Page 195 - 《广西植物》2024年第5期
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5 期 赵淑丽等: 根肿菌侵染下菘蓝生物碱合成机制 9 8 3
固定 24 hꎻ再将组织从 FAA 固定液中取出并切成
1 材料与方法 薄片ꎻ于台盼蓝染液中染色 2 minꎬ染色后用去离
子水(ddH O)洗去残留的染液ꎬ清洗 2 ~ 3 次ꎻ染上
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1.1 材料 色的根组织薄片放在载玻片上进行显微观察ꎮ
供试菌株和菘蓝品种:菌株采自昆明市盘龙 1.3.2 生理指标的测定 小叶菘蓝叶片生理指标
区阿子营乡的大白菜发病根瘤ꎬ经云南省农业科 的测定主要参照高俊凤(2006) 和王文龙(2014)
学院鉴定为 4 号生理小种( Williams 鉴定系统)ꎮ 的方法ꎬ具体如下:(1) 硫代巴比妥酸显色法检测
实验所需小叶菘蓝种子由云南省农业科学院园艺 MDAꎻ(2)考马斯亮蓝 G ̄250 染色法检测可溶性蛋
作物研究所的十字花科课题组张丽琴老师提供并 白ꎻ(3) 愈创木酚比色法检测 PODꎻ(4) 氮蓝四唑
鉴定ꎮ 光还原 法 检 测 SODꎻ ( 5) 邻 苯 二 酚 法 检 测 PPOꎻ
试剂及仪器:台盼蓝溶液( SIGMA)、甲醛-醋 (6)紫外分光光度法检测 CATꎮ
酸-乙醇固定液(50%)ꎻ牛血清蛋白、核黄素、愈创 1.3.3 UPLC ̄MS / MS 测定
木酚、2-硫代巴比妥酸ꎬ北京索莱宝科技有限公 1.3.3.1 样品制备 将小叶菘蓝的根及根茎放置于
司ꎻ邻苯二酚、三氯乙酸溶液、L ̄甲硫氨酸ꎬ上海麦 冻干机( Scientz ̄100F) 中真空冷冻干燥后研磨ꎻ称
克林 生 化 科 技 有 限 公 司ꎻ 氯 化 硝 基 四 氮 唑 蓝 取 50 mg 的粉末ꎬ加入 70% 甲醇(1.2 mL)ꎬ30 min
(NBT)、乙二胺四乙酸 EDTAꎬ德国 Biofroxx 生物试 涡旋 1 次(每次 30 sꎬ共 6 次)ꎻ12 000 rmin ꎬ离
 ̄1
剂ꎻ过 氧 化 氢 ( 30%)ꎬ 云 南 景 锐 科 技 有 限 公 司ꎮ 心 3 min 后ꎬ0.22 μm 微孔滤膜将上清液过滤在进
Nikon 数码显微镜ꎬ血球计数板ꎬ育苗盘ꎬ普析 TU ̄ 样瓶中ꎬ用于后续实验ꎮ
1810 紫外可见分光光度计ꎬ超低温冷冻离心机ꎬ光 1.3.3.2 色谱质谱条件 ExionLC TM AD 超高效液相
照培养箱ꎬ台式鼓风干燥箱ꎬ电热恒温水浴锅ꎬ千 色谱 ( https: / / sciex. com. cn / )ꎬ Applied Biosystems
分之一电子天平ꎬ托盘天平ꎬ冷冻冰箱等ꎮ 4500 QTRAP 串 联 质 谱 ( https: / / sciex. com. cn / )ꎮ
1.2 实验处理 液相色谱条件:色谱柱为 SB ̄C (1.8 μmꎬ2.1 mm ×
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将冷冻的大白菜发病根瘤置于室温解冻ꎬ采 100 mmꎬAgilent)ꎻ0.1%甲酸的超纯水(A) 与 0.1%
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用杨佩文等(2002) 的方法提取根肿菌休眠孢子ꎬ 甲酸乙腈( B) 为流动相ꎬ流速为 0.35 mLmin ꎻ
血球计数板测定根肿菌孢子悬浮液的浓度ꎬ稀释 洗脱梯度(B 相比例)为 0.00 minꎬ5%ꎬ9.00 min 内
成 5×10 CFUmL 的病原菌菌液备用ꎮ 小叶菘 线性增加 至 95%ꎬ并 维 持 在 95% 1 minꎬ10. 00 ~
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 ̄1
蓝于 72 孔育苗盘中栽培ꎬ1 个穴播种 3 颗种子ꎬ待 11.10 minꎬ95% ~ 5%ꎬ11.10 ~ 14.00 minꎬ5%ꎻ进样
其长出 2 ~ 3 对真叶后间苗ꎬ注射法 进 行 根 肿 菌 量 4 μLꎻ柱温为 40 ℃ ꎮ 质谱条件:电喷雾离子源ꎻ
(1×10 CFUmL 的休眠孢子)接种ꎬ用 10 mL 注 电压为+5 500 / -4 500 Vꎻ温度为 550 ℃ ꎻ离子源
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射器吸取菌液ꎬ将菌液缓慢注射到实验苗根部ꎬ每 气体 I、气体Ⅱ及气帘气分别设置为 50、60、25 psiꎻ
株 2 mL 菌液ꎮ 分别在接种根肿菌后 0、7、14、21 d 碰撞诱导电离参数设置为高ꎮ
采 集 正 常 生 长 ( BLG ̄CK1、 BLG ̄CK2、 BLG ̄CK3、 OPLS ̄DA 模型 中 的 VIP 值 结 合 差 异 倍 数 值
BLG ̄CK4) 和接种根肿菌( BLG ̄S1、BLG ̄S2、BLG ̄ fold change 来筛选差异代谢物ꎮ 筛选标准:符合
S3、BLG ̄S4)的小叶菘蓝根部( 根及根茎) 和叶子 VIP ≥ 1、fold change ≥ 1.5 和 fold change ≤ 0.67
(Lan et al.ꎬ 2019)ꎬ3 个生物学重复ꎬ并液氮冷冻ꎬ 的代谢物具有显著差异ꎮ
-80 ℃ 储存ꎮ 1.3.4 RNA 提取和文库构建 RNA 提取与测序由
1.3 方法 武汉 迈 维 代 谢 有 限 公 司 完 成ꎮ 采 用 Illumina 的
1.3.1 病情形态分级和组织学观察 病情分级参 NEBNext UltraTM RNA Library Prep Kit 试剂盒提
®
照农业部公益性行业科研专项(201003029) 制定 取 total RNAꎮ 琼脂糖凝胶电泳和 Nano Photometer
的标准( 杨华等ꎬ2014)ꎮ 接种根肿菌后根据病情 分光光度计检测 RNA 完整性和纯度ꎮ 最终达标
形态分级每 24 h 观察根肿情况并取小叶菘蓝根部 的样品用于构建小叶菘蓝 cDNA 文库ꎮ
进行组织学观察ꎬ连续观察 21 dꎮ 将小叶菘蓝根 1.3.5 转录组测序、分析及注释 利用 Illumina 对
部洗干净ꎬ取地下 1 ~ 2 cm 于 FAA 固定液中至少 小叶菘蓝根及根茎转录组文库进行高通量测序ꎮ