Page 164 - 《广西植物》2023年第4期

Ꭾ ࿗ ᤃ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ሕ 卷
表 ԣই ྽ 种栎属青冈亚属植物叶绿体基因组特征比较 表 ᇺই ྽ 种栎属青冈亚属植物叶绿体基因组基因组成
ఋᑕᤦ᤟ᔀ ԰জ ऊᆍቝᡱᑕʢᔽ༁ᆍႿ ᆍ஦ ዹၤ᤟ᆍʢᆍᡱ᤟ᑕ༁ᡷ ੫ᔀႿᆍቝᔀ༁ ᑕቝᆍႿ੫ ఋᑕᤦ᤟ᔀ ሕজ ऊᆍቝᡱᆍ༁ᔽᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ዹᆍቝᡱ᤟ᔀᡷᔀ ዹၤ᤟ᆍʢᆍᡱ᤟ᑕ༁ᡷ ੫ᔀႿᆍቝᔀ ᆍ஦
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宁冈青冈 曼青冈 毛曼青冈 竹叶青冈 基因功能分类 基因分组 基因名称 数量
物种 ࣩͅᓣʗዞࣩ໧ ͅॹ ͅॹ ͅॹ ऊᑕᡷᔀ੫ᆍʢᢃ ᆍ஦ ੫ᔀႿᔀ ᥈ʢᆍࣼᡱ ᆍ஦ ੫ᔀႿᔀ શᑕቝᔀ ᆍ஦ ੫ᔀႿᔀ શࣼቝᤦᔀʢ
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基因组大小 ϟᤃԡ ँԡᤃ ϟᤃԡ ऐऐሕ ϟᤃԡ ऐሕ԰ ϟᤃԡ Ꭾऐ࿗ 转运 ኏શዶ 基因 ᡙʗႥዛ᤬Іᤩࣷྉġ԰ɯ᥍ଫ ᡙʗႥࣷ᤬ᤩࣷዛଫ ሕᎮ
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大单拷贝区长度 ँԡ ԰ँᎮ ँԡ ሕᤃԡ ँԡ ԰ጢँ ँԡ ԰࿗ጢ
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小单拷贝区长度 ϟऐ ँ԰ँ ϟऐ ऐँϟ ϟऐ ँԡጢ ϟऐ ऐँጢ ᡙʗႥᒦ᤬ࣷዛዛ ྉ ġ ԰ɯଫ ᡙʗႥᒦ᤬Іዛዛ᥍ଫ
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反向重复区长度 ԰ጢ ऐ࿗ԡ ԰ጢ ऐϟᤃ ԰ጢ ऐሕ࿗ ԰ጢ ऐ԰԰ ᤩࣷІଫ ᡙʗႥ୒᤬ᤩᤩዛଫ ᡙʗႥ୒᤬Іᤩዛଫ
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蛋白编码基因数 ऐऐ ऐऐ ऐऐ ऐऐ ᡙʗႥɔ᤬ᤩІዛ
શࣼቝᤦᔀʢ ᆍ஦ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ᥋
኏શዶ 聚合酶
ዹᆍʛᔽႿ੫ ੫ᔀႿᔀ༁ ʗᡓᅳዛଫ ʗᡓᅳଧଫ ʗᡓᅳࣷϟ᥍ଫ ʗᡓᅳࣷ԰ ࿗
኏શዶ ᡱᆍ᤟ᢃቝᔀʢᑕ༁ᔀ
