Page 169 - 《广西植物》2021年第9期
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ँ 期                     付春等᧥ 中华猕猴桃 ۩᧣ᣏ 转录因子的生物信息学分析                                       ϟ ጢ ᤃ Ꭾ

                                                  表 ԣই 氨基酸亲疏水性
                                      ఋᑕᤦ᤟ᔀ ԰জ ዶቝᔽႿᆍ ᑕዹᔽʛ ၤᢃʛʢᆍᡱၤᔽ᤟ᔽዹᔽᡷᢃ ᑕႿʛ ၤᢃʛʢᆍᡱၤᆍᤦᔽዹᔽᡷᢃ

                           亲水性 ̀ᢃʛʢᆍᡱၤᔽ᤟ᔽዹᔽᡷᢃྉ ͱɯ                          疏水性 ̀ᢃʛʢᆍᡱၤᆍᤦᔽዹᔽᡷᢃྉ շɯ
                                                                                              亲水性平均系数
                                最大亲水值                           最大疏水值
                 蛋白名称                             位置                               位置          ᥈ʢᑕႿʛ ᑕ׹ᔀʢᑕ੫ᔀ ᆍ஦
                             ᥘᑕ଴ᔽቝࣼቝ ၤᢃʛʢᆍᡱၤᔽ᤟ᔽዹ             ᥘᑕ଴ᔽቝࣼቝ ၤᢃʛʢᆍᡱၤᆍᤦᔽዹ
                ۪ʢᆍᡷᔀᔽႿ Ⴟᑕቝᔀ                     ۪ᆍ༁ᔽᡷᔽᆍႿ                         ۪ᆍ༁ᔽᡷᔽᆍႿ     ၤᢃʛʢᆍᡱᑕᡷၤᔽዹᔽᡷᢃ
                                  ׹ᑕ᤟ࣼᔀ                            ׹ᑕ᤟ࣼᔀ
                                                                                                ྉ᥈኏ዶ჆ɟɯ
                ዶዹၤႿϟᎮ԰ሕऐϟ        ͱሕ঎԰԰԰           ᤃᎮ             ϟ঎Ꭾ԰԰           ϟऐँ             ͱԡ঎Ꭾᤃँ
                ዶዹၤႿϟሕϟᤃऐϟ        ͱሕ঎ँ԰԰           ϟ࿗ϟ            ϟ঎ሕᎮऐ           ϟጢϟ             ͱԡ঎ऐँँ
                ዶዹၤႿ԰ँँᤃᤃϟ        ͱሕ঎ऐጢᤃ           ϟ࿗ऐ            ϟ঎ሕᎮऐ          ϟᤃँᖔϟᎮϟ          ͱԡ঎ऐԡϟ
                ዶዹၤႿሕሕᤃጢँϟ        ͱሕ঎ँ԰԰           ϟ࿗ϟ            ϟ঎԰ϟϟ            ԰ᤃ             ͱԡ঎ऐጢ࿗
                ዶዹၤႿ԰ऐጢᎮऐϟ        ͱሕ঎Ꭾ࿗࿗           ऐԡ             ϟ঎࿗ጢᤃ            ऐँ             ͱԡ঎ᤃϟጢ
                ዶዹၤႿ԰ԡᎮ࿗ጢϟ        ͱሕ঎ሕᎮऐ           ँጢ             ϟ঎ጢሕሕ           ϟጢԡ             ͱԡ঎ऐԡጢ
                ዶዹၤႿԡጢሕ԰ँϟ         ͱሕ঎ጢ      ऐᖔँᖔϟԡᖔϟϟᖔϟ԰ᖔϟሕᖔϟ࿗   ϟ঎ጢሕሕ           ϟጢ԰             ͱԡ঎ँጢ࿗
                ዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ԡϟ        ͱ࿗঎ϟ࿗࿗           ϟ࿗ँ            ϟ঎ᤃጢᤃ            ᤃ࿗             ͱԡ঎ऐᎮጢ
                ዶዹၤႿϟᎮ԰ጢᎮϟ        ͱሕ঎ऐጢᤃ           ऐԡ             ϟ঎ϟጢᤃ           ँϟᖔँሕ           ͱԡ঎ऐϟᎮ
                ዶዹၤႿ԰԰ԡϟጢϟ        ͱሕ঎࿗ሕሕ           ϟϟጢ            ԰঎ϟ࿗࿗           ԰ϟ԰             ͱԡ঎࿗ऐ԰
                ዶዹၤႿሕᤃ԰ሕ࿗ϟ        ͱሕ঎ጢᤃᎮ         ऐ࿗ᖔऐጢᖔऐᤃ         ϟ঎Ꭾऐँ           ࿗ԡᖔ࿗ϟ           ͱԡ঎ጢԡሕ
