Page 151 - 《广西植物》2023年第10期

１０ 期 施晓静等: 基于全叶绿体基因组分析的栽培黄草乌基源研究 １ ９ ０ ５

ＤＩＥＲＣＫＸＳＥＮＳ Ｎꎬ ＭＡＲＤＵＬＹＮ Ｐꎬ ＳＭＩＴＳ Ｇꎬ ２０１７. [Ｊ]. Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓꎬ ２８(１２): １６４７－１６４９.
ＮＯＶＯＰｌａｓｔｙ: ｄｅ ｎｏｖｏ ａｓｓｅｍｂｌｙ ｏｆ ｏｒｇａｎｅｌｌｅ ｇｅｎｏｍｅｓ ｆｒｏｍ Ｋｕｎｍｉｎｇ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｂｏｔａｎｙꎬ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ
ｗｈｏｌｅ ｇｅｎｏｍｅ ｄａｔａ [Ｊ]. Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄ Ｒｅｓꎬ ４５(４): ｅ１８. ２０００. Ｆｌｏｒａ Ｙｕｎｎａｎｉｃａ: Ｔｏｍｕｓ １１ [Ｍ]. Ｂｅｉｊｉｎｇ: Ｓｃｉｅｎｃｅ
ＤＯＮＧ Ｓꎬ ＣＨＥＮ ＣＬꎬ ＺＨＵ ＰＦꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０. ＨＰＬＣ Ｐｒｅｓｓ: ８１－８９. [中国科学院昆明植物研究所ꎬ ２０００. 云南
ｄｅｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｒｅｅ ｄｉｅｓｔｅｒ ｄｉｔｅｒｐｅｎｏｉｄ ａｌｋａｌｏｉｄｓ ｏｆ ｗｉｌｄ 植物志: 第十一卷 [Ｍ]. 北京: 科学出版社: ８１－８９.]
ａｎｄ ｃｕｌｔｉｖａｔｅｄ Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｖｉｌｍｏｒｉｎｉａｎｕｍ Ｒａｄｉｘ ｆｒｏｍ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ＬＩ ＸＰꎬ ＨＥ Ｊꎬ ＨＥ ＳＬꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７. Ｒｅｓｅａｒｃｈ ｐｒｏｇｒｅｓｓ ｏｆ
ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ ａｒｅａｓ ｉｎ Ｙｕｎｎａｎ Ｐｒｏｖｉｎｃｅ [Ｊ]. Ｃｈｉｎ Ｊ Ｉｎｆ Ｔｒａｄ Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｖｉｌｍｏｒｉｎｉａｎｕｍ [Ｊ]. Ｊ Ｗ Ｃｈｉｎ Ｆｏｒ Ｓｃｉꎬ ４６(６): １－
Ｃｈｉｎ Ｍｅｄꎬ ２７(４): ７４－７７. [董帅ꎬ 陈翠玲ꎬ 朱培芳ꎬ 等ꎬ ７. [李雪佩ꎬ 何俊ꎬ 贺水莲ꎬ 等ꎬ ２０１７. 黄草乌植物的研
２０２０. ＨＰＬＣ 测定云南不同产地野生与栽培黄草乌中 ３ 种 究进展 [Ｊ]. 西部林业科学ꎬ ４６(６): １－７.]
