Page 92 - 《广西植物》2024年第7期
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表 1 qRT ̄PCR 引物序列
Table 1 Primer sequences of qRT ̄PCR
基因 上游引物 (5′ ̄3′) 下游引物 (5′ ̄3′)
Gene Forward primer (5′ ̄3′) Reverse primer (5′ ̄3′)
Gmβ ̄Tubulin GGAAGGCTTTCTTGCATTGGTA AGTGGCATCCTGGTACTGC
GmEXPB5 GCTCCCTTCCTCTTGTTTCAATCCC CAAGCACCACCTTCACTTCCATCC
GmEXPB7 GAAGGGTGTGGTGCGTGCTAC AGATCGAAGTGTGTTTGGTCAGAGG
表 2 大豆 GmEXPB5 和 GmEXPB7 基本信息及特征
Table 2 Basic information and characteristics of soybean GmEXPB5 and GmEXPB7
氨基酸数 分子量
染色体位置 等电点 不稳定系数 亲水性指数 亚细胞定位
基因 Number of Molecular
Chromosome Isoelectric Instability Hydrophilic Subcellular
Gene amino acids weight
location point index index localization
(aa) (kD)
GmEXPB5 chr10 272 29.07 7.51 29.28 -0.013 细胞壁
Cell wall
GmEXPB7 chr12 267 29.09 8.66 31.08 -0.132 细胞壁
Cell wall
氨基酸ꎮ GmEXPB5 蛋白分子量为 29.07 kDꎬ理论 它们 位 于 GmEXPB5 蛋 白 序 列 N 端ꎻ Motif 8 和
等 电 点 为 7. 51ꎻ GmEXPB7 蛋 白 分 子 量 为 29. 09 Motif 6 为 GmEXPB7 蛋白所特有ꎬ它们同样也位于
kDꎬ理论等电点为 8.66ꎮ GmEXPB5 和 GmEXPB7 GmEXPB7 蛋白序列 N 端ꎮ
蛋白的不稳定系数均小于 40ꎬ亲水性指数均为负 2.1.3 植物 EXPB 蛋白系统进化分析 将 16 种植
值ꎬ表明它们均为稳定的亲水蛋白ꎮ 亚细胞定位 物中的 36 个 EXPB 蛋白构建系统进化树ꎮ 由图 3
预测结果显示ꎬGmEXPB5 和 GmEXPB7 蛋白均定 可知ꎬGmEXPB5 蛋白与鹰嘴豆 CaEXPB15 蛋白亲
位于细胞壁中ꎮ 缘关系最近ꎬGmEXPB7 蛋白则与密花豆、赤豆和豇
2.1.2 GmEXPB5 和 GmEXPB7 蛋白保守结构域及 豆的 EXPB3 蛋白有着较高的亲缘关系ꎮ 此外ꎬ除拟
保守基 序 ( Motif) 分 析 GmEXPB5 和 GmEXPB7 南芥外其他双子叶植物 EXPB1 蛋白均处于同一分
蛋白的氨基酸序列如图 1 所示ꎬ它们的同源性为 支ꎬ说明同一基因在不同物种中仍具有较高同源
45.79%ꎮ 在 GmEXPB5 和 GmEXPB7 蛋白序列的 性ꎬ但相同植物中的 EXPB 蛋白则存在较大差异ꎬ如
N 端均含有一段信号肽序列[GmEXPB5(第 1 到第 GmEXPB5 蛋白和 GmEXPB7 蛋白亲缘关系较远ꎮ
29 位氨 基 酸)ꎻ GmEXPB7 ( 第 1 到 第 31 位 氨 基 2.2 GmEXPB5 和 GmEXPB7 在大豆根、茎和叶中
酸)]ꎬ它们能够引导 EXPB 蛋白定位于细胞壁ꎮ 的表达分析
此外ꎬGmEXPB5 和 GmEXPB7 蛋白均含有一个保 qRT ̄PCR 结 果 ( 图 4 ) 显 示ꎬ GmEXPB5 和
守的由 81 个氨基酸残基组成的 DPBB_1 结构域 GmEXPB7 在大豆根、茎和叶中均有表达ꎬ但它们
[GmEXPB5(第 83 到第 163 位氨基酸)ꎻGmEXPB7 在根和叶中的表达量显著高于茎中的表达量ꎮ
(第 78 到第 158 位氨基酸)]ꎬ此结构域是 EXP 家 2.3 GmEXPB5 和 GmEXPB7 非生物胁迫表达分析
族蛋白的共有结构域ꎮ 对大豆幼苗分别进行盐、干旱和低温胁迫处
蛋白保守基序( Motif) 分析结果如图 2 所示ꎬ 理ꎮ qRT ̄PCR 检测结果如图 5 所示ꎬ盐胁迫处理
GmEXPB5 和 GmEXPB7 蛋白共含有 10 个 Motifꎮ 后ꎬGmEXPB5 的表达量先升高ꎬ处理 1 h 时达到最
其中ꎬ Motif 3、 Motif 1、 Motif 5、 Motif 2、 Motif 7 和 大值ꎬ为对照 0 h 表达量的 6.9 倍ꎬ之后下降ꎬ处理
Motif 4 为 GmEXPB5 和 GmEXPB7 蛋白共有ꎬ并且 24 h 时 与 对 照 0 h 时 的 表 达 量 已 无 明 显 差 异ꎻ
它们在两个蛋白序列中的分布位置和顺序基本相 GmEXPB7 的表达量在处理后的 1、5、24 h 时均显
同ꎻMotif 10 和 Motif 9 为 GmEXPB5 蛋白所特有ꎬ 著高于对照 0 h 时的表达量且 24 h 时的表达量达