                ዶዹၤႿϟԡ࿗ጢሕϟ        ͱሕ঎ጢᤃᎮ         ऐ࿗ᖔऐጢᖔऐᤃ          ԰঎ጢ            ԰ጢԡ             ͱԡ঎࿗ԡ԰
                ዶዹၤႿሕᤃ԰࿗ጢϟ        ͱሕ঎ጢ࿗࿗        ऐᖔँᖔϟԡᖔϟϟ         ԰঎ँሕሕ           ԰ጢጢ             ͱԡ঎ᎮᎮᤃ
                ዶዹၤႿϟ࿗ጢጢᤃϟ        ͱሕ঎ጢ࿗࿗       ऐᖔँᖔϟԡᖔϟϟᖔϟ԰       ԰঎ጢጢᤃ           ԰ጢऐ             ͱԡ঎ᤃँ࿗
                ዶዹၤႿϟԡᎮᎮᎮϟ        ͱሕ঎ϟऐँ           ࿗ऐ             ϟ঎ᤃϟϟ           ϟሕԡ             ͱԡ঎ᤃ԰ሕ
                ዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟ        ͱሕ঎ጢϟϟ           Ꭾሕ             ሕ঎ሕሕሕ            ϟᤃ             ͱԡ঎ጢᎮऐ

                       表 ᇺই 保守结构域数量统计                          ዶዹၤႿϟᎮ԰ሕऐϟܦ ዶዹၤႿϟሕϟᤃऐϟܦ ዶዹၤႿ԰ँँᤃᤃϟܦ ዶዹၤႿሕሕᤃጢँϟܦ
             ఋᑕᤦ᤟ᔀ ሕজ ୩ᡷᑕᡷᔽ༁ᡷᔽዹ༁ ᆍ஦ ᡷၤᔀ Ⴟࣼቝᤦᔀʢ ᆍ஦ ዹᆍႿ༁ᔀʢ׹ᔀʛ ʛᆍቝᑕᔽႿ  ዶዹၤႿ԰ऐጢᎮऐϟ 等 ϟ԰ 个成员的二级结构含量为无规则
                                                               卷曲 ᢦም᥋螺旋 ᢦ 延伸链 ᢦᏇ᥋转角ଫ ዶዹၤႿ԰԰ԡϟጢϟܦ
                             保守结构域个数
                蛋白名称                             间距
                             ऊᆍႿ༁ᔀʢ׹ᔀʛ ʛᆍቝᑕᔽႿ                  ዶዹၤႿ԰԰ԡϟጢϟ 和 ዶዹၤႿϟԡ࿗ጢሕϟ 三个成员的二级结构
               ۪ʢᆍᡷᔀᔽႿ Ⴟᑕቝᔀ                      ᧧Ⴟᡷᔀʢ׹ᑕ᤟
                                 Ⴟࣼቝᤦᔀʢ
                                                               含量 为无规则卷曲 ᢦ 延伸链 ᢦም᥋螺旋 ᢦᏇ᥋转角ଫ
               ዶዹၤႿϟᎮ԰ሕऐϟ          ϟ
                                                               ዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟ 的二级结构含量为无规则卷曲 ᢉ ም᥋螺
                                                  ͱ͐ ᤃᤃ
                                                 ୩ Ꭾ
               ዶዹၤႿϟሕϟᤃऐϟ          ϟ            ఋ ऐϟ  ͱ͐ ϟ࿗ԡ
                                                               旋ᢦ 延伸 链 ᢦᏇ᥋转角ᤥም᥋螺旋在成员中占比为
               ዶዹၤႿ԰ँँᤃᤃϟ          ϟ            ఋ ऐऐ  ͱ͐ ϟ࿗Ꭾ
                                                               ϟ԰঎ᎮँᠮྉዶዹၤႿሕᤃ԰ሕ࿗ϟɯ ጲ ࿗԰঎ԡԡᠮྉዶዹၤႿሕᤃ԰࿗ጢϟɯଫ延
               ዶዹၤႿሕሕᤃጢँϟ          ϟ            ఋ ऐϟ  ͱ኏ ϟ࿗࿗
               ዶዹၤႿ԰ऐጢᎮऐϟ          ϟ            ୩ ԰ԡ  ͱ኏ Ꭾᤃ    伸链在成员中占比为࿗঎ԡԡᠮྉዶዹၤႿሕᤃ԰࿗ጢϟɯ ጲ ԰ϟ঎ϟऐᠮ
               ዶዹၤႿ԰ԡᎮ࿗ጢϟ          ϟ            ఋ ሕᤃ  ͱ͐ ँᤃ    ྉዶዹၤႿϟԡ࿗ጢሕϟɯଫ Ꮗ᥋转角在成员中占比 为 ԰঎ ሕऐᠮ
               ዶዹၤႿԡጢሕ԰ँϟ          ϟ            ఋ ሕᤃ  ͱ͐ ँᤃ
