Page 165 - 《广西植物》2021年第9期

ँ 期 付春等᧥ 中华猕猴桃 ۩᧣ᣏ 转录因子的生物信息学分析 ϟ ጢ ᤃ ሕ
基因家族鉴定并发现有 ϟԡ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员ᖔ同 染色体 上 ྉ ۼᑕႿ੫ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟँɯᤥ 在人参 ྉ ۗᐹႥᐹଝ
时分析其 ۼᨃᣮ 蛋白结构域和基因结构及系统进 ੖ᔠႥ໧ᓣႥ੖ɯ基因组中鉴定出 ϟԡ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员ྉᓂᔽࣼ
化关系 ྉ 李晓旭等ᖔ԰ԡϟᤃɯᤥ 蝴蝶兰 ྉ ۗ၊ᐹᤀᐹᓣႥᅳᡓ໧ᔠ໧ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟँɯᤥ 虽然关于植物基因组中 ۩᧣ᣏ 基因家
ᐹᡓ၊ʗᅳʐᔠᡙᓣɯ和石斛兰ྉᦵᓣႥʐʗᅳᤇᔠࣩቂ ዞᐹᡙᓣႥᐹᡙࣩቂɯ 基因组 族的鉴定ܦ功能分析的研究较多ᖔ但对于中华猕猴
中分别含有 ϟ࿗ 个和 ϟԡ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员ᖔ其中ᖔ蝴 桃基因组中 ۩᧣ᣏ 基因家族的鉴定及其分子功能研
蝶兰有 ሕ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员出现基因重复ᖔ而在石 究的文献报道较少ᤥ
斛兰基因组中没有出现 ۩᧣ᣏ 基因重复ྉ኏ᑕቝҴࣼቝᑕʢ 关于中华猕猴桃基因组中转录因子的研究报
ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ԰ԡϟऐɯᤥ 茶树ྉ ࣷᐹቂᓣᤀᤀᔠᐹ ໧ᔠႥᓣႥ໧ᔠ໧ɯ 基因组中有 道有 ቴϟቴ԰ቴሕ᤬᤹ɔଧ 转录因子增强其干旱胁迫反应
ϟऐ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员ᖔ且其系统进化树分为 ሕ 组ᖔ ྉɟᑕ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟँɯᖔጛᧇટሕ ᣑጛᧇᒦ 转录因子的鉴定ᖔ系统
分别是古老分支ܦ中间分支和现代分支三类ྉۼᑕႿ੫ 进化及其基因表达分析ྉ陈强等ᖔ԰ԡϟऐɯᖔ᤹ዛᦵ୒᤬ᤇᅳଝ
ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟँɯᤥ 在甘蓝型油菜ܦ白菜和甘蓝基因组 转录因子与中华猕猴桃乙烯促成熟相关ྉᥘዹᑕᡷᔀᔀ ᔀᡷ
