Page 127 - 《广西植物》2023年第8期
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8 期 王晶等: 阿尔泰银莲花根际土壤微生物多样性研究 1 4 6 9
白(陈国典等ꎬ2020)ꎮ 因此ꎬ本研究对阿尔泰银莲 将每个样方 5 个采样点的土壤均匀混合为一个样
花根际土壤微生物群落结构进行探究ꎬ具有较大 品ꎮ 野生和栽培阿尔泰银莲花根际土壤样品各 3
的研究价值ꎮ 份ꎮ 从采集的土壤中去除残留的根系和碎石ꎮ 随
本研究以白云山国家级自然保护区为研究区 后将土壤样品分为两份ꎬ一份装入无菌 5 mL 的离
域ꎬ以野生和栽培阿尔泰银莲花为研究对象ꎬ采用 心管ꎬ将其带回实验室保存在-80 ℃ 冰箱中ꎬ用于
高通量测序技术对阿尔泰银莲花根际土壤微生物 后期提取土壤微生物总 DNAꎻ另一份土壤过 2 mm
群落进行深入研究ꎮ 拟探讨以下问题:(1) 野生和 筛去除杂质后并风干ꎬ用于测定土壤的理化性质ꎮ
栽培阿尔泰银莲花根际土壤微生物多样性分析ꎻ 1.2 土壤理化性质测定
(2)野生和栽培阿尔泰银莲花根际土壤微生物群 参照«土壤农化分析»土壤理化性质的常规方
落组成及差异分析ꎻ(3)识别影响阿尔泰银莲花根 法测 定 有 机 质、 pH、 有 效 磷、 碱 解 氮 ( 鲍 士 旦ꎬ
际土壤微生物的主要驱动因素ꎮ 本研究以期为阿 2010)ꎮ 土壤 pH 采用玻璃复合电极 pH 计测定ꎻ
尔泰银莲花科学种植以及土壤改良提供理论依据 有机质采用重铬酸钾容量法测定ꎻ碱解氮采用培
和指导ꎮ 养皿扩散法测定ꎻ有效磷采用 NaHCO 浸提—钼蓝
3
比色法测定(张彧娜等ꎬ2022)ꎮ
1 材料与方法 1.3 土壤微生物总 DNA 提取、PCR 扩增及高通量
测序
1.1 研究地点和样品采集 根据 FastDNA SPIN Kit for Soil 试 剂 盒 ( MP
®
白云山国家级自然保护区(111°48′—112°16′ E、 Biomedicalsꎬ Norcrossꎬ GAꎬ U. S.) 的操作说明ꎬ 从
33°33′—33°56′ N)位于河南省洛阳市嵩县南部的 0.5 g 冷冻土壤样品中提取总 DNAꎮ 引物对应区域:
2
伏牛山腹地ꎬ总面积达 16 800 km ꎬ平均海拔1 800 细菌 16S rRNA 基 因 的 扩 增 引 物 为 515F ( 5′ ̄
mꎮ 研究区属于典型的大陆性季风气候ꎬ夏季高温 GTGCCAGCMGCCGCGGTAA ̄3′)和 806R(5′ ̄GGACT
多雨ꎬ冬季寒冷干燥ꎬ气温 13.1 ~ 13.9 ℃ ꎬ年均降 ACHVGGGGTWTCTAAT ̄3′)ꎻ真菌 ITS 区域的扩增
雨量1 200 mmꎮ 白云山国家级森林公园属于暖温 引物为 ITS1F(5′ ̄CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA ̄3′)
带向北亚热带过渡的地段ꎬ南北植物交汇ꎬ植被茂 和 ITS2R(5′ ̄GCTGCGTTCTTCATCGATGC ̄3′)(Jin et
盛ꎬ地理景观高度多样化ꎬ为阿尔泰银莲花的生长 al.ꎬ 2022)ꎮ PCR 扩增程 序 如 下: 95 ℃ 预 变 性 5
与繁殖创造了良好环境条件ꎮ minꎬ95 ℃变性 30 sꎬ55 ℃退火 30 sꎬ72 ℃延伸 30 sꎬ
取样点位于白云山国家级自然保护区ꎬ栽培 共循环 27 次ꎻ最后在 72 ℃ 下延伸 10 min(严少娟
阿尔泰银莲花是将根茎剪成 3 ~ 5 cm 小段ꎬ按行株 等ꎬ2022ꎻ 汪汉成等ꎬ2022)ꎮ 将分离纯化后的 PCR
间距开 沟、平 栽、覆 土ꎬ植 株 栽 植 密 度 设 置 为 30 产物进行 DNA 文库的构建ꎬ并利用上海美吉生物医
cmꎬ种植密度较稀疏ꎮ 栽培阿尔泰银莲花取样地 药科技有限公司的 Illumina MiSeq 平台进行高通量
为林下人工管理种质资源圃ꎬ环境无阳光暴晒ꎬ阴 测序ꎮ
暗潮湿ꎬ一般不需要浇水ꎮ 人工栽培生境与野生 1.4 数据处理与分析
环境相仿ꎬ阿尔泰银莲花均生长于优势种锐齿槲 基于 Qiime2( https: / / qiime2. org) 分析平台对
栎林下ꎬ土壤养分状况基本一致ꎮ 栽培阿尔泰银 原始数据进行区分并归类ꎬ去除嵌合体ꎬ根据序列
莲花与野生阿尔泰银莲花的距离大约为 2 kmꎬ其 相似度(97%)构建操作分类单元(OTUs) ( Yang et
2 al.ꎬ 2018)ꎮ 为了分析野生和栽培阿尔泰银莲花
生长年限为 2 ~ 3 年ꎬ栽培面积大约为 1 hm ꎮ
2021 年 5 月ꎬ分别采集野生和栽培阿尔泰银 根际微生物群落的差异性ꎬ绘制稀释曲线探究取
莲花根际土壤ꎬ根际土壤定义为轻轻摇动附着在 样数据的合理性ꎬ并通过韦恩图、NMDS 分析方法
植物根部(包括侧根)的土壤ꎮ 随机设置了 3 个 20 和 Alpha 多样性指数分析土壤微生物群落结构的
m × 20 m 的重复样方ꎬ每两个样方之间的间隔超 差异ꎮ
过 30 mꎮ 在每个样方内利用五点采样法ꎬ随机选 为了探究野生和栽培阿尔泰银莲花根际土壤
取每个点附近 5 株以上的阿尔泰银莲花ꎬ使用无 微生物群落组成ꎬ采用 Circos 图和物种丰度堆积柱
菌刷子将与根系紧密附着的根际土壤刷掉ꎬ最后 状图对微生物群落组成进行可视化分析ꎬ并利用