                                                               ྉዶዹၤႿϟᎮ԰ሕऐϟɯ ጲ ँ঎࿗ँᠮྉዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟɯଫ无规则卷曲
               ዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ԡϟ          ϟ            ୩ ऐँ  ͱ͐ ϟ࿗ऐ
                                                               在成员中占比为 ᤃँ঎ ሕऐᠮ ྉ ዶዹၤႿሕᤃ԰ሕ࿗ϟɯ ጲ ሕᎮ঎ ሕ࿗ᠮ
               ዶዹၤႿϟᎮ԰ጢᎮϟ          ϟ            ୩ ԰ԡ  ͱዶ Ꭾጢ
               ዶዹၤႿ԰԰ԡϟጢϟ          ϟ            ۪ ጢጢ  ͱ͐ ϟϟᤃ   ྉዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟɯྉ表 ጢᖔ图 Ꭾɯᤥ
                                                                   通过在线工具 ୩ۼ᧧୩୩᥋ᥘᨃ᧕ጶᓂ 对中华猕猴桃
               ዶዹၤႿሕᤃ԰ሕ࿗ϟ          ϟ            ୩ ԰ऐ  ͱશ ऐԡ
                                                               ۩᧣ᣏ 转录因子进行蛋白质的三级结构预测ᖔ结果显
               ዶዹၤႿϟԡ࿗ጢሕϟ          ϟ
                                                ୩ ԰ऐ
                                                  ͱશ ऐԡ
               ዶዹၤႿሕᤃ԰࿗ጢϟ          ϟ            ኏ ँऐ  ͱ኏ ϟጢᤃ
                                                               示ᖔϟᤃ 个 ۼᨃᣮ 蛋白成员的蛋白质三级结构可分为
               ዶዹၤႿϟ࿗ጢጢᤃϟ          ԰         ኏ ँँ  ͱ኏ ϟጢᎮ ᖔ ୩ ԰ጢሕͱ ᣽ ሕϟᤃ
                                                               ϟϟ 类ᤥ ዶዹၤႿϟᎮ԰ሕऐϟ 与 ዶዹၤႿ԰԰ԡϟጢϟ 为一类ᖔ其代表
               ዶዹၤႿϟԡᎮᎮᎮϟ          ϟ            ᥘ ϟ  ͱ͐ ጢϟ
                                                               为 ዶዹၤႿ԰԰ԡϟጢϟଫ ዶዹၤႿϟሕϟᤃऐϟ 与 ዶዹၤႿሕሕᤃጢँϟ 为一
               ዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟ          ϟ            ኏ ሕጢ  ͱ͐ Ꭾሕ
                                                               类ᖔ其代表为 ዶዹၤႿϟሕϟᤃऐϟଫዶዹၤႿ԰ԡᎮ࿗ጢϟܦዶዹၤႿԡጢሕ԰ँϟܦ
            ԣॹ྽ 二级结构和三级结构的预测分析                                 ዶዹၤႿϟᎮ԰ጢᎮϟ 为一类ᖔ 其代表为 ዶዹၤႿԡጢሕ԰ँϟଫ
                 使用 ୩ᨃ۪ᥘዶ 程序对中华猕猴桃 ۩᧣ᣏ 转录因                     ዶዹၤႿሕᤃ԰ሕ࿗ϟ 与 ዶዹၤႿϟԡ࿗ጢሕϟ 为一类ᖔ 其代表为
            子的二级结构进行预测分析ᤥ 结果显示ᖔ大部分                             ዶዹၤႿሕᤃ԰ሕ࿗ϟଫ ዶዹၤႿ԰ँँᤃᤃϟܦ ዶዹၤႿ԰ऐጢᎮऐϟܦ ዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ԡϟܦ
            ۼᨃᣮ 蛋白成员的二级结构都以无规则卷曲为主ᖔ                            ዶዹၤႿሕᤃ԰࿗ጢϟܦዶዹၤႿϟ࿗ጢጢᤃϟܦዶዹၤႿϟԡᎮᎮᎮϟܦዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟ 各
            其次为 ም᥋螺旋和延伸链ᖔᏇ᥋转角含量最少ᤥ 其中ᖔ                         代表一类ྉ图 ऐɯᤥ
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