Page 116 - 《广西植物》2021年第2期

԰ 期 王艳等᧥ 杜仲基因密码子使用模式分析 ԰ Ꭾ ँ
表 ԣই 杜仲与代表性物种 ᤩࣷ 的含量
ఋᑕᤦ᤟ᔀ ԰জ ऊᆍႿᡷᔀႿᡷ༁ ᆍ஦ ᥈ऊ ᔽႿ ጛࣩዞᅳቂቂᔠᐹ ࣩᤀቂᅳᔠʐᓣ໧ ᑕႿʛ ʢᔀᡱʢᔀ༁ᔀႿᡷᑕᡷᔽ׹ᔀ ༁ᡱᔀዹᔽᔀ༁
᥈ऊ 含量 杜仲 拟南芥 烟草 大肠杆菌 酿酒酵母
ऊᆍႿᡷᔀႿᡷᆍ஦᥈ऊ ጛࣩዞᅳቂቂᔠᐹ ࣩᤀቂᅳᔠʐᓣ໧ ዛʗᐹᤇᔠʐᅳᡓ໧ᔠ໧ ᡙ၊ᐹᤀᔠᐹႥᐹ ટᔠዞᅳᡙᔠᐹႥᐹ ᡙᐹᤇᐹዞࣩቂ ጛ໧ዞ၊ᓣʗᔠዞ၊ᔠᐹ ዞᅳᤀᔠ ୒ᐹዞዞ၊ᐹʗᅳቂᡥዞᓣ໧ ዞᓣʗᓣצᔠ໧ᔠᐹᓣ
᥈ऊϟ԰ ྉᠮɯ ጢԡ঎ऐጢ ࿗ጢ঎ᤃँ ࿗ጢ঎ሕ ࿗Ꭾ঎԰԰ ࿗ԡ঎ᤃϟ
᥈ऊሕ ྉᠮɯ ጢሕ঎ᤃϟ ࿗԰঎ሕऐ ሕँ঎ጢሕ ࿗Ꭾ঎࿗ጢ ሕऐ঎ϟ
平均含量 ጢϟ঎Ꭾԡ ࿗࿗঎ጢँ ࿗ሕ঎ሕऐ ࿗Ꭾ঎ሕ ሕँ঎ᎮᎮ
ዶ׹ᔀʢᑕ੫ᔀ ዹᆍႿᡷᔀႿᡷ ྉᠮɯ

表 ᇺই 杜仲与代表性物种的密码子使用频率比较
ఋᑕᤦ᤟ᔀ ሕজ ऊᆍቝᡱᑕʢᔽ༁ᆍႿ༁ ᆍ஦ ዹᆍʛᆍႿ ࣼ༁ᑕ੫ᔀ ஦ʢᔀीࣼᔀႿዹᔽᔀ༁ ᤦᔀᡷऔᔀᔀႿ ጛࣩዞᅳቂቂᔠᐹ ࣩᤀቂᅳᔠʐᓣ໧ ᑕႿʛ ʢᔀᡱʢᔀ༁ᔀႿᡷᑕᡷᔽ׹ᔀ ༁ᡱᔀዹᔽᔀ༁

密码子使用频率 频率比值
ऊᆍʛᆍႿ ࣼ༁ᑕ੫ᔀ ஦ʢᔀीࣼᔀႿዹᢃ ྉᠮɯ ኏ᑕᡷᔽᆍ ᆍ஦ ஦ʢᔀीࣼᔀႿዹᢃ
氨基酸 密码子
ዶቝᔽႿᆍ ᑕዹᔽʛ ऊᆍʛᆍႿ
ጶࣼ શᡷ ዶᡷ ጶዹᆍ ୩ዹ ጶࣼ ᣰશᡷ ጶࣼ ᣰ ዶᡷ ጶࣼ ᣰጶዹᆍ ጶࣼ ᣰ୩ዹ

