Page 174 - 《广西植物》2023年第7期
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１ ３ ４ ２ 广 西 植 物 ４３ 卷
表 ３ 萜类及黄酮化合物生物合成相关转录本 析全长转录组ꎬ获取更完整的转录本信息ꎮ 通过
Ｔａｂｌｅ ３ Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｓ ｒｅｌａｔｅｄ ｔｏ ｔｅｒｐｅｎｏｉｄ 测序共获得 １７ ３１５ ０６６ 条 Ｓｕｂｒｅａｄｓꎬ平均长度为
ａｎｄ ｆｌａｖｏｎｅ ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ
１ ６２０ ｂｐꎬＮ５０ 长度为 １ ５０５ ｂｐꎬ说明全长转录组测
ＫＥＧＧ 代谢通路 序读长较长且连续性较高ꎮ 为获得更准确且可靠
通路编号
Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ 转录本编号
Ｎｏ. ｏｆ 的数 据ꎬ 对 Ｓｕｂｒｅａｄ 进 行 聚 类 及 校 正 后ꎬ 得 到
ｐａｔｈｗａｙ Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ ＩＤｓ
ｐａｔｈｗａｙ
ｏｆ ＫＥＧＧ
８７ ８１４ 条高质量的全 长 转 录 本ꎮ Ｎ５０ 长 度 大 于
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１９７７ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１７３５ １ ０００ ｂｐ(２ ２２１ ｂｐ) 说明其组装完整性较好ꎬ能够
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１７０９ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１６４８
单萜类生物合成 ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１４４０ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１２８１
满足后续转录组信息分析的要求ꎮ
Ｍｏｎｏｔｅｒｐｅｎｏｉｄ Ｋｏ００９０２ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１４６５ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１３５７
通过与 ７ 个公共数据库的比对ꎬ我们获得了大
ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１２３０ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１２６２
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１２２９ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１１３４
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２７５３ 量有用的转录本注释信息ꎬ共有 ２７７ ４５１ 条转录本
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ３１５５ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２８７７ 成功注释到这些数据库中ꎬ其中注释到 ＮＲ、ＫＥＧＧ
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２９８５ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２７９７ 数据库中的转录本数量最多ꎮ ＮＲ 数据库比对结
倍半萜类和三萜 ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２７０６ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２５３６
类生物合成 ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２５４７ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２５１８ 果显示与皱边喉毛花比对率排名前十的物种为咖
Ｓｅｓｑｕｉｔｅｒｐｅｎｏｉｄ Ｋｏ００９０９ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２４９８ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２２８１
啡( Ｃｏｆｆｅａ ｃａｎｅｐｈｏｒａ)、芝麻( Ｓｅｓａｍｕｍ ｉｎｄｉｃｕｍ)、牵
ａｎｄ ｔｒｉｔｅｒｐｅｎｏｉｄ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２２１７ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２２２５
ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２１１２ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２０１３
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１９３０ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１３２０ 牛(Ｉｐｏｍｏｅａ ｎｉｌ)等ꎬ表明皱边喉毛花与这些植物具
有较高同源性ꎮ 然而ꎬ能与皱边喉毛花比对上的
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１７４２ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ３１１５
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２１０７ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２１２０ 同科植物较少ꎬ这反映出公共数据库中龙胆科植
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２０２５ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１７５１
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１６５７ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１７２５ 物的基因组信息十分匮乏ꎮ
类黄酮生物合成 ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１６５２ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１５９７
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１５９４ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１５７１ 藏茵陈基源植物包含丰富的环烯醚萜、黄酮
Ｆｌａｖｏｎｏｉｄ Ｋｏ００９４１
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１５２６ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１３９６
ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ 及三萜类等药用成分(杨青松等ꎬ２０１３)ꎬ本研究从
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１８４５ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１４５８
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１４０９ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１２８７ 对皱边喉毛花全长转录组的分析中检测到与其药
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１２４２ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ９３３
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２１０７ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ２０４３ 用合成相关的 ５５ 条转录本ꎬ包括生物碱、萜类、苯
黄酮和黄酮醇生 丙素类、黄酮类、糖苷类、醌类、聚酮类、有机酸及
物合成 ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１８４２ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１８２１
Ｋｏ００９４４ 酚类等ꎮ 黄酮作为具有多种生物活性的多酚类化
Ｆｌａｖｏｎｅ ａｎｄ ｆｌａｖｏｎｏｌ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１７５９ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ１８４５
ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ
合物ꎬ广泛存在于植物体内ꎬ在人体疾病治疗中起
到显著效果( Ｈｏｓｔｅｔｌｅｒ ｅｔ ａｌ.ꎬ２０１７)ꎮ 萜类化合物
在植物的生长和发育中发挥重要作用ꎬ常应用于
食品、制药和化学工业中(Ｔｈｏｌｌꎬ２０１５)ꎮ 本研究分
析得到多个黄酮类与萜类化合物合成相关的转录
本ꎬ有助于挖掘黄酮类及萜类化合物合成相关的
关键基因ꎬ这为我们今后开展皱边喉毛花关键基
因克隆研究提供基础数据ꎮ
ＳＳＲ 位点广泛分布于真核生物基因组( 张楠
等ꎬ２０１３)ꎮ 本研究 ＳＳＲ 分析结果显示ꎬ单碱基重
复类型最为丰富ꎬ类似情况在其他药用植物中也
有 体 现ꎬ 如 山 莨 菪 ( Ａｎｉｓｏｄｕｓ ｔａｎｇｕｔｉｃｕｓ )、 凤 丹
(Ｐａｅｏｎｉａ ｓｕｆｆｒｕｔｉｃｏｓａ)、罗布麻( Ａｐｏｃｙｎｕｍ ｖｅｎｅｔｕｍ)
图 ６ 皱边喉毛花全长转录组 ＳＳＲ 分析 等( 谢 冬 梅 等ꎬ ２０１７ꎻ 张 雨 等ꎬ ２０２０ꎻ 赵 雪 艳 等ꎬ
Ｆｉｇ. ６ ＳＳＲ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｆｕｌｌ￣ｌｅｎｇｔｈ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ２０２０)ꎮ 除去对单碱基重复的统计ꎬ皱边喉毛花植
ｏｆ Ｃｏｍａｓｔｏｍａ ｐｏｌｙｃｌａｄｕｍ
物中三碱基重复类型最为丰富ꎬ这与药用植物甘
葛 藤 ( Ｐｕｅｒａｒｉａ ｔｈｏｍｓｏｎｉｉ) 和 全 萼 秦 艽 ( Ｇｅｎｔｉａｎａ
解皱边喉毛花药用价值ꎬ我们开展次级代谢产物 ｌｈａｓｓｉｃａ)结果一致ꎬ而在红花这个物种中二碱基重
合成相关基因功能研究ꎮ 利用 ＰａｃＢｉｏ 测序平台解 复最为丰富ꎬ这种差异可能与 ＳＳＲ 位点进化速率