序列中分别鉴定出 ጢ԰ܦ԰ጢܦ԰ँ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员ྉᓂᔽ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟጢɯᖔ还有 ᤦԻ᧧۪ 家族的相关报道ྉ于丰源等ᖔ
ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟँɯᤥ 大豆ྉ ᤩᤀᡥዞᔠႥᓣ ቂᐹଝɯ 基因组中含有 ԰ԡ԰ԡɯᖔ但未见中华猕猴桃基因组中 ۩᧣ᣏ 转录因子
ሕሕ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员ᖔ并定位在 ϟँ 条染色体上ᖔ而 鉴定和生物信息学研究的报道ᤥ 为研究中华猕猴
ϟᤃ 号染色体没有 ۩᧣ᣏ 基因ྉ ̀ᑕᆍ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟँɯᤥ 桃 ۩᧣ᣏ 基因家族编码蛋白质的分子功能及其在生
对毛 白 杨 ྉ ۗᅳᡓࣩᤀࣩ໧ ᡙᅳቂᓣႥᡙᅳ໧ᐹ ɯ 的 ۗᡙᅳ۩І୒ᐹܦ 长发育过程中的作用如何和非生物胁迫条件下的
ۗᡙᅳ۩᧣ᣏ࿗ᐹ 和 ۗᡙᅳ۩᧣ᣏጢᐹ 三个基因编码蛋白质的结 应激反应如何ᤥ 本研究拟对中华猕猴桃 ϟᤃ 个 ۩᧣ᣏ
构域和在不同组织中的表达进行了详细分析ྉ 李 基因成员进行理化特性ܦ亚细胞定位ܦ蛋白高级结
建波ᖔ԰ԡϟᎮଫ王爽等ᖔ԰ԡϟँɯᤥ 在玉米ྉ Ԯᓣᐹ ቂᐹᡥ໧ɯ 基 构及系统进化等详细的生物信息学分析ᖔ为后续进
因组中鉴定出 ሕϟ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员ᖔ且分析了其 一步研究中华猕猴桃的生长发育和分子功能等提

编码蛋白的理化特性和系统进化关系ྉ 郑玲等ᖔ 供一定的参考依据和理论基础ᤥ
԰ԡϟँɯᤥ 毛竹 ྉ ۗ၊ᡥᤀᤀᅳ໧ᡙᐹዞ၊ᡥ໧ ၊ᓣᡙᓣʗᅳዞᡥዞᤀᐹɯ 基因组中
有 ԰Ꭾ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员ྉ李晨曦等ᖔ԰ԡϟᤃɯᖔ而在其 ϟজ 材料与方法

他竹类植物基因组中ᖔ俄莉竹ྉ᧣ᤀᡥʗᐹ ᤀᐹᡙᔠஏᅳᤀᔠᐹɯ有 ϟ԰
个 ۩᧣ᣏ 基因成员ᖔ ቴᐹʐʐᔠᐹ ੖ࣩᔠᐹႥᓣႥ໧ᔠ໧ 含有 ँ 个 ϓॹϓ 材料
۩᧣ᣏ 基因成员ᖔ瓜多竹ྉ ᤩࣩᐹʐࣩᐹ ᐹႥ੖ࣩ໧ᡙᔠஏᅳᤀᔠᐹɯ 含有 中华猕猴桃的 ϟᤃ 个 ۩᧣ᣏ 转录因子的蛋白序列
ϟऐ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员以及芸香竹 ྉ ଧᅳႥᔠᐹ 来自 于 ۪᤟ᑕႿᡷఋè᧕ା ྉ ၤᡷᡷᡱ᧥ᣰ ᣰ ᡱ᤟ᑕႿᡷᡷ஦ʛᤦ঎ ዹᤦᔽ঎ ᡱҴࣼ঎ ᔀʛࣼ঎