苯丙氨酸 ۪ၤᔀ ВВВ ँ঎ँ ԰ጢ঎ϟ ԰ϟ঎ऐ ԰࿗঎࿗ ԰ᤃ঎ϟ ԡ঎ሕँ ԡ঎࿗ጢ ԡ঎࿗ԡ ԡ঎ሕᎮ
ВВऊ ԰ԡ঎ँ ϟऐ঎ԡ ԰ԡ঎Ꭾ ϟሕ঎ँ ϟऐ঎࿗ ϟ঎ϟᤃ ϟ঎ԡԡ ϟ঎ጢԡ ϟ঎ϟሕ
亮氨酸 ᓂᔀࣼ ВВዶ ሕ঎ऐ ϟሕ঎࿗ ϟ԰঎Ꭾ ϟᎮ঎࿗ ԰ᤃ঎԰ ԡ঎԰ऐ ԡ঎԰ँ ԡ঎԰ϟ ԡ঎ϟ࿗
ВВ᥈ ሕሕ঎ᤃ ԰԰঎ሕ ԰ԡ঎ँ ϟ԰঎ँ ԰Ꭾ঎԰ ϟ঎ጢԡ ϟ঎ᤃԡ ԰঎ᤃԡ ϟ঎԰ሕ
ऊВВ ࿗঎ँ ԰࿗঎ԡ ԰࿗঎ϟ ϟ࿗঎ጢ ϟ԰঎ሕ ԡ঎԰ԡ ԡ঎԰ԡ ԡ঎ሕሕ ԡ঎ሕँ
ऊВऊ ࿗঎ँ ϟ԰঎ሕ ϟᤃ঎ϟ ँ঎ጢ ጢ঎࿗ ԡ঎ሕँ ԡ঎ሕԡ ԡ঎ጢϟ ԡ঎ँԡ
ऊВዶ ԰঎԰ ँ঎࿗ ँ঎ँ ጢ঎ᤃ ϟሕ঎࿗ ԡ঎԰ሕ ԡ঎԰԰ ԡ঎ሕँ ԡ঎ϟᤃ
ऊВ᥈ ϟሕ঎԰ ϟԡ঎԰ ँ঎ऐ ሕᎮ঎࿗ ϟԡ঎ጢ ϟ঎԰ँ ϟ঎ሕ࿗ ԡ঎ሕጢ ϟ঎԰ऐ
异亮氨酸 ᧧᤟ᔀ ዶВВ ϟԡ঎࿗ ԰Ꭾ঎ऐ ԰ϟ঎ጢ ԰ँ঎ᤃ ሕԡ঎ϟ ԡ঎ሕᎮ ԡ঎࿗ऐ ԡ঎ሕጢ ԡ঎ሕ࿗
ዶВऊ ϟϟ঎ԡ ϟሕ঎ँ ϟऐ঎ጢ ϟँ঎࿗ ϟᎮ঎԰ ԡ঎Ꭾँ ԡ঎ጢँ ԡ঎ጢᤃ ԡ঎ᤃሕ
ዶВዶ ሕ঎ऐ ϟ࿗঎ԡ ϟ԰঎ᤃ ϟሕ঎ሕ ϟᎮ঎ऐ ԡ঎԰Ꭾ ԡ঎ሕԡ ԡ঎԰ऐ ԡ঎԰ϟ
甲硫氨酸 ᥘᔀᡷ ዶВ᥈ ሕऐ঎ጢ ԰ጢ঎ԡ ԰࿗঎ጢ ԰ሕ঎Ꭾ ԰ԡ঎ँ ϟ঎ጢ࿗ ϟ঎ጢᎮ ϟ঎ᤃ԰ ϟ঎ऐ࿗
缬氨酸 ჆ᑕ᤟ ᥈ВВ ᤃ঎ԡ ԰ᤃ঎ऐ ԰Ꭾ঎԰ ԰ϟ঎ᤃ ԰԰঎ϟ ԡ঎԰԰ ԡ঎԰԰ ԡ঎԰Ꭾ ԡ঎԰Ꭾ
᥈Вऊ ࿗঎࿗ ϟϟ঎ϟ ϟ԰঎ऐ ϟሕ঎ϟ ϟϟ঎ऐ ԡ঎ሕँ ԡ঎ሕ࿗ ԡ঎ሕሕ ԡ঎ሕᎮ
