Page 154 - 《广西植物》2023年第10期
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Abstract: Rhododendron capitatum and R. przewalskii are ornamental flowers and medicinal plants. The chloroplast
genomes of R. capitatum and R. przewalskii have been sequenced using Illumina HiSeq 4000 platform to explore the
genetic structure and evolution features. After assembly and annotationꎬ comparative genomic analysis and phylogenetic
analysis of the chloroplast genomes of R. capitatum and R. przewalskii were analyzed and compared with those of other
Rhododendron species. The results were as follows: (1) The chloroplast genomes of R. capitatum and R. przewalskii
exhibited a typical quadripartite structureꎬ including a large single copy region (105 990ꎬ 109 191 bp)ꎬ a small single
copy region (2 617ꎬ 2 606 bp)ꎬ and a pair of inverted repeat regions (45 825ꎬ 47 516 bp). And the two Rhododendron
species chloroplast genomes were 200 257 bp and 206 829 bp in lengthꎬ respectively. (2) In additionꎬ the 263 SSRs
were detected in the chloroplast genomes of R. capitatum and R. przewalskiiꎬ most of which had A/ T base preferenceꎻ
the codons preferred ending in A/ U. (3) The chloroplast genomes of Rhododendron species exhibit structural variation
such as gene loss and genomic rearrangement. The study enriches the genomic resources of Rhododendron species and
provides the theoretical reference for resource exploitationꎬ genetic evolutionꎬ breedingꎬ and phylogeny of R. capitatum
and R. przewalskii.
Key words: Rhododendron capitatumꎬ R. przewalskiiꎬ Rhododendron L.ꎬ chloroplast genomesꎬ sequence characteristicsꎬ
structural variation
杜 鹃 属 ( Rhododendron L.) 是 杜 鹃 花 科 耐旱、适应性强等方面的优点ꎬ可作为优良的灌木
(Ericaceae)中最大的属ꎬ也是多样性最为丰富的 类观花植物育种的亲本材料( 曹文侠ꎬ2001ꎻ李永
一个属ꎬ全球共有 1 000 余种ꎬ我国约 571 种ꎬ集 金ꎬ2011)ꎬ因而极具园林观赏价值和良好的产业化
中产于西南、华南地区(杨汉碧等ꎬ1999)ꎮ 杜鹃属 前景ꎮ 目前ꎬ对这两种杜鹃的研究主要集中在功能
植物种类繁多ꎬ花型优美且色泽艳丽ꎬ是国际知名 性状(何家莉等ꎬ2021ꎻYang et al.ꎬ 2021)、化学成分
花卉ꎬ也是我国传统十大名花之一ꎬ素有“ 木本花 (Liao et al.ꎬ 2017ꎻ Bai et al.ꎬ 2019)、生态适应性
卉之王”、“ 花中西施” 的美誉( 李云飞等ꎬ2019)ꎮ (张德罡等ꎬ2003ꎻ曹晓娟等ꎬ2009) 等方面的研究ꎬ
中国是世界上拥有野生杜鹃花资源最丰富的国 而关于其遗传背景的研究尚少ꎮ 明确其遗传背景
家ꎬ得天独厚的资源优势为我国发展杜鹃花卉产 有利于掌握和有效利用优异性状基因资源ꎬ通过分
业和开展杜鹃花品种研究提供了有利条件ꎬ但对 子遗传学育种方法对这两种杜鹃属植物进行种质
于杜鹃属植物的引种驯化、育种和开发利用的研 创新和品种改良具有重要意义ꎮ
究工作却远远落后于其他园林发达的国家和地区 叶绿体起源于细胞内共生的蓝藻ꎬ是植物细
(程淑媛ꎬ2017ꎻ庄平ꎬ2019)ꎮ 一方面ꎬ杜鹃属植物 胞进行光合作用的细胞器ꎬ参与植物的生长发育ꎬ
属于快速的辐射分化( Milne et al.ꎬ 2010) 以及频 在植物漫长的演化过程中发挥着至关重要的作用
繁的种间杂交(Ma et al.ꎬ 2016) 繁衍方式ꎬ因此形 (Daniell et al.ꎬ 2016)ꎮ 高等植物叶绿体基因组一
成多种变异和种间杂交类型ꎬ给野生杜鹃属植物 般为一个长度 120 ~ 160 kb 的双链环状分子ꎬ由一
的种质资源分类鉴定带来困难ꎻ另一方面ꎬ我国杜 个大 单 拷 贝 区 ( large single copyꎬ LSC) ( 81 ~ 90
鹃花育种起步较晚ꎬ基础薄弱( 耿兴敏等ꎬ2021)ꎬ kb)、一 个 小 单 拷 贝 区 ( small single copyꎬ SSC)
在很大程度上制约了杜鹃花新品种的选育及资源 (18 ~ 20 kb) 及 一 对 完 全 相 同 的 反 向 重 复 区
挖掘利用的进程ꎮ (inverted repeatsꎬ IRs)(20 ~ 30 kb) 组成(Jansen et
头花杜鹃(Rhododendron capitatum)和陇蜀杜鹃 al.ꎬ 2005)ꎮ 大部分高等植物叶绿体基因组为母
(R. przewalskii)均为杜鹃属中兼有较高药用价值和 系遗传ꎬ结构保守ꎬ包含大量的遗传信息ꎬ是植物
观赏价值的常绿灌木ꎮ 头花杜鹃和陇蜀杜鹃常以 遗传改良转化、遗传多样性分析、适应性进化、分
叶、花入药ꎬ用于治疗培根病、龙病等ꎬ是藏族地区 子育种研究的惯用信息来源ꎬ为经济作物改良、园
特有的民族特色习用药材(青海省药品检验所和青 艺品种选育、濒危物种保育提供了分子基础( Gu et
海省藏医药研究所ꎬ1996ꎻ罗达尚ꎬ2018)ꎻ并且这两 al.ꎬ 2019ꎻ 王雪芹等ꎬ2021ꎻZhang et al.ꎬ 2022)ꎮ
种植物树形优美、花色艳丽、花期长ꎬ加上其耐寒、 此外ꎬ前人采用了 DNA 条形码技术( Yan et al.ꎬ