Page 72 - 《广西植物》2023年第8期
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Guihaia Aug. 2023ꎬ 43(8): 1414-1427
DOI: 10.11931/ guihaia.gxzw202304023
吴欣仪ꎬ 王蒙ꎬ 郑希龙ꎬ 等ꎬ 2023. 基于简化基因组测序揭示水角的濒危机制 [J]. 广西植物ꎬ 43(8): 1414-1427.
WU XYꎬ WANG Mꎬ ZHENG XLꎬ et al.ꎬ 2023. RAD ̄seq revealed the endangered mechanism of Hydrocera triflora
(Balsaminaceae)[J]. Guihaiaꎬ 43(8): 1414-1427.
基于简化基因组测序揭示水角的濒危机制
吴欣仪 ꎬ 王 蒙 ꎬ 郑希龙 ꎬ 张 锐 ꎬ 何 松 ꎬ 严岳鸿 1∗
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3
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( 1. 深圳市兰科植物保护研究中心/ 全国兰科植物种质资源保护中心ꎬ 深圳市濒危兰科植物保护与利用重点实验室ꎬ 兰科植物
保护与利用国家林业和草原局重点实验室ꎬ 广东 深圳 518114ꎻ 2. 广东药科大学 中药资源学院ꎬ 广州 510006ꎻ
3. 中国科学院上海辰山植物科学研究中心ꎬ 上海 201602ꎻ 4. 海口市湿地保护管理中心ꎬ 海口 570135 )
摘 要: 物种的遗传多样性是决定物种适应性和生存能力的关键因素ꎮ 生境片段化是造成生物多样性丧失
的重要因素之一ꎬ对植物种群的遗传多样性有着重要影响ꎮ 水角(Hydrocera triflora) 作为一种濒危植物ꎬ其
遗传多样性状况和濒危机制尚未有报道ꎮ 该文收集了水角 7 个种群共计 34 个样本ꎬ利用简化基因组测序
技术(RAD ̄seq)获得了单核苷酸变异位点(SNP)ꎮ 通过种群遗传多样性和遗传结构的分析ꎬ并结合种群历
史动态分析和不同气候情景下物种潜在分布区预测ꎬ探讨了水角的濒危机制ꎮ 结果表明:(1)水角遗传多样
性较低(H = 0.156 9、H = 0.165 4、π = 0.186 5)ꎬ遗传分化系数较高ꎻAMOVA 分析表明ꎬ遗传变异主要发生
o e
在种群内ꎮ (2)Mantel 检测表明环境距离与遗传距离、地理距离均呈显著正相关ꎬ分别为 P = 0.041 2 和 P =
0.008 2ꎮ (3)水角的有效种群大小从全新世中期开始持续下降ꎬ与琼北火山群的喷发时间一致ꎮ (4) 与当
代气候相比ꎬ虽然在未来气候变化下水角的潜在分布区总面积变动不大ꎬ但在高 CO 排放的情景下ꎬ大量的
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高适生区将会丧失并转化为低适生区ꎬ特别是位于马来群岛的适生区几乎完全消失ꎮ 该研究结果表明ꎬ生
境片段化导致了水角较低的遗传多样性和有效种群大小的持续下降ꎮ 因此ꎬ自身更新能力低以及人为活动
干扰、城市化等不利的环境条件是导致其濒危的主要原因ꎮ 建议加强对水角的就地保护ꎬ采用人工授粉等
方法提高其基因流以增加其种群的遗传多样性ꎬ同时ꎬ要着重保护湿地免遭破坏ꎮ
关键词: 生境片段化ꎬ 简化基因组测序ꎬ 遗传多样性ꎬ 遗传结构ꎬ 物种分布模型ꎬ 种群历史动态
中图分类号: Q943 文献标识码: A 文章编号: 1000 ̄3142(2023)08 ̄1414 ̄14
RAD ̄seq revealed the endangered mechanism
of Hydrocera triflora (Balsaminaceae)
1 1 2 3 4 1∗
WU Xinyi ꎬ WANG Meng ꎬ ZHENG Xilong ꎬ ZHANG Rui ꎬ HE Song ꎬ YAN Yuehong
( 1. Orchid Conservation & Research Center of Shenzhen / National Orchid Conservation Center of Chinaꎬ Shenzhen Key Laboratory for Orchid
Conservation and Utilizationꎬ Key Laboratory of National Forestry and Grassland Administration for Orchid Conservation and Utilizationꎬ
Shenzhen 518114ꎬ Guangdongꎬ Chinaꎻ 2. School of Traditional Chinese Medicine Resourcesꎬ Guangdong Pharmaceutical Universityꎬ
Guangzhou 510006ꎬ Chinaꎻ 3. Shanghai Chenshan Plant Science Research Centerꎬ Chinese Academy of Sciencesꎬ Shanghai
201602ꎬ Chinaꎻ 4. Haikou Wetland Protection and Management Centerꎬ Haikou 570135ꎬ China )
收稿日期: 2023-07-06
基金项目: 海口市林业局项目(HNJC2019 ̄0801)ꎻ 中国科学院战略性先导科技专项(A 类)(XDA19050404)ꎮ
第一作者: 吴欣仪(1991-)ꎬ硕士ꎬ工程师ꎬ研究方向为种群遗传学ꎬ(E ̄mail)460774031@ qq.comꎮ
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通信作者: 严岳鸿ꎬ博士ꎬ研究员ꎬ研究方向为植物多样性与保护ꎬ(E ̄mail)yhyan@ sibs.ac.cnꎮ