Page 9 - 《广西植物》2023年第6期
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6 期 张镇梁等: 管叶槽舌兰新鲜及硅胶干燥根样内生菌多样性研究 9 9 5
d)ꎮ 在 2 个分组中变形菌门丰度均占绝对优势ꎮ 菌群落的丰富度和多样性ꎬ对 2 组样品内生菌群
相比较而言ꎬ干燥后管叶槽舌兰根样内生细菌类群 落的 α 多 样 性 进 行 比 较 分 析ꎬ 包 括 Chao 1、
数量同样变多ꎬ经硅胶干燥后ꎬ占主要优势的变形 Shannon、Simpson 等指数ꎬChao 1 是计算群落中含
菌门、厚壁菌门、放线菌门细菌相对丰度均有明显 OTU 数目的指数ꎬ常用来指示群落物种丰富度ꎬ
提高(图 1:d)ꎮ 管叶槽舌兰根内生细菌经硅胶干燥 Shannon 和 Simpson 是综合考虑样本中物种的丰富
后在科水平(图 1:e)的相对丰度发生了改变ꎬ鞘脂 度与均匀度指数ꎬ用来表示群落多样性ꎮ 经分析
单胞菌科 ( Sphingomonadaceae)、 拜叶林克氏菌科 发现ꎬ新 鲜 管 叶 槽 舌 兰 根 样 中 内 生 真 菌 群 落 的
(Beijerinckiaceae)、肠杆菌科 ( Enterobacteriaceae)、 Chao 1 指 数、 Shannon 指 数、 Simpson 指 数 分 别 为
红 杆 菌 科 ( Rhodobacteraceae )、 黄 色 杆 菌 科 39.797、3.070、0.723ꎻ硅胶干燥后管叶槽舌兰根样
( Xanthobacteraceae )、 假 单 胞 菌 科 中的内生真菌群落的 Chao 1 指数、Shannon 指数、
(Pseudomonadaceae)、瘤胃菌科(Ruminococcaceae)、 Simpson 指数分别为62.348、3.715、0.785ꎮ 新鲜管
根瘤菌科(Rhizobiaceae)等占比均明显升高ꎬ而伯克 叶槽舌兰根样中内生真菌群落的 Chao 1 指数明显
氏菌科( Burkholderiaceae) 在干燥后明显降低ꎮ 在 低于硅胶干燥后管叶槽舌兰根样中的内生真菌群
属水平上(表 1ꎬ图 1:f)ꎬ管叶槽舌兰根内生细菌的 落ꎬ新鲜管叶槽舌兰根样中内生真菌群落 Shannon
相对丰度发生了改变ꎬ鞘氨醇菌属(Sphingomonas)、 指数、Simpson 指数略低于硅胶干燥后管叶槽舌兰
假 单 胞 菌 属 ( Pseudomonas )、 肠 杆 菌 属 根样中的内生真菌群落ꎬ水平相当ꎮ t ̄test 检验表
(Enterobacter)、慢生根瘤菌属( Bradyrhizobium)、副 明ꎬ干燥前后 3 个 α 多样性指数均无显著性差异ꎮ
球菌属(Paracoccus)和泛菌属(Pantoea)在干燥后丰 这表明硅胶干燥前后管叶槽舌兰根样中的内生真
度明显升高ꎬ而马赛菌属(Massilia)在干燥后明显降 菌群落多样性水平相当ꎬ但干燥后物种数量明显
低ꎮ 从排名前 15 的硅胶干燥处理前后管叶槽舌兰 变多ꎮ 新鲜管叶槽舌兰根样中内生细菌群落的
根内生细菌属水平绝对丰度值变化表中可以看出 Chao 1 指 数、 Shannon 指 数、 Simpson 指 数 分 别 为
马赛菌属和 Rubrobacter 在干燥后丰度值降低ꎬ其余 524.492、7.103、0.976ꎻ硅胶干燥后管叶槽舌兰根
属如鞘氨醇菌属、假单胞菌属、肠杆菌属、泛菌属和 样中的内生细菌群落的 Chao 1 指数、Shannon 指
分支杆菌属(Mycobacterium)等经干燥后丰度值都明 数、Simpson 指数分别为 321.154、6.543、0.973ꎮ 经
显增加ꎬ这与管叶槽舌兰根内生细菌在属水平的相 硅胶干燥后管叶槽舌兰根样中的内生细菌群落
对丰度变化趋势相似ꎮ Chao 1 指数远低于新鲜管叶槽舌兰根样中内生细
根据 OTUs 聚类结果ꎬ绘制 OTUs 韦恩图( 图 菌群落ꎮ 新鲜管叶槽舌兰根样中内生细菌群落
1:h)ꎬ结果显示新鲜管叶槽舌兰根样中内生细菌 Shannon 指数、Simpson 指数高于硅胶干燥后管叶
特 有 的 OTUs 有 751 个ꎬ 主 要 是 蓝 藻 门 ( 33 个 槽舌兰根样中的内生细菌群落ꎮ t ̄test 检验表明ꎬ
OTUs)ꎻ而经硅胶干燥后根样中内生细菌有 579 个 干 燥 前 后 3 个 α 多 样 性 指 数 除 了 Chao 1 指 数
特有 OTUsꎬ主要隶属于厚壁菌门(100 个 OTUs)ꎻ2 (P = 0.008)外其他均无显著性差异ꎮ 这表明硅
t ̄test
个分 组 共 有 的 OTUs 有 532 个ꎬ 其 中 有 127 个 胶干燥后管叶槽舌兰根样中的内生细菌群落物种
OTUs 属于变形菌门ꎬ50 个 OTUs 属于蓝藻门ꎬ36 数量和多样性明显减少ꎮ 这一结果与管叶槽舌兰
个 OTUs 属于厚壁菌门ꎬ13 个 OTUs 属于拟杆菌 根样内生真菌群落的正好相反ꎮ
门ꎬ1 个 OTUs 属于酸杆菌门ꎬ1 个 OTUs 属于螺旋 为研究新鲜与干燥管叶槽舌兰根样中的内生
体门ꎮ 通过结果分析表明ꎬ相对于真菌来说ꎬ管叶 菌群落的差异程度ꎬ对 2 组样品内生菌群落的 β
槽舌兰拥有更为丰富的内生细菌类群ꎬ同内生真 多样性进行比较分析ꎮ 基于 Weighted Unifrac 的 β
菌一样ꎬ经硅胶干燥后ꎬ其内生细菌群落在丧失掉 多样性分析发现ꎬ新鲜管叶槽舌兰根样中内生真
新鲜根样中的一些细菌类群的同时产生了相当数 菌的 β 多样性高于硅胶干燥后管叶槽舌兰根样中
量的新的细菌类群ꎬ丧失的细菌主要隶属于蓝藻 内生 真 菌 群 落 的ꎻ 而 内 生 细 菌 基 于 Weighted
门ꎬ而新产生了大量的厚壁菌门ꎮ Unifrac 的 β 多样性分析发现ꎬ硅胶干燥后管叶槽
2.2 内生菌群落多样性差异分析 舌兰根样中内生细菌群落的 β 多样性要高于新鲜
为对比新鲜与干燥管叶槽舌兰根样中的内生 管叶槽舌兰根样中内生细菌的ꎬt ̄test 检验发现ꎬ干