Page 153 - 《广西植物》2023年第10期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｏｃｔ. ２０２３ꎬ ４３(１０): １９０７－１９２０
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２２０４０１０
贾守宁ꎬ 张颖敏ꎬ 赵国福ꎬ 等ꎬ ２０２３. 头花杜鹃、陇蜀杜鹃及杜鹃属植物叶绿体基因组比较分析 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ４３(１０):
１９０７－１９２０.
ＪＩＡ ＳＮꎬ ＺＨＡＮＧ ＹＭꎬ ＺＨＡＯ ＧＦꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ Ｒｈｏｄｏｄｅｎｄｒｏｎ ｃａｐｉｔａｔｕｍꎬ
Ｒ. ｐｒｚｅｗａｌｓｋｉｉꎬ ａｎｄ Ｒｈｏｄｏｄｅｎｄｒｏｎ ｓｐｅｃｉｅｓ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ４３(１０): １９０７－１９２０.
头花杜鹃、陇蜀杜鹃及杜鹃属植物
叶绿体基因组比较分析
贾守宁 ꎬ 张颖敏 ꎬ 赵国福 ꎬ 陈文娟 ꎬ 李国栋 ３ꎬ４∗
２
１
１
１
( １. 青海省中医院ꎬ 西宁 ８１００００ꎻ ２. 云南中医药大学 第一临床医学院ꎬ 昆明 ６５０５００ꎻ ３. 云南中医药大学 中药学院ꎬ
昆明 ６５０５００ꎻ ４. 云南中医药大学 云南省傣医药与彝医药重点实验室ꎬ 昆明 ６５０５００ )
摘 要: 头花杜鹃(Ｒｈｏｄｏｄｅｎｄｒｏｎ ｃａｐｉｔａｔｕｍ)和陇蜀杜鹃(Ｒ. ｐｒｚｅｗａｌｓｋｉｉ) 是极具观赏价值的野生花卉和药用
植物ꎮ 为探讨头花杜鹃和陇蜀杜鹃叶绿体基因组的遗传结构及进化特征ꎬ该研究利用 Ｉｌｌｕｍｉｎａ ＨｉＳｅｑ ４０００
平台对头花杜鹃和陇蜀杜鹃的叶绿体全基因组进行测序ꎬ经组装和注释后ꎬ结合 ７ 个已发表的杜鹃属植物
叶绿体全基因组进行比较基因组学分析和系统发育分析ꎮ 结果表明:(１)头花杜鹃和陇蜀杜鹃叶绿体全基
因组呈典型的环状四分体结构ꎬ均由一个大单拷贝区(１０５ ９９０、１０９ １９１ ｂｐ)、一个小单拷贝区(２ ６１７、２ ６０６
ｂｐ)和一对反向重复区(４５ ８２５、４７ ５１６ ｂｐ)构成ꎬ全长分别为 ２００ ２５７、２０６ ８２９ ｂｐꎮ (２)头花杜鹃和陇蜀杜鹃
叶绿体基因组中共鉴定出 ２６３ 个 ＳＳＲ 位点ꎬ大部分 ＳＳＲ 偏好使用 Ａ / Ｔ 碱基ꎬ密码子偏好使用 Ａ / Ｕ 结尾ꎮ
(３)杜鹃属植物叶绿体全基因组中普遍存在基因丢失以及基因组重排等结构变异现象ꎮ 该研究丰富了杜鹃
属植物的基因组资源ꎬ为头花杜鹃、陇蜀杜鹃的资源开发、遗传进化、育种及系统发育相关研究提供了理论
参考ꎮ
关键词: 头花杜鹃ꎬ 陇蜀杜鹃ꎬ 杜鹃属ꎬ 叶绿体基因组ꎬ 序列特征ꎬ 结构变异
中图分类号: Ｑ９４３ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２３)１０￣１９０７￣１４
Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ
Ｒｈｏｄｏｄｅｎｄｒｏｎ ｃａｐｉｔａｔｕｍꎬ Ｒ. ｐｒｚｅｗａｌｓｋｉｉꎬ
ａｎｄ Ｒｈｏｄｏｄｅｎｄｒｏｎ ｓｐｅｃｉｅｓ
１ ２ １ １ ３ꎬ４∗
ＪＩＡ Ｓｈｏｕｎｉｎｇ ꎬ ＺＨＡＮＧ Ｙｉｎｇｍｉｎ ꎬ ＺＨＡＯ Ｇｕｏｆｕ ꎬ ＣＨＥＮ Ｗｅｎｊｕａｎ ꎬ ＬＩ Ｇｕｏｄｏｎｇ
( １. Ｑｉｎｇｈａｉ Ｈｏｓｐｉｔａｌ ｏｆ Ｔｒａｄｉｔｉｏｎａｌ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ｍｅｄｉｃｉｎｅꎬ Ｘｉｎｉｎｇ ８１００００ꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ２. Ｆｉｒｓｔ Ｃｏｌｌｅｇｅ ｆｏｒ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｍｅｄｉｃｉｎｅꎬ Ｙｕｎｎａｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｃｈｉｎｅｓｅ
Ｍｅｄｉｃｉｎｅꎬ Ｋｕｎｍｉｎｇ ６５０５００ꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ３. Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｔｒａｄｉｔｉｏｎａｌ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ｍｅｄｉｃｉｎｅꎬ Ｙｕｎｎａｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｃｈｉｎｅｓｅ ＭｅｄｉｃｉｎｅꎬＫｕｎｍｉｎｇ ６５０５００ꎬ
Ｃｈｉｎａꎻ ４. Ｙｕｎｎａｎ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｄａｉ ａｎｄ Ｙｉ Ｍｅｄｉｃｉｎｅｓꎬ Ｙｕｎｎａｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ｍｅｄｉｃｉｎｅꎬ Ｋｕｎｍｉｎｇ ６５０５００ꎬ Ｃｈｉｎａ )
收稿日期: ２０２２－０５－２０
基金项目: 青海省中藏医药科研创新项目(Ｊ２０２０００５)ꎻ ２０１８ 年中医药公共卫生服务补助专项 (财社〔２０１８〕４３ 号)ꎮ
第一作者: 贾守宁(１９６６－)ꎬ主任药师ꎬ研究方向为中藏药药效物质的研究、利用与开发ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｊｉａｓｈｏｕｎｉｎｇ＠１６３.ｃｏｍꎮ
∗
通信作者: 李国栋ꎬ博士ꎬ副教授ꎬ研究方向为分子生药学ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｌｉｇｕｏｄｏｎｇ＠ｙｎｕｔｃｍ.ｅｄｕ.ｃｎꎮ
