Page 169 - 《广西植物》2021年第9期
P. 169
ँ 期 付春等᧥ 中华猕猴桃 ۩᧣ᣏ 转录因子的生物信息学分析 ϟ ጢ ᤃ Ꭾ
表 ԣই 氨基酸亲疏水性
ఋᑕᤦᔀ জ ዶቝᔽႿᆍ ᑕዹᔽʛ ၤᢃʛʢᆍᡱၤᔽᔽዹᔽᡷᢃ ᑕႿʛ ၤᢃʛʢᆍᡱၤᆍᤦᔽዹᔽᡷᢃ
亲水性 ̀ᢃʛʢᆍᡱၤᔽᔽዹᔽᡷᢃྉ ͱɯ 疏水性 ̀ᢃʛʢᆍᡱၤᆍᤦᔽዹᔽᡷᢃྉ շɯ
亲水性平均系数
最大亲水值 最大疏水值
蛋白名称 位置 位置 ᥈ʢᑕႿʛ ᑕᔀʢᑕ੫ᔀ ᆍ
ᥘᑕᔽቝࣼቝ ၤᢃʛʢᆍᡱၤᔽᔽዹ ᥘᑕᔽቝࣼቝ ၤᢃʛʢᆍᡱၤᆍᤦᔽዹ
۪ʢᆍᡷᔀᔽႿ Ⴟᑕቝᔀ ۪ᆍ༁ᔽᡷᔽᆍႿ ۪ᆍ༁ᔽᡷᔽᆍႿ ၤᢃʛʢᆍᡱᑕᡷၤᔽዹᔽᡷᢃ
ᑕࣼᔀ ᑕࣼᔀ
ྉ᥈ዶɟɯ
ዶዹၤႿϟᎮሕऐϟ ͱሕ ᤃᎮ ϟᎮ ϟऐँ ͱԡᎮᤃँ
ዶዹၤႿϟሕϟᤃऐϟ ͱሕँ ϟ࿗ϟ ϟሕᎮऐ ϟጢϟ ͱԡऐँँ
ዶዹၤႿँँᤃᤃϟ ͱሕऐጢᤃ ϟ࿗ऐ ϟሕᎮऐ ϟᤃँᖔϟᎮϟ ͱԡऐԡϟ
ዶዹၤႿሕሕᤃጢँϟ ͱሕँ ϟ࿗ϟ ϟϟϟ ᤃ ͱԡऐጢ࿗
ዶዹၤႿऐጢᎮऐϟ ͱሕᎮ࿗࿗ ऐԡ ϟ࿗ጢᤃ ऐँ ͱԡᤃϟጢ
ዶዹၤႿԡᎮ࿗ጢϟ ͱሕሕᎮऐ ँጢ ϟጢሕሕ ϟጢԡ ͱԡऐԡጢ
ዶዹၤႿԡጢሕँϟ ͱሕጢ ऐᖔँᖔϟԡᖔϟϟᖔϟᖔϟሕᖔϟ࿗ ϟጢሕሕ ϟጢ ͱԡँጢ࿗
ዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ԡϟ ͱ࿗ϟ࿗࿗ ϟ࿗ँ ϟᤃጢᤃ ᤃ࿗ ͱԡऐᎮጢ
ዶዹၤႿϟᎮጢᎮϟ ͱሕऐጢᤃ ऐԡ ϟϟጢᤃ ँϟᖔँሕ ͱԡऐϟᎮ
ዶዹၤႿԡϟጢϟ ͱሕ࿗ሕሕ ϟϟጢ ϟ࿗࿗ ϟ ͱԡ࿗ऐ
ዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ϟ ͱሕጢᤃᎮ ऐ࿗ᖔऐጢᖔऐᤃ ϟᎮऐँ ࿗ԡᖔ࿗ϟ ͱԡጢԡሕ
ዶዹၤႿϟԡ࿗ጢሕϟ ͱሕጢᤃᎮ ऐ࿗ᖔऐጢᖔऐᤃ ጢ ጢԡ ͱԡ࿗ԡ
ዶዹၤႿሕᤃ࿗ጢϟ ͱሕጢ࿗࿗ ऐᖔँᖔϟԡᖔϟϟ ँሕሕ ጢጢ ͱԡᎮᎮᤃ
ዶዹၤႿϟ࿗ጢጢᤃϟ ͱሕጢ࿗࿗ ऐᖔँᖔϟԡᖔϟϟᖔϟ ጢጢᤃ ጢऐ ͱԡᤃँ࿗
ዶዹၤႿϟԡᎮᎮᎮϟ ͱሕϟऐँ ࿗ऐ ϟᤃϟϟ ϟሕԡ ͱԡᤃሕ
ዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟ ͱሕጢϟϟ Ꭾሕ ሕሕሕሕ ϟᤃ ͱԡጢᎮऐ
表 ᇺই 保守结构域数量统计 ዶዹၤႿϟᎮሕऐϟܦ ዶዹၤႿϟሕϟᤃऐϟܦ ዶዹၤႿँँᤃᤃϟܦ ዶዹၤႿሕሕᤃጢँϟܦ
ఋᑕᤦᔀ ሕজ ୩ᡷᑕᡷᔽ༁ᡷᔽዹ༁ ᆍ ᡷၤᔀ Ⴟࣼቝᤦᔀʢ ᆍ ዹᆍႿ༁ᔀʢᔀʛ ʛᆍቝᑕᔽႿ ዶዹၤႿऐጢᎮऐϟ 等 ϟ 个成员的二级结构含量为无规则
卷曲 ᢦም᥋螺旋 ᢦ 延伸链 ᢦᏇ᥋转角ଫ ዶዹၤႿԡϟጢϟܦ
保守结构域个数
蛋白名称 间距
ऊᆍႿ༁ᔀʢᔀʛ ʛᆍቝᑕᔽႿ ዶዹၤႿԡϟጢϟ 和 ዶዹၤႿϟԡ࿗ጢሕϟ 三个成员的二级结构
۪ʢᆍᡷᔀᔽႿ Ⴟᑕቝᔀ ᧧Ⴟᡷᔀʢᑕ
Ⴟࣼቝᤦᔀʢ
含量 为无规则卷曲 ᢦ 延伸链 ᢦም᥋螺旋 ᢦᏇ᥋转角ଫ
ዶዹၤႿϟᎮሕऐϟ ϟ
ዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟ 的二级结构含量为无规则卷曲 ᢉ ም᥋螺
ͱ͐ ᤃᤃ
୩ Ꭾ
ዶዹၤႿϟሕϟᤃऐϟ ϟ ఋ ऐϟ ͱ͐ ϟ࿗ԡ
