Page 163 - 《广西植物》2021年第9期
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付春ᖔ 黄春莉ᖔ 江纳ᖔ 等 中华猕猴桃 ۩᧣ᣏ 转录因子的生物信息学分析 ЏȮ 广西植物ᖔ ԡϟᖔ ࿗ϟྉँɯ᧥ ϟጢᤃϟͱϟጢᎮጢ
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中华猕猴桃 ۩᧣ᣏ 转录因子的生物信息学分析
付জ 春 ϟᕷ᥍ ᕷ 黄春莉 ϟᕷ ᕷ 江জ 纳 ᕷ 杨瑶君 ϟᕷ
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ྉϟ 竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室ᖔ 乐山师范学院ᖔ 四川 乐山 ᤃϟ࿗ԡԡԡଫ 乐山师范学院 生命科学学院ᖔ
四川 乐山 ᤃϟ࿗ԡԡԡଫ ሕ 乐山师范学院 数学与信息科学学院ᖔ 四川 乐山 ᤃϟ࿗ԡԡԡ ɯ
摘জ 要ᧅ ۩᧣ᣏ 基因家族是植物特有的一类转录因子ᖔ在植物发育关键时期ᖔ如胚的形成ܦ维持干细胞稳定性
和器官形成过程中发挥重要调控作用ᤥ 为探究 ۩᧣ᣏ 转录因子调控中华猕猴桃的生长发育的分子理论基
础ᖔ该文利用 ۪ʢᆍᡷ۪ᑕʢᑕቝܦऊᔀ᥋۪ᓂᆍዹԡܦ୩ᔽ੫Ⴟᑕ۪࿗ϟ ୩ᔀʢᔀʢ 等在线软件对中华猕猴桃的 ϟᤃ 个 ۩᧣ᣏ 转录因子进
行理化特性ܦ亚细胞定位和信号肽等详细的生物信息学分析ᤥ 结果表明᧥ྉϟɯ中华猕猴 ۩᧣ᣏ 转录因子的所
有蛋白成员的氨基酸数目在 ϟሕऐጲ ሕᎮϟ 之间ᖔ分子量为 ϟᤃጲ ࿗ϟऐጢ Ҵ᧕ᖔ均定位于细胞核的不稳定亲水蛋
白ᤥྉɯ中华猕猴桃的 ϟᤃ 个 ۼᨃᣮ 蛋白成员均属于 ̀ᆍቝᆍʛᆍቝᑕᔽႿ 超家族ᖔ仅 ዶዹၤႿሕᤃ࿗ጢϟ 是分泌蛋白ᖔ且仅
ዶዹၤႿሕᤃ࿗ጢϟ 和 ዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟ 具有跨膜区ᤥྉሕɯ 大部分 ۼᨃᣮ 蛋白成员的潜在磷酸化位点都位于丝氨酸处ᤥ
ྉ࿗ɯ其二级结构主要以无规则卷曲为主ᖔ其次为 ም᥋螺旋ᤥྉጢɯ 保守基序分析结果表明中华猕猴桃的 ϟᤃ 个
ۼᨃᣮ 蛋白成员均含有 ቝᆍᡷᔽϟᤥ ྉᤃɯ系统进化分析结果表明中华猕猴桃与菠萝的亲缘关系最近ᖔ与番茄的亲
缘关系最远ᤥྉᎮɯ在中华猕猴桃果实成熟过程中不同时期的转录组分析结果表明其 ۩᧣ᣏ 基因家族中 ࿗ 个
成员 ዛዞ၊Ⴅϟሕϟᤃऐϟܦዛዞ၊Ⴅϟ࿗ጢጢᤃϟܦዛዞ၊Ⴅሕሕᤃጢँϟܦዛዞ၊Ⴅሕᤃ࿗ጢϟ 基因在授粉后 ԡܦϟԡܦϟᎮ ʛ 表达含量都较高ᖔ其他
ϟ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员表达含量低甚至不表达ᤥ 该研究为进一步研究中华猕猴桃 ۩᧣ᣏ 转录因子在其生长发
育过程中的分子机理提供了一定的参考依据ᤥ
关键词ᧅ 中华猕猴桃ᖔ ۩᧣ᣏᖔ 转录因子ᖔ 基因家族ᖔ 生物信息学分析
中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ሕজ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗ྉԡϟɯԡँ᥋ϟጢᤃϟ᥋ϟጢ
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收稿日期ᧅ ԡԡͱԡጢͱԡ
基金项目ᧅ 国家自然科学基金ྉሕϟ࿗Ꭾԡᤃጢጢɯଫ 四川省科技厅项目ྉϟᎮԻԻԡϟँɯଫ 乐山市科技局重点研究项目ྉϟऐȮԻ᧕ϟԡϟɯଫ 乐山师范学院
人才启动项目ྉᣮȮϟᎮԡԡጢɯଫ 乐山师范学院重点研究项目ྉᓂԻ᧕ԡϟԡɯଫ 乐山师范学院横向项目ྉᓂ̀ᣮϟँԡᎮऐᤃɯ Џ୩ࣼᡱᡱᆍʢᡷᔀʛ ᤦᢃ ᡷၤᔀ શᑕᡷᔽᆍႿᑕ
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作者简介ᧅ 付春ྉϟँऐ࿗ͱɯᖔ博士ᖔ讲师ᖔ主要从事经济植物的生物信息学研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯࣼዹၤࣼႿ࿗ϟ݀ ᑕᔽᢃࣼႿዹᆍቝᤥ
通信作者
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