Page 127 - 《广西植物》2023年第8期
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8 期                      王晶等: 阿尔泰银莲花根际土壤微生物多样性研究                                          1 4 6 9

            白(陈国典等ꎬ2020)ꎮ 因此ꎬ本研究对阿尔泰银莲                         将每个样方 5 个采样点的土壤均匀混合为一个样
            花根际土壤微生物群落结构进行探究ꎬ具有较大                              品ꎮ 野生和栽培阿尔泰银莲花根际土壤样品各 3
            的研究价值ꎮ                                             份ꎮ 从采集的土壤中去除残留的根系和碎石ꎮ 随
                 本研究以白云山国家级自然保护区为研究区                           后将土壤样品分为两份ꎬ一份装入无菌 5 mL 的离
            域ꎬ以野生和栽培阿尔泰银莲花为研究对象ꎬ采用                             心管ꎬ将其带回实验室保存在-80 ℃ 冰箱中ꎬ用于
            高通量测序技术对阿尔泰银莲花根际土壤微生物                              后期提取土壤微生物总 DNAꎻ另一份土壤过 2 mm
            群落进行深入研究ꎮ 拟探讨以下问题:(1) 野生和                          筛去除杂质后并风干ꎬ用于测定土壤的理化性质ꎮ

            栽培阿尔泰银莲花根际土壤微生物多样性分析ꎻ                              1.2 土壤理化性质测定
            (2)野生和栽培阿尔泰银莲花根际土壤微生物群                                 参照«土壤农化分析»土壤理化性质的常规方
            落组成及差异分析ꎻ(3)识别影响阿尔泰银莲花根                            法测 定 有 机 质、 pH、 有 效 磷、 碱 解 氮 ( 鲍 士 旦ꎬ
            际土壤微生物的主要驱动因素ꎮ 本研究以期为阿                             2010)ꎮ 土壤 pH 采用玻璃复合电极 pH 计测定ꎻ
            尔泰银莲花科学种植以及土壤改良提供理论依据                              有机质采用重铬酸钾容量法测定ꎻ碱解氮采用培

            和指导ꎮ                                               养皿扩散法测定ꎻ有效磷采用 NaHCO 浸提—钼蓝
                                                                                                 3
                                                               比色法测定(张彧娜等ꎬ2022)ꎮ
            1  材料与方法                                           1.3 土壤微生物总 DNA 提取、PCR 扩增及高通量
                                                               测序
            1.1 研究地点和样品采集                                          根据 FastDNA SPIN Kit for Soil 试 剂 盒 ( MP
                                                                               ®
                 白云山国家级自然保护区(111°48′—112°16′ E、                Biomedicalsꎬ Norcrossꎬ GAꎬ U. S.) 的操作说明ꎬ 从
            33°33′—33°56′ N)位于河南省洛阳市嵩县南部的                      0.5 g 冷冻土壤样品中提取总 DNAꎮ 引物对应区域:
                                           2
            伏牛山腹地ꎬ总面积达 16 800 km ꎬ平均海拔1 800                    细菌 16S rRNA 基 因 的 扩 增 引 物 为 515F ( 5′ ̄
            mꎮ 研究区属于典型的大陆性季风气候ꎬ夏季高温                            GTGCCAGCMGCCGCGGTAA ̄3′)和 806R(5′ ̄GGACT
            多雨ꎬ冬季寒冷干燥ꎬ气温 13.1 ~ 13.9 ℃ ꎬ年均降                    ACHVGGGGTWTCTAAT ̄3′)ꎻ真菌 ITS 区域的扩增
            雨量1 200 mmꎮ 白云山国家级森林公园属于暖温                         引物为 ITS1F(5′ ̄CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA ̄3′)
            带向北亚热带过渡的地段ꎬ南北植物交汇ꎬ植被茂                             和 ITS2R(5′ ̄GCTGCGTTCTTCATCGATGC ̄3′)(Jin et
            盛ꎬ地理景观高度多样化ꎬ为阿尔泰银莲花的生长                             al.ꎬ 2022)ꎮ PCR 扩增程 序 如 下: 95 ℃ 预 变 性 5
            与繁殖创造了良好环境条件ꎮ                                      minꎬ95 ℃变性 30 sꎬ55 ℃退火 30 sꎬ72 ℃延伸 30 sꎬ
                 取样点位于白云山国家级自然保护区ꎬ栽培                           共循环 27 次ꎻ最后在 72 ℃ 下延伸 10 min(严少娟
            阿尔泰银莲花是将根茎剪成 3 ~ 5 cm 小段ꎬ按行株                       等ꎬ2022ꎻ 汪汉成等ꎬ2022)ꎮ 将分离纯化后的 PCR
            间距开 沟、平 栽、覆 土ꎬ植 株 栽 植 密 度 设 置 为 30                 产物进行 DNA 文库的构建ꎬ并利用上海美吉生物医
            cmꎬ种植密度较稀疏ꎮ 栽培阿尔泰银莲花取样地                            药科技有限公司的 Illumina MiSeq 平台进行高通量
            为林下人工管理种质资源圃ꎬ环境无阳光暴晒ꎬ阴                             测序ꎮ
            暗潮湿ꎬ一般不需要浇水ꎮ 人工栽培生境与野生                             1.4 数据处理与分析
            环境相仿ꎬ阿尔泰银莲花均生长于优势种锐齿槲                                  基于 Qiime2( https: / / qiime2. org) 分析平台对
            栎林下ꎬ土壤养分状况基本一致ꎮ 栽培阿尔泰银                             原始数据进行区分并归类ꎬ去除嵌合体ꎬ根据序列
            莲花与野生阿尔泰银莲花的距离大约为 2 kmꎬ其                           相似度(97%)构建操作分类单元(OTUs) ( Yang et
                                                   2           al.ꎬ 2018)ꎮ 为了分析野生和栽培阿尔泰银莲花
            生长年限为 2 ~ 3 年ꎬ栽培面积大约为 1 hm ꎮ
                2021 年 5 月ꎬ分别采集野生和栽培阿尔泰银                       根际微生物群落的差异性ꎬ绘制稀释曲线探究取
            莲花根际土壤ꎬ根际土壤定义为轻轻摇动附着在                              样数据的合理性ꎬ并通过韦恩图、NMDS 分析方法

            植物根部(包括侧根)的土壤ꎮ 随机设置了 3 个 20                        和 Alpha 多样性指数分析土壤微生物群落结构的
            m × 20 m 的重复样方ꎬ每两个样方之间的间隔超                         差异ꎮ
            过 30 mꎮ 在每个样方内利用五点采样法ꎬ随机选                              为了探究野生和栽培阿尔泰银莲花根际土壤
            取每个点附近 5 株以上的阿尔泰银莲花ꎬ使用无                            微生物群落组成ꎬ采用 Circos 图和物种丰度堆积柱
            菌刷子将与根系紧密附着的根际土壤刷掉ꎬ最后                              状图对微生物群落组成进行可视化分析ꎬ并利用
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