Page 100 - 《广西植物》2023年第10期
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１ ８ ５ ４ 广 西 植 物 ４３ 卷
表 １ 轮叶蒲桃叶绿体基因组基因功能总结
Ｔａｂｌｅ １ Ｓｕｍｍａｒｙ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｇｅｎｅ ｆｕｎｃｔｉｏｎｓ ｉｎ Ｓｙｚｙｇｉｕｍ ｇｒｉｊｓｉｉ
基因功能分类 基因分组 基因名称
Ｃａｔｅｇｏｒｙ ｆｏｒ ｇｅｎｅ Ｇｒｏｕｐ ｏｆ ｇｅｎｅ Ｎａｍｅ ｏｆ ｇｅｎｅ
参与光合作用的基因 光合系统亚基 ｐｓａＡꎬ ｐｓａＢꎬ ｐｓａＣꎬ ｐｓａＩꎬ ｐｓａＪꎬ ｐｓｂＡꎬ ｐｓｂＢꎬ ｐｓｂＣꎬ ｐｓｂＤꎬ ｐｓｂＥꎬ
Ｇｅｎｅ ｉｎｖｏｌｖｉｎｇ ｉｎ ｐｈｏｔｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ Ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ ｐｓｂＦꎬ ｐｓｂＩꎬ ｐｓｂＪꎬ ｐｓｂＫꎬ ｐｓｂＬꎬ ｐｓｂＭꎬ ｐｓｂＮꎬ ｐｓｂＴꎬ ｐｓｂＺ
细胞色素 ｂ / ｆ 复合体亚基 ｐｅｔＡꎬ ｐｅｔＢ ꎬ ｐｅｔＤ ꎬ ｐｅｔＧꎬ ｐｅｔＬꎬ ｐｅｔＮ
Ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｂ / ｆ ｃｏｍｐｌｅｘ
ＮＡＤＨ－脱氢酶亚基 ｎｄｈＡ ꎬ ｎｄｈＢ ( ２)ꎬ ｎｄｈＣꎬ ｎｄｈＤꎬ ｎｄｈＥꎬ ｎｄｈＦꎬ ｎｄｈＧꎬ ｎｄｈＨꎬ
Ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ＮＡＤＨ￣ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ ｎｄｈＩꎬ ｎｄｈＪꎬ ｎｄｈＫ
ＡＴＰ 合成酶亚基 ａｔｐＡꎬ ａｔｐＢꎬ ａｔｐＥꎬ ａｔｐＦ ꎬ ａｔｐＨꎬ ａｔｐＩ
Ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ＡＴＰ ｓｙｎｔｈａｓｅ
自身复制相关基因 ＤＮＡ 依赖型 ＲＮＡ 聚合酶 ｒｐｏＡꎬ ｒｐｏＢꎬ ｒｐｏＣ１ ꎬ ｒｐｏＣ２
Ｓｅｌｆ￣ｒｅｐｌｉｃａｔｉｎｇ ｒｅｌａｔｅｄ ｇｅｎｅ ＤＮＡ ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＲＮＡ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ
核糖体蛋白大亚基 ｒｐｌ１４ꎬ ｒｐｌ１６ ꎬ ｒｐｌ２ ( ２ )ꎬ ｒｐｌ２０ꎬ ｒｐｌ２２ꎬ ｒｐｌ２３ ( ２ )ꎬ ｒｐｌ３２ꎬ
Ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ｒｐｌ３３ꎬ ｒｐｌ３６
核糖体蛋白小亚基 ｒｐｓ１１ꎬ ｒｐｓ１２ ( ２)ꎬ ｒｐｓ１４ꎬ ｒｐｓ１５ꎬ ｒｐｓ１６ ꎬ ｒｐｓ１８ꎬ ｒｐｓ１９ꎬ ｒｐｓ２ꎬ
Ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ ｓｍａｌｌ ｓｕｂｕｎｉｔ ｒｐｓ３ꎬ ｒｐｓ４ꎬ ｒｐｓ７(２)ꎬ ｒｐｓ８
核糖体 ＲＮＡ ｒｒｎ１６Ｓ(２)ꎬ ｒｒｎ２３Ｓ(２)ꎬ ｒｒｎ４.５Ｓ(２)ꎬ ｒｒｎ５Ｓ(２)
Ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ＲＮＡｓ
转运 ＲＮＡ ｔｒｎＡ－ＵＧＣ (２)ꎬ ｔｒｎＣ－ＧＣＡꎬ ｔｒｎＤ－ＧＵＣꎬ ｔｒｎＥ－ＵＵＣꎬ ｔｒｎＦ－ＧＡＡꎬ
Ｔｒａｎｓｆｅｒ ＲＮＡｓ ｔｒｎＧ－ＧＣＣ ꎬ ｔｒｎＧ－ＵＣＣꎬ ｔｒｎＨ－ＧＵＧꎬ ｔｒｎＩ －ＣＡＵ(２)ꎬ ｔｒｎＩ －ＧＡＵ
(２)ꎬ ｔｒｎＫ － ＵＵＵ ꎬ ｔｒｎＬ － ＣＡＡ ( ２)ꎬ ｔｒｎＬ － ＵＡＡ ꎬ ｔｒｎＬ － ＵＡＧꎬ
ｔｒｎＭ－ＣＡＵꎬ ｔｒｎＮ－ ＧＵＵ ( ２)ꎬ ｔｒｎＰ － ＵＧＧꎬ ｔｒｎＱ － ＵＵＧꎬ ｔｒｎＲ － ＡＣＧ
(２)ꎬ ｔｒｎＲ－ＵＣＵꎬ ｔｒｎＳ －ＧＣＵ(２)ꎬ ｔｒｎＳ － ＵＧＡꎬ ｔｒｎＴ － ＧＧＵꎬ ｔｒｎＴ －
ＵＧＵꎬ ｔｒｎＶ － ＧＡＣ ( ２ )ꎬ ｔｒｎＶ － ＵＡＣ ꎬ ｔｒｎＷ － ＣＣＡꎬ ｔｒｎＹ －
ＧＵＡꎬ ｔｒｎｆＭ－ＣＡＵ
其他功能基因 乙酰－ＣｏＡ－羧化酶亚基 ａｃｃＤ
Ｏｔｈｅｒ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｇｅｎｅ Ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ａｃｅｔｙｌ￣ＣｏＡ ｃａｒｂｏｘｙｌａｓｅ
Ｃ 类型细胞色素合成基因 ｃｃｓＡ
Ｃ￣ｔｙｐｅ ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｇｅｎｅ
包膜蛋白基因 ｃｅｍＡ
Ｅｎｖｅｌｏｐ ｍｅｍｂｒａｎｅ ｐｒｏｔｅｉｎ
蛋白酶 ｃｌｐＰ
Ｐｒｏｔｅａｓｅ
成熟酶 ｍａｔＫ
Ｍａｔｕｒａｓｅ
未知功能基因 保守开放性阅读框 ｙｃｆ１ꎬ ｙｃｆ２(２)ꎬ ｙｃｆ３ ꎬ ｙｃｆ４
Ｕｎｋｎｏｗｎ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｇｅｎｅ Ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ ｏｐｅｎ ｒｅａｄｉｎｇ ｆｒａｍｅｓ
注: 表示有一个内含子的基因ꎻ 表示有两个内含子的基因ꎻ括号内的数字表示多拷贝基因的拷贝数量ꎮ
Ｎｏｔｅ: ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｔｈｅ ｇｅｎｅ ｗｉｔｈ ｏｎｅ ｉｎｔｒｏｎꎻ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｔｈｅ ｇｅｎｅ ｗｉｔｈ ｔｗｏ ｉｎｔｒｏｎｓꎻ ｔｈｅ ｎｕｍｂｅｒ ｉｎ ｐａｒｅｎｔｈｅｓｅｓ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ｃｏｐｉｅｓ ｏｆ ａ
ｍｕｌｔｉ￣ｃｏｐｙ ｇｅｎｅ.
个窗口的核苷酸多样性ꎬ可显著发现 ＩＲ 区的变异 ２.５ 系统发育分析
度比 ＬＳＣ 和 ＳＳＣ 区更低ꎮ Ｐ 值最高点为 ０.０１５ꎬ位 结果如图 ７ 所示ꎬ分支上的数字为 １ ０００ 次自
ｉ
于 ＬＳＣ 区 的 ｐｓｂＺ － ｐｓａＢ 基 因 间 区ꎮ 图 中 有 ２ 处 展支 持 率ꎮ 系 统 发 育 树 中 具 有 ２０ 个 支 持 率 为
Ｐ ＝ ０.０１５ 的热点ꎬ４５ 处 ０.０１０<Ｐ <０.０１５ꎬ可以看 １００％的拓扑结构节点ꎬ遗传变异度为 ０.０１ꎬ可信
ｉ
ｉ
出核苷酸多样性水平较高ꎮ 度比较高ꎮ 蒲桃属、桉属( Ｅｕｃａｌｙｐｔｕｓ)、伞房桉属