双酯型二萜生物碱成分含量 [Ｊ]. 中国中医药信息杂志ꎬ ＬＩ ＸＰꎬ ＭＥＮＧ Ｊꎬ ＺＨＡＮＧ ＬＮꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ
２７(４): ７４－７７.] ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｖｉｌｍｏｒｉｎｉａｎｕｍ
Ｅｄｉｔｏｒｉａｌ Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ ｏｆ Ｃｈｉｎａ Ｆｌｏｒａ ｏｆ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ ａｎｄ Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｖｉｌｍｏｒｉｎｉａｎｕｍ ｖａｒ. ｐａｔｅｎｔｉｐｉｌｕｍ [Ｊ]. Ｊ Ｃｈｉｎ
Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ １９７９. Ｆｌｏｒａ Ｒｅｉｐｕｂｌｉｃａｅ Ｐｏｐｕｌａｒｉｓ Ｓｉｎｉｃａｅ: Ｔｏｍｕｓ Ｍｅｄ Ｍａｔꎬ ４１(８): １８１２－１８２０. [李雪佩ꎬ 孟静ꎬ 张琳娜ꎬ
２７ [Ｍ]. Ｂｅｉｊｎｇ: Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｐｒｅｓｓ: ２４５. [中国植物志编辑委 等ꎬ ２０１８. 黄草乌与展毛黄草乌叶绿体全基因组结构的
员会ꎬ １９７９. 中国植物志: 第二十七卷 [Ｍ]. 北京: 科学 比较分析 [Ｊ]. 中药材ꎬ ４１(８): １８１２－１８２０.]
出版社: ２４５.] ＬＩＵ Ｙꎬ ＹＵ ＳＨꎬ ＹＯＵ ＦＭꎬ ２０２０. Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ
ＦＡＮ ＤＣꎬ ＭＵ ＹＴꎬ ＪＩＡ ＪＹꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２. Ｃｏｄｏｎ ｂｉａｓ ａｎｄ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｆｌａｖｕｍ
ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｉｎ ｍｅｄｉｃｉｎａｌ (Ｒａｎｕｎｃｕｌａｃｅａｅ) [Ｊ]. Ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ ＤＮＡ Ｐａｒｔ Ｂꎬ ５(３):
ｐｌａｎｔｓ ｏｆ Ａｃｏｎｉｔｕｍ [ Ｊ/ ＯＬ]. Ｍｏｌ Ｐｌａｎｔ Ｂｒｅｅｄ. ｈｔｔｐ:/ / ３０００－３００１.
ｋｎｓ. ｃｎｋｉ. ｎｅｔ/ ｋｃｍｓ/ ｄｅｔａｉｌ/ ４６. １０６８. Ｓ. ２０２２０７１１. １３３９. ００２. ＬＵＯ Ｙꎬ ＹＡＮＧ ＱＥꎬ ２００５. Ｔａｘｏｎｏｍｉｃ ｒｅｖｉｓｉｏｎ ｏｆ Ａｃｏｎｉｔｕｍ
ｈｔｍｌ. [樊东昌ꎬ 穆赢通ꎬ 贾俊英ꎬ 等ꎬ ２０２２. 乌头属药用 ( Ｒａｎｕｎｃｕｌａｃｅａｅ ) ｆｒｏｍ Ｓｉｃｈｕａｎꎬ Ｃｈｉｎａ [ Ｊ ]. Ａｃｔａ
植物叶绿体基因组密码子特征和系统发育分析 [Ｊ/ Ｐｈｙｔｏｔａｘｏｎ Ｓｉｎꎬ ４３ ( ４): ２８９ － ３８６. [ 罗 艳ꎬ 杨 亲 二ꎬ
ＯＬ]. 分 子 植 物 育 种. ｈｔｔｐ:/ / ｋｎｓ. ｃｎｋｉ. ｎｅｔ/ ｋｃｍｓ/ ｄｅｔａｉｌ/ ２００５. 四川乌头属的修订 [Ｊ]. 植物分类学报ꎬ ４３(４):
４６.１０６８.Ｓ.２０２２０７１１.１３３９.００２.ｈｔｍｌ.] ２８９－３８６.]
ＦＲＡＺＥＲ ＫＡꎬ ＰＡＣＨＴＥＲ Ｌꎬ ＰＯＬＯＡＫＯＶ Ａꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ＬＵＯ Ｙꎬ ＺＨＡＮＧ Ｆꎬ ＹＡＮＧ ＱＥꎬ ２００５. Ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ｏｆ Ａｃｏｎｉｔｕｍ
２００４. ＶＩＳＴＡ: ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ ｔｏｏｌｓ ｆｏｒ ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ｇｅｎｏｍｉｃｓ ｓｕｂｇｅｎｕｓ Ａｃｏｎｉｔｕｍ ( Ｒａｎｕｎｃｕｌａｃｅａｅ ) ｉｎｆｅｒｒｅｄ ｆｒｏｍ ＩＴＳ
[Ｊ]. Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄ Ｒｅｓꎬ ３２: ２７３－２７９. ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ [Ｊ]. Ｐｌａｎｔ Ｓｙｓｔ Ｅｖｏｌꎬ ２５２(１/ ２): １１－２５.
