Page 158 - 《广西植物》2023年第10期
P. 158
１ ９ １ ２ 广 西 植 物 ４３ 卷
表 １ ９ 种杜鹃属植物叶绿体基因组基本特征
Ｔａｂｌｅ １ Ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｏｆ ｇｅｎｅｒａｌ ｆｅａｔｕｒｅｓ ｏｆ ｎｉｎｅ Ｒｈｏｄｏｄｅｎｄｒｏｎ ｓｐｅｃｉｅｓ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ
长度 Ｌｅｎｇｔｈ 基因数量 ＧＣ
(ｂｐ) Ｇｅｎｅ ｎｕｍｂｅｒ (％)
物种 序列号
Ｓｐｅｃｉｅｓ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ.
总计
Ｆｕｌｌ ＬＳＣ ＳＳＣ ＩＲ ＰＣＧ ｔＲＮＡ ｒＲＮＡ Ｆｕｌｌ ＬＳＣ ＳＳＣ ＩＲ
Ｔｏｔａｌ
头花杜鹃 ＯＬ８０４２９５ ２００ ２５７ １０５ ９９０ ２ ６１７ ４５ ８２５ １３８ ８６ ４４ ８ ３５.８ ３５.４ ２９.８ ３６.６
Ｒ. ｃａｐｉｔａｔｕｍ
陇蜀杜鹃 ＯＬ８７１１９０ ２０６ ８２９ １０９ １９１ ２ ６０６ ４７ ５１６ １４３ ８９ ４６ ８ ３５.７ ３５.１ ３０.０ ３６.５
Ｒ. ｐｒｚｅｗａｌｓｋｉｉ
秀雅杜鹃 ＭＴ２３９３６６ ２０７ ２３６ １１０ ３２６ ２ ６０２ ４７ １５４ １３８ ８９ ４１ ８ ３５.９ ３５.４ ３０.２ ３６.６
Ｒ. ｃｏｎｃｉｎｎｕｍ
马缨杜鹃(原变种) ＮＣ＿０４７４３８ １９３ ７９８ １０９ ９５７ ２ ６１２ ４０ ５８３ １２３ ８０ ３５ ８ ３６.０ ３５.３ ２９.８ ３７.１
Ｒ. ｄｅｌａｖａｙｉ ｖａｒ.
ｄｅｌａｖａｙｉ
朱红大杜鹃 ＮＣ＿０５０１６２ ２０６ ４６７ １０８ ９２２ ２ ６１１ ４７ ４６７ １５０ ９５ ４７ ８ ３５.８ ３５.３ ３０.０ ３６.５
Ｒ. ｇｒｉｅｒｓｏｎｉａｎｕｍ
灵宝杜鹃 ＭＴ２３９３６３ ２０８ ０１５ １１０ ５９３ ２ ６０６ ４７ ４０８ １３６ ８６ ４２ ８ ３５.８ ３５.３ ３０.０ ３６.６
Ｒ. ｈｅｎａｎｅｎｓｅ ｓｕｂｓｐ.