旋ᢦ 延伸 链 ᢦᏇ᥋转角ᤥም᥋螺旋在成员中占比为
ዶዹၤႿँँᤃᤃϟ ϟ ఋ ऐऐ ͱ͐ ϟ࿗Ꭾ
ϟᎮँᠮྉዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ϟɯ ጲ ࿗ԡԡᠮྉዶዹၤႿሕᤃ࿗ጢϟɯଫ延
ዶዹၤႿሕሕᤃጢँϟ ϟ ఋ ऐϟ ͱ ϟ࿗࿗
ዶዹၤႿऐጢᎮऐϟ ϟ ୩ ԡ ͱ Ꭾᤃ 伸链在成员中占比为࿗ԡԡᠮྉዶዹၤႿሕᤃ࿗ጢϟɯ ጲ ϟϟऐᠮ
ዶዹၤႿԡᎮ࿗ጢϟ ϟ ఋ ሕᤃ ͱ͐ ँᤃ ྉዶዹၤႿϟԡ࿗ጢሕϟɯଫ Ꮗ᥋转角在成员中占比 为 ሕऐᠮ
ዶዹၤႿԡጢሕँϟ ϟ ఋ ሕᤃ ͱ͐ ँᤃ
ྉዶዹၤႿϟᎮሕऐϟɯ ጲ ँ࿗ँᠮྉዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟɯଫ无规则卷曲
ዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ԡϟ ϟ ୩ ऐँ ͱ͐ ϟ࿗ऐ
在成员中占比为 ᤃँ ሕऐᠮ ྉ ዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ϟɯ ጲ ሕᎮ ሕ࿗ᠮ
ዶዹၤႿϟᎮጢᎮϟ ϟ ୩ ԡ ͱዶ Ꭾጢ
ዶዹၤႿԡϟጢϟ ϟ ۪ ጢጢ ͱ͐ ϟϟᤃ ྉዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟɯྉ表 ጢᖔ图 Ꭾɯᤥ
通过在线工具 ୩ۼ᧧୩୩᥋ᥘᨃ᧕ጶᓂ 对中华猕猴桃
ዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ϟ ϟ ୩ ऐ ͱશ ऐԡ
۩᧣ᣏ 转录因子进行蛋白质的三级结构预测ᖔ结果显
ዶዹၤႿϟԡ࿗ጢሕϟ ϟ
୩ ऐ
ͱશ ऐԡ
ዶዹၤႿሕᤃ࿗ጢϟ ϟ ँऐ ͱ ϟጢᤃ
示ᖔϟᤃ 个 ۼᨃᣮ 蛋白成员的蛋白质三级结构可分为
ዶዹၤႿϟ࿗ጢጢᤃϟ ँँ ͱ ϟጢᎮ ᖔ ୩ ጢሕͱ ሕϟᤃ
ϟϟ 类ᤥ ዶዹၤႿϟᎮሕऐϟ 与 ዶዹၤႿԡϟጢϟ 为一类ᖔ其代表
ዶዹၤႿϟԡᎮᎮᎮϟ ϟ ᥘ ϟ ͱ͐ ጢϟ
为 ዶዹၤႿԡϟጢϟଫ ዶዹၤႿϟሕϟᤃऐϟ 与 ዶዹၤႿሕሕᤃጢँϟ 为一
ዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟ ϟ ሕጢ ͱ͐ Ꭾሕ
类ᖔ其代表为 ዶዹၤႿϟሕϟᤃऐϟଫዶዹၤႿԡᎮ࿗ጢϟܦዶዹၤႿԡጢሕँϟܦ
ԣॹ 二级结构和三级结构的预测分析 ዶዹၤႿϟᎮጢᎮϟ 为一类ᖔ 其代表为 ዶዹၤႿԡጢሕँϟଫ
使用 ୩ᨃ۪ᥘዶ 程序对中华猕猴桃 ۩᧣ᣏ 转录因 ዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ϟ 与 ዶዹၤႿϟԡ࿗ጢሕϟ 为一类ᖔ 其代表为
子的二级结构进行预测分析ᤥ 结果显示ᖔ大部分 ዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ϟଫ ዶዹၤႿँँᤃᤃϟܦ ዶዹၤႿऐጢᎮऐϟܦ ዶዹၤႿሕᤃሕ࿗ԡϟܦ
ۼᨃᣮ 蛋白成员的二级结构都以无规则卷曲为主ᖔ ዶዹၤႿሕᤃ࿗ጢϟܦዶዹၤႿϟ࿗ጢጢᤃϟܦዶዹၤႿϟԡᎮᎮᎮϟܦዶዹၤႿϟ࿗ϟԡԡϟ 各
其次为 ም᥋螺旋和延伸链ᖔᏇ᥋转角含量最少ᤥ 其中ᖔ 代表一类ྉ图 ऐɯᤥ