Page 57 - 《广西植物》2024年第12期
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12 期 薛晶晶等: 木薯糖转运蛋白基因 MeSWEET17b 的克隆及表达分析 2 2 1 5
使用说明书进行ꎮ 将 cDNA 稀释 10 倍作 为 RT ̄ 表 1 引物序列
qPCR 分析的模板ꎮ 10 μL 反应体系包含 1 μL 模 Table 1 Primer sequence
板、5 μL 2 × SYBR Green qPCR Mix、 0. 8 μL 10 名称 序列
μmol L MeSWEET17b ̄qPCR 引 物、灭 菌 水 补 足 Name Sequence
 ̄1
MeActin ̄F 5′ ̄TGATGAGTCTGGTCCATCCA ̄3′
10 μLꎮ PCR 反应程序:95 ℃ 预变性 30 sꎬ95 ℃ 10
s、60 ℃ 20 s 共 40 个循环ꎬ循环完成后进行产物熔 MeActin ̄R 5′ ̄CCTCCTACGACCCAATCTCA ̄3′
-△△Ct MeSWEET17b ̄F 5′ ̄TTGGGCAGGAAAGAAAATCAAT ̄3′
解曲线分析ꎮ 以 MeActin 作为内参基因ꎬ以 2
算法进行基因的相对定量表达分析ꎮ MeSWEET17b ̄R 5′ ̄GTTCTCTTCAATAACGTCTTCC ̄3′
1. 2. 6 MeSWEET17b 的 糖 转 运 特 性 分 析 EBY. 5′ ̄GAGAACACGGGGGACTATGGAAA
MeSWEET17b ̄gfp ̄F
VW4000 酵母是一种己糖转运功能缺陷型酵母突 TCTTGAGTTTG ̄3′
变体ꎬ此 菌 株 无 法 在 己 糖 为 唯 一 碳 源 的 尿 嘧 啶 MeSWEET17b ̄gfp ̄R 5′ ̄AAAGTTCTTCTCCTTTTTAATTATT
AATTTCATG ̄3′
(ura)缺陷型选择培养基 SD ̄ura 平板上生长ꎬ可以
MeSWEET17b ̄qPCR ̄F 5′ ̄ACTCTCTTCCTTGTATATGCACCAC ̄3′
在麦芽糖为唯一碳源的选择培养基 SD ̄ura 平板上
MeSWEET17b ̄qPCR ̄R 5′ ̄CTAGAGGCGAACCATACATAACAAT ̄3′
恢复生长ꎮ 将 MeSWEET17b 的 CDS 序列构建到酵
5′ ̄ATATACCCCAGCCTCGATGGAAATC
母 功 能 穿 梭 载 体 pDR196 ( 表 1 ) 上ꎬ 使 用 MeSWEET17b ̄pdr196 ̄F TTGAGTTTG ̄3′
TM Yeast Transformation System 2 kit 酵母
Yeastmaker 5′ ̄CGATAAGCTTGATATC TTAATTATT
MeSWEET17b ̄pdr196 ̄R
转化试剂盒(Clontech) 的聚乙二醇 / 醋酸锂高效酵 AATTTCATG
母转化法将重组后的 MeSWEET17b ̄pDR196 质粒
转化到 EBY. VW4000 酵母菌中ꎮ 在选择培 养 基 1: A) ꎬ蛋白分子质量为 26.32 kDaꎬ理论等电点为
SD ̄ura + 2% 麦芽糖平板上划线培养ꎬ倒置于 30 7.72ꎬ不稳定系数为 40.54ꎬ属于不稳定类蛋白ꎮ 通
℃ 培养箱中培养 3 ~ 5 dꎮ 挑单菌落放入 SD ̄ura + 过 NCBI 在线软件 CDD 分析发现ꎬ该蛋白 N 端含
2%麦芽糖液体培养基中过夜摇菌 (30 ℃ ꎬ220 r 有 MtN3 _ slv 蛋 白 结 构 域ꎬ 含 有 2 个 PQ ̄loop
 ̄1
min )ꎮ 待 OD 为 1 左右时ꎬ停止摇菌ꎮ 取 1 mL superfamilyꎮ TMHMM Server v.2.0 在线软件预测显
600
菌液加入 1.5 mL 无菌离心管中ꎬ室温下ꎬ高速离 示ꎬ该蛋白含有 7 个跨膜结构域ꎬ是典型的膜蛋白
心 15 sꎬ收集菌体ꎬ弃上清ꎮ 加入 1 mL 无菌超纯 (图 1: B)ꎻProtScale 预测表明ꎬMeSWEET17b 蛋白
水ꎬ重悬菌体ꎬ再次高速离心 15 sꎬ收集菌体ꎬ弃上 属于疏水性蛋白 ( 图 1: C)ꎻSOPMA 分 析 显 示ꎬ
清ꎮ 如此清洗重悬 2 ~ 3 次菌体ꎬ尽量降低液体培 MeSWEET17b 蛋 白 二 级 结 构 由 49. 79% α ̄螺 旋、
养基的影响ꎮ 取 4 μL 菌液为×1 倍ꎬ依次稀释×10 27.39% 延伸链、4.56%β ̄转角和 18.26%无规则卷
倍、×100 倍、×1 000 倍和×10 000 倍ꎬ均匀点涂到 曲组成ꎮ
施加不同唯一碳源的 SD ̄ura 选择培养基上 ( SD ̄ 2.2 MeSWEET17b 的系统进化树分析及氨基酸序
ura + 2% 麦 芽 糖、 SD ̄ura + 2% 葡 萄 糖、 SD ̄ura + 列比对
2%果糖、SD ̄ura + 2%蔗糖)ꎬ倒置 30 ℃ 培养箱培 对木薯糖转运蛋白 SWEETs 和拟南芥 SWEET
养 3 ~ 5 dꎬ观察生长情况ꎮ 蛋白进行系统进化树分析ꎬ发现 MeSWEET17b 与
1.2.7 分析方法及数据处理 采用 Excel 2021 分析 拟南芥 AtSWEET16 和 AtSWEET17 位于同一进化
数据ꎬGraphPad Prism 5.0 软件作图以及 Dunnetts 枝上ꎬ属于第四亚类( Clade Ⅳ) ( 图 2: A)ꎮ 采用
检验ꎮ DNAMAN 软 件 对 MeSWEET17b、 AtSWEET16 和
AtSWEET17 氨 基 酸 序 列 进 行 比 对ꎬ 结 果 显 示
2 结果与分析 MeSWEET17b 和 AtSWEET16 的 同 源 性 达 到
51.24%ꎬMeSWEET17b 和 AtSWEET17 的同源性达
2.1 MeSWEET17b 基因全长 CDS 克隆及蛋白质结 到 53.72%ꎬ含有两个明显的 PQ ̄loop superfamily 结
构特性分析 构(图 2: B)ꎮ
通过 RT ̄PCR 扩增及测序ꎬ获得 MeSWEET17b 2.3 MeSWEET17b 的亚细胞定位
基因编码框序列 726 bpꎬ 编码 242 个氨基酸 ( 图 将 35S∷GFP 和 35S∷MeSWEET17b ̄GFP 重