ＧＲＥＩＮＥＲ Ｓꎬ ＬＥＨＷＡＲＫ Ｐꎬ ＢＯＣＫ Ｒꎬ ２０１９. ＭＥＮＧ Ｊꎬ ＬＩ ＸＰꎬ ＬＩ ＨＴꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ
ＯｒｇａｎｅｌｌａｒＧｅｎｏｍｅＤＲＡＷ ( ＯＧＤＲＡＷ ) ｖｅｒｓｉｏｎ １. ３. １: ｔｈｅ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ ｆｏｕｒ Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｍｅｄｉｃｉｎａｌ
ｅｘｐａｎｄｅｄ ｔｏｏｌｋｉｔ ｆｏｒ ｔｈｅ ｇｒａｐｈｉｃａｌ ｖｉｓｕａｌｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ ｏｒｇａｎｅｌｌａｒ ｓｐｅｃｉｅｓ [Ｊ]. Ｍｏｌｅｃｕｌｅｓꎬ ２３(５): １０１５.
ｇｅｎｏｍｅｓ [Ｊ]. Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄ Ｒｅｓꎬ ４７(Ｗ): ５９－６４. ＮＩＥ ＸＪꎬ ＬＶ ＳＺꎬ ＺＨＡＮＧ ＹＸꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１２. Ｃｏｍｐｌｅｔｅ
ＨＯＮＧ Ｙꎬ ＬＵＯ Ｙꎬ ＧＡＯ Ｑꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７. Ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ａｎｄ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｏｆ ａ ｍａｊｏｒ ｉｎｖａｓｉｖｅ ｓｐｅｃｉｅｓꎬ
ｒｅｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｓｕｂｇｅｎｕｓ Ｌｙｃｏｃｔｏｎｕｍ ｃｒｏｆｔｏｎ ｗｅｅｄ ( Ａｇｅｒａｔｉｎａ ａｄｅｎｏｐｈｏｒａ) [ Ｊ]. ＰＬｏＳ ＯＮＥꎬ
(Ｒａｎｕｎｃｕｌａｃｅａｅ) [Ｊ]. ＰＬｏＳ ＯＮＥꎬ １２(１): ｅ０１７１０３８. ７(５): ３６８６９.
ＪＡＮＳＥＮ ＲＫꎬ ＣＡＩ Ｚꎬ ＲＡＵＢＥＳＯＮ ＬＡꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００７. Ａｎａｌｙｓｉｓ ＯＨＹＡＭＡ Ｋꎬ ＦＵＫＵＺＡＷＡ Ｈꎬ ＫＯＨＣＨＩ Ｔꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ １９８６.
ｏｆ ８１ ｇｅｎｅｓ ｆｒｏｍ ６４ ｐｌａｓｔｉｄ ｇｅｎｏｍｅｓ ｒｅｓｏｌｖｅｓ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｉｎ Ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｅ ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ ｄｅｄｕｃｅｄ ｆｒｏｍ ｃｏｍｐｌｅｔｅ
ａｎｇｉｏｓｐｅｒｍｓ ａｎｄ ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｓ ｇｅｎｏｍｅ￣ｓｃａｌｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｏｆ ｌｉｖｅｒｗｏｒｔ Ｍａｒｃｈａｎｔｉａ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈａ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ
ｐａｔｔｅｒｎｓ [ Ｊ ]. Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡꎬ １０４(４９): ＤＮＡ [Ｊ]. Ｎａｔｕｒｅꎬ ３２２(６０７９): ５７２－５７４.