转运 ኏શዶ 基因数 ሕᎮ ሕᎮ ሕᎮ ሕᎮ
核糖体小亚基 ʗᡓ໧԰ଫ ʗᡓ໧ሕଫ ʗᡓ໧࿗ଫ ʗᡓ໧Ꭾྉġ԰ɯଫ ʗᡓ໧ऐଫ ϟ࿗
શࣼቝᤦᔀʢ ᆍ஦ ᡷ኏શዶ ੫ᔀႿᔀ༁ ୩ቝᑕ᤟᤟ ༁ࣼᤦࣼႿᔽᡷ ʗᡓ໧ϟϟଫ ʗᡓ໧ϟ԰ྉġ԰ɯ᥍᥍ଫ ʗᡓ໧ϟ࿗ଫ
核糖体 ኏શዶ 基因数 ऐ ऐ ऐ ऐ ᆍ஦ ʢᔽᤦᆍ༁ᆍቝᑕ᤟ ʗᡓ໧ϟጢଫ ʗᡓ໧ϟᤃ᥍ଫ ʗᡓ໧ϟऐଫ ʗᡓ໧ϟँ
શࣼቝᤦᔀʢ ᆍ஦ ʢ኏શዶ ੫ᔀႿᔀ༁ 核糖体大亚基 ʗᡓᤀ԰ྉ ġ ԰ɯ ᥍ଫ ʗᡓᤀϟ࿗ଫ ʗᡓᤀϟᤃ ᥍ଫ ϟϟ
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总基因数 ϟሕሕ ϟሕሕ ϟሕሕ ϟሕሕ ᆍ஦ ʢᔽᤦᆍ༁ᆍቝᑕ᤟ ʗᡓᤀሕ԰ଫ ʗᡓᤀሕሕଫ ʗᡓᤀሕᤃ
ఋᆍᡷᑕ᤟ Ⴟࣼቝᤦᔀʢ ᆍ஦ ੫ᔀႿᔀ༁
光合作用 શዶ᧕̀᥋脱氢酶 Ⴅʐ၊ዛ᥍ଫ Ⴅʐ၊ଧྉ ġ԰ɯ ᥍ଫ Ⴅʐ၊ࣷଫ ϟ԰
总的 ᥈ऊ 含量 ሕᤃ঎ँ ሕᤃ঎ँ ሕᤃ঎ँ ሕᤃ঎ँ ۪ၤᆍᡷᆍ༁ᢃႿᡷၤᔀ༁ᔽ༁ શዶ᧕̀ Ⴅʐ၊ᦵଫ Ⴅʐ၊ጛଫ Ⴅʐ၊Þଫ Ⴅʐ၊ᤩଫ
᥈ऊ ዹᆍႿᡷᔀႿᡷ ᆍ஦ ʛᔀၤᢃʛʢᆍ੫ᔀႿᑕ༁ᔀ Ⴅʐ၊̵ଫ Ⴅʐ၊ᧇଫ Ⴅʐ၊ȣଫ Ⴅʐ၊ᣞ
ᆍ׹ᔀʢᑕ᤟᤟ ྉᠮɯ 光系统ሙ ᡓ໧ᐹዛଫ ᡓ໧ᐹଧଫ ᡓ໧ᐹࣷଫ ᡓ໧ᐹᧇଫ ᡓ໧ᐹȣ ጢ
大单拷贝区 ᥈ऊ 含量 ሕ࿗঎ऐ ሕ࿗঎ऐ ሕ࿗঎Ꭾ ሕ࿗঎ऐ ۪ၤᆍᡷᆍ༁ᢃ༁ᡷᔀቝ ሙ
᥈ऊ ዹᆍႿᡷᔀႿᡷ 光系统֒ ᡓ໧ᤇዛଫ ᡓ໧ᤇଧଫ ᡓ໧ᤇࣷଫ ᡓ໧ᤇᦵଫ ᡓ໧ᤇጛଫ ϟጢ
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ᆍ஦ ᓂ୩ऊྉᠮɯ
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小单拷贝区 ᥈ऊ 含量 ሕϟ঎ϟ ሕϟ঎ϟ ሕϟ঎ϟ ሕϟ঎ԡ
细胞色素 ᤦᣰ ஦ 复合物 ᡓᓣᡙዛଫ ᡓᓣᡙଧ ᥍ଫ ᡓᓣᡙᦵ ᥍ଫ ᡓᓣᡙᤩଫ ᤃ
᥈ऊ ዹᆍႿᡷᔀႿᡷ
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ᆍ஦ ୩୩ऊ ྉᠮɯ
ዶఋ۪ 合成酶 ᐹᡙᡓዛଫ ᐹᡙᡓଧଫ ᐹᡙᡓጛଫ ᐹᡙᡓÞ᥍ଫ ᤃ
反向重复区 ᥈ऊ 含量 ࿗԰঎ऐ ࿗԰঎ऐ ࿗԰঎ऐ ࿗԰঎ऐ ዶఋ۪ ༁ᢃႿᡷၤᑕ༁ᔀ ᐹᡙᡓ̵ଫ ᐹᡙᡓᧇ
᥈ऊ ዹᆍႿᡷᔀႿᡷ
二磷酸核酮糖羧化 ʗᤇዞᒦ ϟ
ᆍ஦ ᧧኏༁ ྉᠮɯ
酶大亚基基因
基因编码区 ᥈ऊ 含量 ሕᎮ঎ँ ሕᎮ঎ँ ሕᎮ঎ँ ሕᎮ঎ँ ᓂᑕʢ੫ᔀ ༁ࣼᤦࣼႿᔽᡷ ᆍ஦ ʢࣼᤦᔽ༁ዹᆍ
