔ对其进行密码子使用模式
分析ᖔ并研究其密码子偏好规律ᖔ为杜仲植物基因工程中外源基因的改良及表达提供了理论基础ᤥ
关键词ᧅ 杜仲基因ᖔ 密码子ᖔ 偏好性ᖔ 使用模式ᖔ 代表性物种
中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ሕজ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗԰ྉ԰ԡ԰ϟɯԡ԰᥋ԡ԰Ꭾ࿗᥋ԡँ

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收稿日期ᧅ ԰ԡ԰ԡͱԡ԰ͱ԰ጢ
基金项目ᧅ 国家自然科学基金ྉሕϟᤃᤃԡԡᎮᤃɯ ଫ贵州省教育厅青年人才成长项目ྉ黔教科 ᣽ɟ Џ԰ԡϟᤃ૒ϟ԰ᤃɯ ଫ贵州省科技计划项目ྉ黔
科合平台人才 Џ԰ԡϟᎮ૒ጢᎮऐऐᖔ Џ԰ԡϟᎮ૒ጢᎮऐऐ᥋Ꭾ԰ 号ɯ Џ୩ࣼᡱᡱᆍʢᡷᔀʛ ᤦᢃ ᡷၤᔀ શᑕᡷᔽᆍႿᑕ᤟ શᑕᡷࣼʢᑕ᤟ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ èᆍࣼႿʛᑕᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ऊၤᔽႿᑕྉሕϟᤃᤃԡԡᎮᤃɯଫ ɟᆍࣼᡷၤ
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作者简介ᧅ 王艳ྉϟँँᤃͱɯᖔ硕士研究生ᖔ研究方向为生物化学分子生物学ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽ᤟ɯሕԡ࿗ԡϟ࿗࿗ሕᎮ݀ ीी঎ዹᆍቝᤥ
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通信作者ᧅ 赵懿琛ᖔ博士ᖔ副教授ᖔ主要从事药用植物ྉ 杜仲ܦ花椒ܦ黄姜等ɯ 次生产物生物合成及代谢途径调控研究ᖔྉ ጶ᥋ቝᑕᔽ᤟ɯ
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