Page 87 - 《广西植物》2023年第6期
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6 期 苏桂军等: 花生铝响应类受体蛋白激酶 AhPRK4 的原核表达分析 1 0 7 3
NCBI Conserved Domain 预测 AhPRK4 蛋白的保守结
构域 ( https:/ / www. ncbi. nlm. nih. gov/ Structure/ cdd/ 2 结果与分析
wrpsb.cgi)ꎮ 对于目的蛋白的跨膜域以及信号肽分析
分别通过在 线 网 站 TMHMM 2. 0 ( http:/ / www. cbs. 2.1 AhPRK4 在不同铝处理时间、浓度下的表达
dtu. dk/ services/ TMHMM/ ) 和 SignalP 4. 1 server 由图 1:A 可知ꎬ‘ZH2’ 和‘99 ̄1507’ 经铝处理
(http:/ / www.cbs.dtu.dk/ services/ SignalP ̄4.1/ )完成ꎬ 不同时间后ꎬ与对照相比ꎬAhPRK4 的表达量均上
同时对 AhPRK4 的磷酸化位点以及互作蛋白进行 升ꎬ但两个花生品种中 AhPRK4 的表达趋势有所差
了预测ꎬ磷酸化预测软件为 iGPS 1.0ꎬ互作蛋白预 异ꎬ‘ZH2’中ꎬAhPRK4 在 4 h 的表达量最高ꎬ8 h 的
测网 站 为 STRING(https:/ / stringdb.org/ cgi/ input.pl? 表达量最低ꎬ随后表达量则一直增加ꎮ ‘99 ̄1507’
sessionId = K7gDcPsKo9E0&input _page _active _form = 中ꎬAhPRK4 表达量则先增加后降低ꎬ在 12 h 达到
single _ sequence )ꎮ AhPRK4 启 动 子 元 件 预 测 于 最高ꎮ 由图 1:BꎬC 可知ꎬ在经不同铝浓度处理 4 h
PlantCARE 在 线 网 站 进 行 ( http:/ / bioinformatics. 和 8 h 后ꎬ发现在两个花生品种中 AhPRK4 的表达
psb.ugent.be/ webtools/ plantcare/ html/ )ꎮ 量随着处理浓度的增加同样呈先增加后降低的趋
1.5 AhPRK4 激酶域克隆和原核表达载体构建 势ꎻ且在不同铝浓度处理 8 h 时ꎬAhPRK4 在耐铝性
从 NCBI 上搜索得到 AhPRK4 的基因序列ꎬ运 品种‘99 ̄1507’ 中的响应比敏感性品种‘ ZH2’ 更
用软件 PrimerPremier 5 设计激酶域克隆引物( 表 剧烈ꎮ 综上所述ꎬ这些结果表明 AhPRK4 是铝胁迫
1)ꎮ 以 ‘ ZH2 ’ 根 尖 cDNA 为 模 板ꎬ 克 隆 获 得 响应基因ꎮ
AhPRK4 的 胞 内 激 酶 域ꎬ 参 照 ClonExpressll One 2.2 AhPRK4 的生物信息学分析
Cloning Kit 试剂盒方法连接 AhPRK4 ̄CD 至 pGEX ̄ 2.2.1 AhPRK4 蛋白理化性质、结构特征及亲缘关
6p ̄1 载体(双酶切位点为 EcoR I 和 Xhol)ꎬ热激转 系的分析 分析 AhPRK4( LOC112718333) 的序列
化至 DH5αꎬ将经过测序验证正确的阳性克隆菌株 信息可 知ꎬ该 基 因 CDS ( coding sequence) 全 长 为
提取质粒(AhPRK4 ̄CD ̄pGEX ̄6p ̄1)ꎮ 2 022 bpꎬ编码 673 个氨基酸ꎮ 经预测该蛋白质分
1.6 AhPRK4 蛋白的原核表达和纯化 子量为 74.92 kDꎬ理论等电点为 6.06ꎻ AhPRK4 蛋
将 AhPRK4 ̄CD ̄pGEX ̄6p ̄1 重 组 质 粒 转 化 至 白 N 端具多个亮氨酸重复结构域ꎬC 端具丝氨酸 /
Rosetta 感受态细胞ꎬ37 ℃ 培养至 OD = 0.6 ~ 0.8ꎬ 苏氨酸特异性蛋白激酶结构域ꎬ激酶域含有 ATP
600
加入终浓度为 0.5 mmolL 的异丙基 ̄β ̄D ̄硫代半 结合位点ꎬ并与其他物种 PRK 成员的激酶域具较
 ̄1
乳糖苷( IPTG)ꎬ在 16 ℃ 下诱导 GST ̄AhPRK4 ̄CD 高的同源性( 图 2)ꎻAhPRK4 蛋白含有两个跨膜
蛋白表达ꎬ经 SDS ̄PAGE 电泳检测蛋白的表达情 域ꎬ属于膜功能蛋白ꎮ 因此ꎬAhPRK4 蛋白属于具
况ꎮ 参考 Glutathione Sepharose 4B 填料(GE 公司) 有跨膜域和信号肽的丝氨酸 / 苏氨酸蛋白激酶ꎮ
说明纯化 AhPRK4 ̄CD 重组蛋白ꎬ并进行 Western 进化树构建结果显示 AhPRK4 独立成一个分
Blot 验证ꎮ 支ꎬ与比对的 9 个物种之间有较大的差异ꎻ 拟南芥
1.7 GST ̄AhPRK4 ̄CD 自磷酸化检测 中ꎬAhPRK4 与 AtPRK1 和 AtPRK4 有较高的同源
加 0.5 μg 的 GST ̄AhPRK4 ̄CD 蛋白到 100 μL 性(图 3)ꎮ 进一步查询花生 LRR ̄RLK 家族分类ꎬ
 ̄1
PBS 磷酸缓冲液(含 25 mmolL Tris ̄HClꎬpH 7.5ꎬ AhPRK4 属于 LRR ̄III 蛋白激酶家族( Wang et al.ꎬ
 ̄1  ̄1 2021)ꎮ 经预测 AhPRK4 具可磷酸化的氨基酸位
10 mmolL MgCl ꎬ10 mmolL MnCl ꎬ1 mmol
2 2
L DTTꎬ1×蛋白酶抑制剂和 1 mgmL ATP)中ꎬ以 点ꎬ包括丝氨酸( S) 和苏氨酸( T)ꎮ 因此ꎬAhPRK4
 ̄1
 ̄1
不加 ATP 为对照组ꎬ混合液于 28 ℃下孵育 10 minꎬ 可能与 AtPRK1 和 AtPRK4 具相近的功能ꎬ可能发
并于 100 ℃下孵育 10 min 变性ꎬ后取 30 μL 样品经 生磷酸化ꎮ
12% SDS ̄PAGE 分离ꎬ并转膜依次用兔抗的酪氨酸 2.2.2 AhPRK4 启动子分析和互作蛋白预测 经花
磷酸化抗体(Cell Signaling 公司)、苏氨酸磷酸化抗 生基因组序列提取ꎬ得到 AhPRK4 基因 ATG 前长
体(Cell Signaling 公司)以及鼠抗的 GST 抗体(康为 2 000 bp 的启动子序列ꎮ 分析启动子元件ꎬ结果表
世纪公司) 孵育并化学显色ꎬ根据对照组和处理组 明:AhPRK4 的启动子元件包括生长素响应元件、
条带差异判断磷酸化及激酶活性ꎮ ABA 响应元件、 MeJA 响应元件等激素响应元件ꎬ