᥈ऊ ዹᆍႿᡷᔀႿᡷ 其他基因 蛋白酶基因 ዞᤀᡓۗ᥍᥍ ϟ
ᆍ஦ ऊ᧕༁ྉᠮɯ ᨃᡷၤᔀʢ ੫ᔀႿᔀ༁ ۪ʢᆍᡷᔀᑕ༁ᔀ
成熟酶基因 ቂᐹᡙᣞ ϟ
ᥘᑕᡷࣼʢᑕ༁ᔀ
乙酰 ऊᆍዶ 羧化酶的 ᐹዞዞᦵ ϟ
上方ᖔ说明突变对其密码子的使用偏好性影响更 亚基
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大ᤥጶશऊ 比值频率分布ྉ表 ጢɯ 显示ᖔ宁冈青冈ܦ曼 ऊᆍዶ᥋ዹᑕʢᤦᆍ଴ᢃ᤟ᑕ༁ᔀ
青冈ܦ毛曼青冈ܦ竹叶青冈中位于 ͱ ԡ঎ԡጢ ጲ ԡ঎ԡጢ 区 包膜蛋白基因 ዞᓣቂዛ ϟ
ጶႿ׹ᔀ᤟ᆍᡱᔀ
间的基因分别有 ϟँܦϟऐܦϟऐܦϟँ 个ᖔ分别占 ሕᎮᠮܦ ቝᔀቝᤦʢᑕႿᔀ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ
ऊ 型细胞色素合成 ዞዞ໧ዛ ϟ
ሕጢᠮܦሕጢᠮܦሕᎮᠮᖔ表明突变对这些基因的影响较 ऊ᥋ᡷᢃᡱᔀ ዹᢃᡷᆍዹၤʢᆍቝᔀ༁ᢃႿᡷၤᔀ༁ᔽ༁
大ᤥ 这 ࿗ 种栎属青冈亚属植物中有 ሕሕ ጲ ሕ࿗ 个基因 翻译起始因子 ᔠႥஏዛ ϟ
ఋʢᑕႿ༁᤟ᑕᡷᔽᆍႿ ᔽႿᔽᡷᔽᑕᡷᔽᆍႿ ஦ᑕዹᡷᆍʢ
的实际 ጶશऊ 值与理论 ጶશऊ 值差距较大ᖔ这部分基 未知功能基因 开放阅读框 ᡥዞஏϟྉġ԰ɯଫ ᡥዞஏ԰ྉġ԰ɯଫ ᡥዞஏሕ᥍᥍ଫ ऐ
因受自然选择的影响作用较大ᤥጶશऊ᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 分析结 ВႿҴႿᆍऔႿ ஦ࣼႿዹᡷᔽᆍႿ ᨃᡱᔀႿ ʢᔀᑕʛᔽႿ੫ ஦ʢᑕቝᔀ ᡥዞஏ࿗ଫ ᡥዞஏϟጢྉġ԰ɯ
੫ᔀႿᔀ
果和 ጶશऊ 比值频率分布显示ᖔ࿗ 种栎属青冈亚属 总数 ఋᆍᡷᑕ᤟ ϟሕሕ
植物的叶绿体基因组密码子偏好性虽同时受突变
জ 注᧥ྉġ԰ɯ两次拷贝ଫ᥍一个内含子ଫ᥍᥍两个内含子ᤥ
和自然选择的影响ᖔ但总体而言ᖔ自然选择的影响 জશᆍᡷᔀ᧥ ྉġ԰ɯ ᡷऔᆍ ዹᆍᡱᔽᔀ༁ଫ ᥍ ᆍႿᔀ ᔽႿᡷʢᆍႿଫ ᥍᥍ᡷऔᆍ ᔽႿᡷʢᆍႿ༁঎
大于突变带来的影响ᤥ
԰঎԰঎࿗ ۪኏԰᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 绘图分析জ 由图 ጢ 可知ᖔ分布于中 远离中心的点则受自然选择的影响ᤥ࿗ 种栎属青
心点上或附近的基因主要受突变的影响ᖔ 而大多 冈亚属植物的 ۪኏԰᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 绘图分析显示ᖔ 基因分布