Page 202 - 《广西植物》2024年第5期
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9 9 0 广 西 植 物 44 卷
(Cluster ̄37780.0)ꎬPP2C ( Cluster ̄35278. 2、Cluster ̄
37953.0)ꎬABF( Cluster ̄37916.2)ꎬB ̄ARR( Cluster ̄
22704. 8 )ꎬ TGA ( Cluster ̄22719. 0 )ꎬ AHK ( Cluster ̄
28287.0) 进行 qRT ̄PCR 验证( 图 13:A)ꎮ 结果表
明ꎬ上述酶基因在 BLG ̄CK2 vs BLG ̄S2、BLG ̄CK3
vs BLG ̄S3、BLG ̄CK4 vs BLG ̄S4 中的表达趋势与
RNA ̄seq 结果一致(P<0.05)(图 13:B)ꎬ证明测序
结果真实可靠ꎮ
3 讨论与结论
3.1 根肿菌侵染对菘蓝根部的影响
图 8 菘蓝转录组 Unigene 长度分布图 Wei 等(2021) 研究表明ꎬ感染根肿菌的植株
Fig. 8 Length distribution of Unigene in 其根部会不断膨大ꎬ直至变成大小形状不一的肿
transcriptome of Isatis indigotica 瘤ꎬ 并且根部细胞会因为次级游动孢子的入侵而
表 4 差异表达基因数及功能注释
Table 4 Function annotation and number of differentially expressed genes
比对组
Contrast group
分类 功能注释 总数
Classification Function annotation Total
BLG ̄CK2 vs BLG ̄CK3 vs BLG ̄CK4 vs BLG ̄S2 vs BLG ̄S2 vs BLG ̄S3 vs
BLG ̄S2 BLG ̄S3 BLG ̄S4 BLG ̄S3 BLG ̄S4 BLG ̄S4
细胞组成 细胞解剖实体 16 973 1 871 181 3 821 1 845 5 584 3 671
Cellular Cellular anatomical
component entity
包含蛋白复合物 3 488 168 18 1 042 131 1 137 992
Protein ̄containing
complex
生物过程 细胞过程 13 688 1 415 140 3 244 1 338 4 463 3 088
Biological Cellular process
process
代谢过程 10 692 1 107 105 2 561 1 034 3 482 2 403
Metabolic process
刺激响应 6 495 852 93 1 301 850 2 139 1 260
Response to
stimulus
生物调节 5 621 693 63 1 169 694 1 856 1 146
Biological regulation
生物过程的调节 5 054 629 57 1 046 628 1 672 1 022
Regulation of
biological process
分子功能 结合 11 912 1 300 121 2 703 1 237 3 931 2 620
Molecular Binding
function
催化活性 10 329 1 113 166 2 315 1 121 3 395 2 219
Catalytic activity
转运体活性 1 348 163 23 265 172 463 262
Transporter activity
转录调节活性 1 058 187 14 160 173 370 154
Transcription
regulator activity