Page 54 - 广西植物2024年1期
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５ ０ 广 西 植 物 ４４ 卷
Ａ. 叶绿体基因组中不同类型简单重复序列的数量ꎻ Ｂ. 在叶绿体基因组的编码区(ＣＤＳ)、基因间隔区(ＩＧＳ) 和内含子中识别的
ＳＳＲｓ 数量ꎮ
Ａ. Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｔｙｐｅｓ ｏｆ ＳＳＲｓ ｉｎ ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓꎻ Ｂ. Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ＳＳＲｓ ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ ｉｎ ｃｏｄｉｎｇ ｓｅｑｕｅｎｃｅ (ＣＤＳ)ꎬ ｉｎｔｅｒｇｅｎｉｃ ｓｐａｃｅｒ
(ＩＧＳ) ａｎｄ ｉｎｔｒｏｎｓ ｉｎ ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ.
图 ３ 龙头兰和景洪白蝶兰叶绿体基因组的简单重复序列
Ｆｉｇ. ３ Ｓｉｍｐｌｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｒｅｐｅａｔｓ (ＳＳＲｓ) ｉｎ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ Ｐｅｃｔｅｉｌｉｓ ｓｕｓａｎｎａｅ ａｎｄ Ｐ. ｈａｗｋｅｓｉａｎａ
龙头兰和景洪白蝶兰都包含 １１１ 个唯一基因ꎬ包括
７７ 个 蛋 白 质 编 码 基 因、 ３０ 个 ｔＲＮＡ 基 因 和 ４ 个
ｒＲＮＡ 基因ꎬＧＣ 含量分别为 ３６.５％和 ３６.６％ꎮ 在兰
科植物叶绿体基因组中编码ＮＡＤ(Ｐ)Ｈ脱氢酶复合
体的 ｎｄｈ 基因截短或丢失的现象较为多见ꎬ但在红
门兰亚科中很少发生(Ｋｉｍ ｅｔ ａｌ.ꎬ２０２０)ꎮ 丝瓣玉凤
花的叶绿体基因组中具有 １１ 个 ｎｄｈ 基因( Ｌｉｎ ｅｔ
ａｌ.ꎬ２０１５)ꎬ本研究中龙头兰和景洪白蝶兰的叶绿体
基因组中也包含了完整基因结构的 １１ 个 ｎｄｈ 基因ꎬ
图 ４ 龙头兰和景洪白蝶兰的核苷酸替代模式 没有截短和丢失的现象ꎮ
３.２ 特异分子鉴定标记的筛选
Ｆｉｇ. ４ Ｐａｔｔｅｒｎｓ ｏｆ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏｎｓ ａｍｏｎｇ
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ｐｅｃｔｅｉｌｉｓ ｓｕｓａｎｎａｅ 本研究通过基因组的比较研究ꎬ在 ２ 种白蝶兰
ａｎｄ Ｐ. ｈａｗｋｅｓｉａｎａ 属植物中鉴定出的 ＳＳＲｓ、ＩｎＤｅｌｓ 和核苷酸序列高
变区等均可作为特异的分子标记鉴定物种ꎮ 本研
分体结构ꎬ它们的长度、基因组结构、基因数目、ＧＣ 究发现龙头兰叶绿体基因组中共有 ９４ 个 ＳＳＲｓꎬ景
含量等均与以前报道的红门兰族物种的基因组特 洪白蝶兰叶绿体基因组中共有 ９２ 个 ＳＳＲｓꎬ二者在
征相似ꎮ 已报道的 Ｈ. ｃｒｕｃｉｆｏｒｍｉｓ、狭叶白蝶兰等物 ＳＳＲｓ 数量上仅相差 ２ 个ꎮ 龙头兰不存在五核苷酸
种的叶绿体基因组均编码了 １１３ 个唯一基因ꎬ包括 重复序列ꎬ景洪白蝶兰有 １ 个五核苷酸重复ꎮ 已
７９ 个蛋白质编码基因、３０ 个 ｔＲＮＡ 和 ４ 个 ｒＲＮＡꎬＧＣ 报道的同属狭叶白蝶兰中共检测到 ７６ 个 ＳＳＲｓ 位
含量为 ３６.６％(Ｋｉｍ ｅｔ ａｌ.ꎬ２０１７ꎬ２０２０)ꎻ在本研究中ꎬ 点ꎬ包括 ５８ 个单核苷酸 ＳＳＲｓ、１７ 个二核苷酸 ＳＳＲｓ
