Page 115 - 《广西植物》2021年第2期

԰ Ꭾ ऐ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷
较ᖔ如表 ԰ 所示ᤥ 由表 ԰ 可知ᖔ杜仲基因密码子的
平均 ᥈ऊ 含量最高为 ጢϟ঎Ꭾᠮᖔ密码子第三位碱基
᥈ऊ 含量也最高ᖔ为 ጢሕ঎ᤃϟᠮᖔ说明杜仲基因密码子
偏好 ᥈ऊ 结尾ᤥ 其次为大肠杆菌ܦ拟南芥ܦ烟草和
酿酒酵母ᤥ 杜仲与代表性物种的密码子使用频率

以及频率比值结果如表 ሕ 所示ᖔ由表 ሕ 可知ᖔ杜仲
与代表性物种的密码子使用频率比值ᤠ԰ 或፪ԡ঎ጢ
的分别有 ሕϟܦሕ࿗ܦሕ࿗ܦሕ԰ 个ᖔ该值说明两物种间对
该密码子的使用偏差ᤥ 表 ሕ 中杜仲与大肠杆菌和
拟南芥的密码子使用偏好具有明显差异ᖔ而杜仲
与烟草ܦ酿酒酵母的密码子偏好性差别较小ᤥ 若
要为杜仲基因寻找宿主表达系统的话ᖔ可选择烟

草或酿酒酵母较为合适ᤥ
横坐标为 ᥈ऊሕ 值ᖔ纵坐标为 ጶશऊ 值ᤥ
ఋၤᔀ ᑕᤦ༁ዹᔽ༁༁ᑕ ᔽ༁ ᡷၤᔀ ᥈ऊሕ ׹ᑕ᤟ࣼᔀ ᑕႿʛ ᡷၤᔀ ᆍʢʛᔽႿᑕᡷᔀ ᔽ༁ ᡷၤᔀ ጶશऊ
ሕজ 讨论与结论
׹ᑕ᤟ࣼᔀ঎
图 ϟজ ጶશऊ᥋᥈ऊሕ༁ 分析
èᔽ੫঎ ϟজ ጶશऊ᥋᥈ऊሕ༁ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ 氨基酸由三联体密码子编码ᖔ密码子简并性
可使碱基第三位改变的情况下编码正确的氨基
酸ᖔ保证蛋白质合成的准确ᤥ 不同生物的密码子
使用偏好存在差异ᖔ即便同一生物不同基因的密
码子使用偏好也存在差异ྉ 吴宪明等ᖔ԰ԡԡᎮɯᤥ 密
码子使用偏好是生物在进化过程中突变ܦ选择的
综合结果ᖔ研究表明密码子偏好与基因表达水平

相关ᖔ高表达基因倾向使用最优密码子ྉ 赵洋等ᖔ
԰ԡϟϟɯᤥ 密码子偏好性也反应了生物间进化的关
系ᖔ可作为生物进化关系的参考ྉ 陈哲等ᖔ԰ԡϟᎮɯᤥ
密码子使用模式分析可为生物的外源基因插入及
表达提供一定的理论依据ྉ 罗洪等ᖔ԰ԡϟጢɯᤥ 杜仲
是我国特有的珍贵药材ᖔ具有降血压ܦ安胎等功
效ᤥ 但因其为木本植物ܦ生长周期长等原因ᖔ杜仲
横坐标为 ᥈ሕ ᣰ ྉ᥈ሕշऊሕɯᖔ纵坐标为 ዶሕ ᣰ ྉዶሕշఋሕɯᤥ
ఋၤᔀ ᑕᤦ༁ዹᔽ༁༁ᑕ ᔽ༁ ᥈ሕᣰ ྉ᥈ሕշऊሕɯ ᑕႿʛ ᡷၤᔀ ᆍʢʛᔽႿᑕᡷᔀ ᔽ༁ ዶሕᣰ ྉዶሕշఋሕɯ঎ 遗传转化不易进行且转基因杜仲移栽至土里存活
图 ԰জ ۪኏԰᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 偏倚图分析 率不高ᤥ 因此ᖔ探究杜仲基因的密码子使用模式
èᔽ੫঎ ԰জ ۪኏԰᥋ᡱ᤟ᆍᡷ ᤦᔽᑕ༁ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ 可为杜仲的遗传转化提供更多可能性ᤥ
本研究以杜仲基因组为对象ᖔ分析杜仲基因
若密码子偏好性完全受突变的影响ᖔ则碱基 ዶܦВܦ 密码子使用模式ᤥ 结果表明杜仲基因密码子
ऊܦ᥈ 的使用频率相当ᖔ因此ᖔ说明杜仲基因密码子 ኏୩ऊВᢦϟ 的有 ሕԡ 个ᖔ其中 ϟऐ 个密码子以 ᥈ᣰ ऊ 结
受到突变和选择的影响ᤥ 尾ܦϟ԰ 个密码子以 ዶᣰ В 结尾ᖔ说明杜仲基因密码
ԣॹ྽ 杜仲与代表性物种的 ᤩࣷ 含量及密码子使用 子偏好以 ᥈ᣰ ऊ 结尾ᖔ这种偏好可能是由于以 ᥈ᣰ ऊ
频率比较 结尾的密码子具有较高的结合能ᖔ有利于保证翻
将杜仲与 ࿗ 种代表性物种的 ᥈ऊ 含量进行比 译的准确性 ྉ蒋玮等ᖔ԰ԡϟ࿗ɯᤥ ጶશऊ 值大小可量化