᥈Вዶ ԰঎Ꭾ ϟϟ঎࿗ ँ঎ँ ϟሕ঎ϟ ϟϟ঎ऐ ԡ঎԰ሕ ԡ঎԰Ꭾ ԡ঎԰ԡ ԡ঎԰԰
᥈В᥈ ϟऐ঎ϟ ϟᤃ঎Ꭾ ϟᎮ঎࿗ ϟँ঎ँ ϟԡ঎ऐ ϟ঎ԡऐ ϟ঎ԡ࿗ ԡ঎ँԡ ϟ঎ᤃᎮ
丝氨酸 ୩ᔀʢ ВऊВ ԰ጢ঎ऐ ԰ԡ঎ԡ ԰ጢ঎԰ ϟሕ঎ϟ ԰ሕ঎ጢ ϟ঎԰ँ ϟ঎ԡ԰ ϟ঎ँᤃ ϟ঎ԡँ
Вऊऊ ԰ँ঎Ꭾ ϟԡ঎԰ ϟϟ঎԰ ँ঎Ꭾ ϟ࿗঎԰ ԰঎ँϟ ԰঎ᤃጢ ሕ঎ԡᤃ ԰঎ԡँ
Вऊዶ ࿗࿗঎ԡ ϟᎮ঎ᤃ ϟऐ঎ሕ ϟሕ঎ϟ ϟऐ঎Ꭾ ԰঎ጢ ԰঎࿗ԡ ሕ঎ሕጢ ԰঎ሕጢ
Вऊ᥈ ጢሕ঎࿗ ጢ঎ሕ ँ঎ሕ ऐ঎԰ ऐ঎ᤃ ϟԡ঎ԡᎮ ጢ঎Ꭾ࿗ ᤃ঎ጢϟ ᤃ঎԰ԡ
ዶ᥈В Ꭾ঎Ꭾ ϟሕ঎ሕ ϟ࿗঎ԡ ϟሕ঎԰ ϟ࿗঎԰ ԡ঎ጢᎮ ԡ঎ጢጢ ԡ঎ጢऐ ԡ঎ጢ࿗
ዶ᥈ऊ ϟሕ঎Ꭾ ϟԡ঎ԡ ϟϟ঎ሕ ϟ࿗঎ሕ ँ঎ऐ ϟ঎ሕᎮ ϟ঎԰ϟ ԡ঎ँጢ ϟ঎ሕँ
脯氨酸 ۪ʢᆍ ऊऊВ ϟϟ঎ጢ ϟऐ঎Ꭾ ϟऐ঎Ꭾ ँ঎ጢ ϟሕ঎ጢ ԡ঎ᤃϟ ԡ঎ᤃϟ ϟ঎԰ϟ ԡ঎ऐጢ
ऊऊऊ ϟँ঎԰ ᤃ঎ᤃ ጢ঎ሕ ᤃ঎԰ ᤃ঎ऐ ԰঎ँԡ ሕ঎ᤃ԰ ሕ঎ԡँ ԰঎ऐ԰
ऊऊዶ ሕᤃ঎ँ ϟँ঎ऐ ϟᤃ঎ϟ ँ঎ϟ ϟऐ঎ሕ ϟ঎ऐᤃ ԰঎԰ँ ࿗঎ԡጢ ԰঎ԡϟ
ऊऊ᥈ ᤃ԰঎԰ ጢ঎ԡ ऐ঎ᤃ ϟ࿗঎ጢ ጢ঎ሕ ϟ԰঎࿗࿗ Ꭾ঎԰ሕ ࿗঎԰ऐ ϟϟ঎Ꭾሕ
苏氨酸 ఋၤʢ ዶऊВ ϟ԰঎ᤃ ԰ԡ঎ሕ ϟᎮ঎ጢ ϟሕ঎ϟ ԰ԡ঎ሕ ԡ঎ᤃ԰ ԡ঎Ꭾ԰ ԡ঎ँᤃ ԡ঎ᤃ԰
ዶऊऊ ԰ጢ঎ሕ ँ঎Ꭾ ϟԡ঎ሕ ϟऐ঎ँ ϟ԰঎Ꭾ ԰঎ᤃԡ ԰঎࿗ጢ ϟ঎ሕሕ ϟ঎ँँ