ｌｉｎｇｂａｏｅｎｓｅ
照山白 ＭＴ２３９３６５ ２０７ ２３３ １１０ ３７６ ２ ６２１ ４７ １１８ １４１ ８９ ４４ ８ ３５.９ ３５.４ ３６.７ ３６.７
Ｒ. ｍｉｃｒａｎｔｈｕｍ
羊踯躅 ＭＺ０７３６７２ １９７ ８７７ １１０ １８９ ２６ ４３ ８３１ １４５ ９１ ４６ ８ ３６.０ ３５.３ ７.７ ３６.９
Ｒ. ｍｏｌｌｅ
阔柄杜鹃 ＮＣ＿０５３７４６ ２０１ ０４７ １０９ １３４ ２ ６１３ ４４ ６５０ １４３ ９３ ４２ ８ ３５.９ ３５.３ ３０.０ ３６.８
Ｒ. ｐｌａｔｙｐｏｄｕｍ
２.４ 杜鹃属叶绿体基因组比较 杜鹃)也聚在一起ꎬ但未形成单系ꎮ 本研究测得的
利用 ｍＶＩＳＴＡ 软件对 ９ 种杜鹃属植物叶绿体 陇蜀杜鹃与阔柄杜鹃互为姐妹关系ꎬ支持率较高
基因组进行了全序列比对ꎮ 由图 ３ 可知ꎬ杜鹃属 (ＢＳ ＝ ６７％ꎬＰＰ ＝ １)ꎻ陇蜀杜鹃与照山白亲缘关系
植物叶绿体基因组种间整体上呈现较高的保守 相对较近(ＢＳ ＝ １００％ꎬＰＰ ＝ １)ꎮ
性ꎬ编码区比非编码区保守ꎬ反向重复区比两个单
拷贝区保守ꎮ 在 ９ 种杜鹃属植物中ꎬ分化程度较 ３ 讨论与结论
高的是 ｍａｔＫ － ｙｃｆ３、 ｔｒｎＭ － ＣＡＵ － ｒｐｏＢ、 ｔｒｎＴ － ＧＧＵ －
ａｃｃＤ、ｒｐｏＡ－ｐｓｂＪ、ｔｒｎＭ－ＣＡＵ－ｒｒｎ１６、ｔｒｎＩ－ＣＡＵ－ｒｐｓ１６ 本研究通过对头花杜鹃、陇蜀杜鹃叶绿体全
和 ｒｐｓ１６－ｐｓａＩ７ 个基因间隔区(图 ３)ꎮ 基因组的特征分析ꎬ以及与 ７ 个已报道的杜鹃属
２.５ 系统发育分析 植物叶绿体基因组比较分析结果表明ꎬ杜鹃属植
基于 １７ 个物种的叶绿体全基因组序列的系 物叶绿体基因组结构和基因顺序发生了显著变
统发育分析结果(图 ４)显示ꎬＭＬ 和 ＢＩ 系统发育树 化ꎮ 通过与大部分被子植物叶绿体基因组对比发
拓扑结构完全一致ꎬ所有的分支都具有较高的支 现ꎬ杜鹃属植物叶绿体基因组中除 ＳＳＣ 区急剧缩
持率(ＢＳ≥６３％ꎬＰＰ ＝ １)ꎮ 杜鹃属的单系性得到强 小外ꎬ其余各区均高度延展ꎬ特别是 ＩＲ 区几乎延
烈支持(ＢＳ ＝ １００％ꎬＰＰ ＝ １)ꎬ白珠树属与越桔属形 展约 ２ 倍ꎬ由此推测 ＩＲ 区的扩张是导致杜鹃属植
成姊妹群(ＢＳ ＝ １００％ꎬＰＰ ＝ １)ꎬ共同构成杜鹃属的 物叶绿体基因组增大的主要原因ꎮ 这种整个基因
姊妹群ꎬ支持率较高(ＢＳ ＝ １００％ꎬＰＰ ＝ １)ꎮ 在杜鹃 组发生的显著结构变异的重排现象也在其他物种
内部ꎬ９ 个杜鹃属物种聚为一支ꎬ常绿杜鹃亚属 ５ 中发现ꎬ如天竺葵(Ｐｅｌａｒｇｏｎｉｕｍ × ｈｏｒｔｏｒｕｍ)叶绿体
个种 [陇蜀杜鹃、阔柄杜鹃、朱红大杜鹃、马缨杜 基因组的 ＩＲ 区延展至 ７５ ｋｂꎬ基因组全长约为 ２００
鹃(原变 种)、 灵 宝 杜 鹃] 聚 为 一 支 ( ＢＳ ＝ １００％ꎬ ｋｂ(Ｃｈｕｍｌｅｙ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００６)ꎬ日本柳杉( Ｃｒｙｐｔｏｍｅｒｉａ
ＰＰ ＝ １)ꎬ杜鹃亚属 ３ 个种(秀雅杜鹃、照山白、头花 ｊａｐｏｎｉｃａ) 叶绿体基因组完全缺失了 ＩＲ 区ꎬ其叶绿
