Page 163 - 《广西植物》2023年第4期

࿗ 期 黄婷等᧥ 四种栎属青冈亚属植物叶绿体基因组特征及系统发育研究 Ꭾ ࿗ ጢ

圆圈内外的灰色箭头表示基因转录方向ଫ不同的颜色代表不同功能的基因ଫ内圈深灰色表示 ᥈ऊ 含量ᖔ浅灰色表示 ዶఋ 含量ᤥ
᥈ʢᑕᢃ ᑕʢʢᆍऔ༁ ᔽႿ༁ᔽʛᔀ ᑕႿʛ ᆍࣼᡷ༁ᔽʛᔀ ᡷၤᔀ ዹᔽʢዹ᤟ᔀ ᔽႿʛᔽዹᑕᡷᔀ ᡷၤᔀ ʛᔽʢᔀዹᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ੫ᔀႿᔀ ᡷʢᑕႿ༁ዹʢᔽᡱᡷᔽᆍႿଫ ᧕ᔽ஦஦ᔀʢᔀႿᡷ ዹᆍ᤟ᆍʢ༁ ʢᔀᡱʢᔀ༁ᔀႿᡷ ੫ᔀႿᔀ༁ औᔽᡷၤ ʛᔽ஦஦ᔀʢᔀႿᡷ ஦ࣼႿዹᡷᔽᆍႿ༁ଫ
᧕ᑕʢҴ ੫ʢᑕᢃ ᔽႿ ᡷၤᔀ ᔽႿႿᔀʢ ዹᔽʢዹ᤟ᔀ ʢᔀᡱʢᔀ༁ᔀႿᡷ༁ ᥈ऊ ዹᆍႿᡷᔀႿᡷᖔ ᡷၤᔀ ᤟ᔽ੫ၤᡷ ੫ʢᑕᢃ ʢᔀᡱʢᔀ༁ᔀႿᡷ༁ ዶఋ ዹᆍႿᡷᔀႿᡷ঎
图 ϓই ྽ 种栎属青冈亚属植物的叶绿体基因组图谱
èᔽ੫঎ ϟ ᥈ᔀႿᔀ ቝᑕᡱ ᆍ஦ ዹၤ᤟ᆍʢᆍᡱ᤟ᑕ༁ᡷ ੫ᔀႿᆍቝᔀ ᔽႿ ஦ᆍࣼʢ ༁ᡱᔀዹᔽᔀ༁ ᆍ஦ ࣩͅᓣʗዞࣩ໧ ༁ࣼᤦ੫঎ ࣷᡥዞᤀᅳᤇᐹᤀᐹႥᅳᡓ໧ᔠ໧

植物的密码子偏好性各指数相差不大ᖔ说明它们 ԰঎԰঎԰ 中性绘图分析জ 从 ࿗ 种栎属青冈亚属植物叶
密码子使用情况相似ྉ 表 ࿗ɯ ᤥ ࿗ 种栎属青冈亚属 绿体基因组筛选出以 ዶఋ᥈ 为起始密码子ܦ长度大
植物的 ᥈ऊሕ 含量在 ԰ँ঎ऐጢᠮ ጲ ԰ँ঎ऐऐᠮ之间ᖔ表明 于 ሕԡԡ ᡱᤦ 的非重复序列进行中性绘图ᖔ结果ྉ 图
栎属青冈亚属植物更偏好以 ዶᣰ ఋ 结尾的密码子ᤥ ሕɯ显示ᖔ宁冈青冈ܦ曼青冈ܦ毛曼青冈ܦ竹叶青冈
如图 ԰ 所示ᖔ亮氨酸ྉᓂᔀࣼɯܦ丝氨酸ྉ୩ᔀʢɯ 精氨 ᥈ऊሕ 和 ᥈ऊ 的相关系数分别为 ԡ঎ԡϟܦԡ঎ԡጢܦԡ঎ԡϟܦ
ϟ԰
酸ྉዶʢ੫ɯ有 ᤃ 个同义密码子ᖔ色氨酸ྉఋʢᡱɯܦ甲硫氨 ԡ঎ԡᤃᖔ回归系数分别为ԡ঎ϟ԰ܦԡ঎ሕ࿗ܦԡ঎ሕ࿗ܦԡ঎ሕᤃᖔ双尾

酸ྉᥘᔀᡷɯ仅由一种密码子编码ᖔ其余氨基酸均由 ԰ 检验结果均为ۗጐԡ঎ԡϟᖔ说明 ᥈ऊ 和 ᥈ऊሕ 之间的相
ϟ԰
个及以上的同义密码子编码ᤥ 这 ऐ 种栎属青冈亚 关性较弱ᖔ组成密码子碱基的第 ϟܦ第 ԰ 位和第 ሕ
属植物的密码子偏好性相似ᖔ 其中 ዶऊВܦ ВऊВܦ 位之间存在显著差异ᤥ 由此推测ᖔ自然选择对 ࿗
ВВዶܦ᥈ऊВܦВዶВܦ᥈ዶВܦዶ᥈ዶ 的使用频率较高ᖔ而 种栎属青冈亚属植物叶绿体基因组密码子的使用

ऊВऊܦ ऊВ᥈ܦ ᥈ऊ᥈ܦ Вዶऊܦ ऊዶऊܦ ऊዶ᥈ܦ ዶዶऊܦ ዶዶ᥈ܦ 偏好性的影响更大ᤥ
᥈ዶऊܦ᥈ዶ᥈ܦऊ᥈ऊܦऊ᥈᥈ܦዶ᥈ऊܦ᥈᥈ऊ 的 使 用频率较 ԰঎԰঎ሕ ጶશऊ᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 绘图分析জ 由图 ࿗ 结果显示ᖔ大部
低ᤥ 在米 槠 ྉ ࣷᐹ໧ᡙᐹႥᅳᡓ໧ᔠ໧ ዞᐹʗᤀᓣ໧ᔠᔠ ɯܦ 长果柯 分基因的实际 ጶશऊ 值在标准曲线之下ᖔ说明自然
ྉᒦᔠᡙ၊ᅳዞᐹʗᡓࣩ໧ ᤀᅳႥ੖ᔠႥࣩଝɯ 中 Вዶዶ 的使用频率较所列 选择对这部分基因的密码子使用偏好性的影响更

的其他植物低ᤥ 大ଫ少部分基因的实际 ጶશऊ 值在标准曲线附近或