１９３６９－１９３７４. ＰＡＲＫ Ｉꎬ ＫＩＭ Ｗꎬ ＹＡＮＧ Ｓꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７. Ｔｈｅ ｃｏｍｐｌｅｔｅ
ＪＩＡＮＧ ＷＪꎬ ＧＵＯ ＭＹꎬ ＰＡＮＧ ＸＨꎬ ２０２０. Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｏｆ Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｃｏｒｅａｎｕｍ ａｎｄ
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｉｎ ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｃａｒｍｉｃｈａｅｌｉｉ ａｎｄ ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｗｉｔｈ ｏｔｈｅｒ
ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｍｅｄｉｃｉｎａｌ ｐｌａｎｔｓ [Ｊ]. Ｗｏｒｌｄ Ｃｈｉｎ Ｍｅｄꎬ １５(５): Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｓｐｅｃｉｅｓ [Ｊ]. ＰＬｏＳ ＯＮＥꎬ １２(９): ｅ０１８４２５７.
７０２－７０８. [姜汶君ꎬ 郭梦月ꎬ 庞晓慧ꎬ ２０２０. 叶绿体基因 ＰＡＴＥＬ ＲＫꎬ ＪＡＩＮ Ｍꎬ ２０１２. ＮＧＳ ＱＣ Ｔｏｏｌｋｉｔ: ａ ｔｏｏｌｋｉｔ ｆｏｒ
组在药用植物鉴定及系统进化研究中的应用 [Ｊ]. 世界 ｑｕａｌｉｔｙ ｃｏｎｔｒｏｌ ｏｆ ｎｅｘｔ ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｄａｔａ [Ｊ]. ＰＬｏＳ
中医药ꎬ １５(５): ７０２－７０８.] ＯＮＥꎬ ７(２): ｅ３０６１９.
ＫＡＴＯＨ Ｋꎬ ＳＴＡＮＤＬＥＹ ＤＭꎬ ２０１３. ＭＡＦＦＴ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ＰＡＵＷＥＬＡＳ Ｍꎬ ＶＥＫＥＭＡＮＳ Ｘꎬ ＧＯＤÉ Ｃꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１２.
ａｌｉｇｎｍｅｎｔ ｓｏｆｔｗａｒｅ ｖｅｒｓｉｏｎ ７: ｉｍｐｒｏｖｅｎｍｅｎｔｓ ｉｎ ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ Ｎｕｃｌｅａｒ ａｎｄ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ＤＮＡ ｐｈｙｌｏｇｅｏｇｒａｐｈｙ ｒｅｖｅａｌｓ
ａｎｄ ｕｓａｂｉｌｉｔｙ [Ｊ]. Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ Ｅｖｏｌꎬ ３０(４): ７７２－７８０. ｖｉｃａｒｉａｎｃｅ ａｍｏｎｇ Ｅｕｒｏｐｅａｎ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ｏｆ ｔｈｅ ｍｏｄｅｌ ｓｐｅｃｉｅｓ
ＫＥＡＲＳＥ Ｍꎬ ＭＯＩＲ Ｒꎬ ＷＩＬＳＯＮ Ａꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１２. Ｇｅｎｅｉｏｕｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｓｔｕｄｙ ｏｆ ｍｅｔａｌ ｔｏｌｅｒａｎｃｅꎬ Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ ｈａｌｌｅｒｉ
Ｂａｓｉｃ: ａｎ ｉｎｔｅｇｒａｔｅｄ ａｎｄ ｅｘｔｅｎｄａｂｌｅ ｄｅｓｋｔｏｐ ｓｏｆｔｗａｒｅ (Ｂｒａｓｓｉｃａｃｅａｅ) [Ｊ]. Ｎｅｗ Ｐｈｙｔｏｌꎬ １９３(４): ９１６－９２８.
ｐｌａｔｆｏｒｍ ｆｏｒ ｔｈｅ ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ ａｎｄ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｄａｔａ ＲＯＺＡＳ Ｊꎬ ＦＥＲＲＥＲ￣ＭＡＴＡ Ａꎬ ＳÁＮＣＨＥＺ￣ＤＥＬＢＡＲＲＩＯ ＪＣꎬ