Page 202 - 《广西植物》2024年第5期
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9 9 0                                  广  西  植  物                                         44 卷
                                                               (Cluster ̄37780.0)ꎬPP2C ( Cluster ̄35278. 2、Cluster ̄
                                                               37953.0)ꎬABF( Cluster ̄37916.2)ꎬB ̄ARR( Cluster ̄
                                                               22704. 8 )ꎬ TGA ( Cluster ̄22719. 0 )ꎬ AHK ( Cluster ̄
                                                               28287.0) 进行 qRT ̄PCR 验证( 图 13:A)ꎮ 结果表

                                                               明ꎬ上述酶基因在 BLG ̄CK2 vs BLG ̄S2、BLG ̄CK3
                                                               vs BLG ̄S3、BLG ̄CK4 vs BLG ̄S4 中的表达趋势与
                                                               RNA ̄seq 结果一致(P<0.05)(图 13:B)ꎬ证明测序

                                                               结果真实可靠ꎮ

                                                               3  讨论与结论


                                                               3.1 根肿菌侵染对菘蓝根部的影响

                  图 8  菘蓝转录组 Unigene 长度分布图                         Wei 等(2021) 研究表明ꎬ感染根肿菌的植株
                   Fig. 8  Length distribution of Unigene in   其根部会不断膨大ꎬ直至变成大小形状不一的肿
                       transcriptome of Isatis indigotica      瘤ꎬ 并且根部细胞会因为次级游动孢子的入侵而


                                             表 4  差异表达基因数及功能注释
                              Table 4  Function annotation and number of differentially expressed genes

                                                                            比对组
                                                                          Contrast group
                 分类          功能注释         总数
              Classification  Function annotation  Total
                                                 BLG ̄CK2 vs  BLG ̄CK3 vs  BLG ̄CK4 vs  BLG ̄S2 vs  BLG ̄S2 vs  BLG ̄S3 vs
                                                  BLG ̄S2    BLG ̄S3    BLG ̄S4     BLG ̄S3    BLG ̄S4    BLG ̄S4
               细胞组成        细胞解剖实体        16 973    1 871      181      3 821     1 845     5 584      3 671
                Cellular  Cellular anatomical
               component      entity
                          包含蛋白复合物        3 488     168        18       1 042      131      1 137      992
                          Protein ̄containing
                             complex
               生物过程          细胞过程        13 688    1 415      140      3 244     1 338     4 463      3 088
               Biological  Cellular process
                process
                             代谢过程        10 692    1 107      105      2 561     1 034     3 482      2 403
                          Metabolic process
                             刺激响应        6 495     852        93       1 301      850      2 139      1 260
                            Response to
                             stimulus
                             生物调节        5 621     693        63       1 169      694      1 856      1 146
                         Biological regulation
                          生物过程的调节        5 054     629        57       1 046      628      1 672      1 022
                            Regulation of
                          biological process
               分子功能           结合         11 912    1 300      121      2 703     1 237     3 931      2 620
               Molecular     Binding
                function
                             催化活性        10 329    1 113      166      2 315     1 121     3 395      2 219
                           Catalytic activity
                            转运体活性        1 348     163        23        265       172       463       262
                          Transporter activity
                           转录调节活性        1 058     187        14        160       173       370       154
                            Transcription
                           regulator activity
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