ᐹቂᡓᤀᓣଝᔠዞᐹࣩᤀᔠ໧ɯ含有 ԰ᤃ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员ྉᓂᔽ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ዹႿ ᣰ ɯ数据库ᖔ并通过该数据库下载与中华猕猴桃
԰ԡ԰ԡɯᤥ 在葡萄ྉ Ⴌᔠᡙᔠ໧ צᔠႥᔠஏᓣʗᐹɯ 基因组中鉴定出 ϟԡ ۩᧣ᣏ 转录因子成员 ዶዹၤႿϟᎮ԰ሕऐϟ 同源的番茄ܦ矮牵
个 ۩᧣ᣏ 基因成员ᖔ且其与拟南芥的进化树分为祖先 牛花ྉۗᓣᡙࣩႥᔠᐹ ᔠႥஏᤀᐹᡙᐹɯܦ辣椒ྉࣷᐹᡓ໧ᔠዞࣩቂ ᐹႥႥࣩࣩቂɯܦ拟
分支ܦ中间分支和现代分支三类ྉ王鹏飞等ᖔ԰ԡϟऐɯᤥ 南芥ܦ 油菜 ྉ ଧʗᐹ໧໧ᔠዞᐹ Ⴅᐹᡓࣩ໧ɯܦ 葡萄ܦ 菠菜 ྉ ୒ᡓᔠႥᐹዞᔠᐹ
小麦ྉ௴ʗᔠᡙᔠዞࣩቂ ᐹᓣ໧ᡙᔠצࣩቂɯ基因组中含有 ऐԡ 个 ۩᧣ᣏ 基 ᅳᤀᓣʗᐹዞᓣᐹɯܦ大豆ܦ菠萝ྉዛႥᐹႥᐹ໧ ዞᅳቂᅳ໧ࣩ໧ɯܦ小麦ܦ毛竹ܦ
因成员ᖔ其中定位在 ዶܦାܦ᧕ 基因组上的分别有 ԰ሕܦ 玉米ܦ水稻ྉ᧣ʗᡥऊᐹ ʗࣩஏᔠᡓᅳ੖ᅳႥɯܦ花生ྉዛʗᐹዞ၊ᔠ໧ ၊ᡥᡓᅳ੖ᐹᓣᐹɯܦ
԰ᤃܦ԰ँ 个ᖔ另有 ԰ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员定位不明确ྉ李 马铃薯ྉ୒ᅳᤀᐹႥࣩቂ ᡙࣩᤇᓣʗᅳ໧ࣩቂɯ的 ۩᧣ᣏ 转录因子成员的
仲卿ᖔ԰ԡϟऐɯᤥ 苹果ྉ᤹ᐹᤀࣩ໧ ᡓࣩቂᔠᤀᐹɯ基因组中含有 ϟ԰ 蛋白序列用于不同物种间 ۩᧣ᣏ 转录因子的系统进
个 ۩᧣ᣏ 基因成员ᖔ且在果实中的表达含量较高ྉ王 化关系分析研究ᤥ
楚堃等ᖔ԰ԡ԰ԡɯᤥ 小桐子ྉȣᐹᡙʗᅳᡓ၊ᐹ ዞࣩʗዞᐹ໧ɯ 基因组中 ϓॹԣ 方法
有 ϟ԰ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员ᖔ且在不同组织中的表达呈 ϟ঎԰঎ϟ 理 化 性质分析 জ 利用在线程序 ۪ʢᆍᡷ۪ᑕʢᑕቝ
显著性差异 ྉ 唐跃辉等ᖔ԰ԡϟँɯᤥ 棉花 ྉ ᤩᅳ໧໧ᡥᡓᔠࣩቂ ྉၤᡷᡷᡱ༁᧥ ᣰ ᣰ औᔀᤦ঎ ᔀ଴ᡱᑕ༁ᢃ঎ ᆍʢ੫ ᣰ ᡱʢᆍᡷᡱᑕʢᑕቝ ᣰ ɯ 对中华猕猴
၊ᔠʗ໧ࣩᡙࣩቂɯ基因组中有 ሕᎮ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员ᖔ其中ᖔ԰ᤃ 桃的 ۩᧣ᣏ 基因进行理化性质分析ᖔ包括分子量ܦ
个 ۩᧣ᣏ 基因在棉花根ܦ茎ܦ叶ܦ花等器官中都有表达 氨基酸数ܦ等电点ܦ带负电荷残基数ܦ带正电荷残
ྉ吕有军等ᖔ԰ԡϟᎮɯᤥ 簸箕柳ྉ୒ᐹᤀᔠଝ ໧ࣩዞ၊ᅳँᓣႥ໧ᔠ໧ɯ 基因 基数ܦ不稳定指数ܦ脂肪指数ᖔ以及亲疏水性的预
组中被鉴定出 ϟጢ 个 ۩᧣ᣏ 基因成员ᖔ且定位在 ԰ԡ 条 测分 析ᤥ 并利用数据库 ۪᤟ᑕႿᡷఋè᧕ା ྉ ၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